Los más probables son: El 680 se da inicio a la historia conocida de Baviera con Teodón II: Los reyes carolingios de los francos asumieron el control del territorio.
En 864, otorgó el control de Baviera (como subregulus) a su hijo Carlomán, y murió en 876.
En este periodo, los reyes de Francia Oriental (Germania) transfirieron el territorio bávaro a diferentes manos, incluyéndose los propios reyes, no permitiendo la sucesión de linajes familiares.
A la muerte del duque Bertoldo, el rey Otón I otorgó el ducado a su hermano Enrique (que a su vez era yerno del duque Arnulfo) En 1070, el rey Enrique IV depuso al duque Otón, invistiendo el ducado a Güelfo I, de la rama más antigua de la Casa de Este (dinastía güelfa).
En 1329, el emperador y duque Luis IV renunció al Palatinado y un trozo de Baviera, que pasó a denominarse Alto Palatinado (Oberpfalz), a los hijos de Rodolfo I, que formarían la Rama Palatinata de la familia Wittelsbach.