Tras su muerte, Tirol fue anexado a las tierras austriacas de la dinastía Habsburgo.

Se reunió con Enrique de Carintia, su antiguo cuñado y a quien había derrotado en la lucha por el trono bohemio en 1310, y selló el compromiso de su hijo menor, Juan Enrique, hermano del futuro emperador Carlos IV, con Margarita en 1327.

Sin embargo, cuando Tirol fue reclamado por los Wittelsbach bávaros, ella se alió con la Casa de Luxemburgo.

Su competente cuñado Carlos, respaldado por la nobleza local, aseguró la sucesión de Margarita como condesa.

El joven Juan Enrique resultó ser un cogobernante altivo e incompetente, así como un derrochador que no era respetado por la aristocracia tirolesa.

Su hermano, Carlos, actuó temporalmente como regente; sin embargo, sus esfuerzos de mediación fueron rechazados y en 1336/1337 abandonó Tirol para acompañar a su padre en las cruzadas prusianas.

Esteban, aliado con Bernabé Visconti, re-unió Landshut con Baviera y también reclamó Tirol.

Otra vez amenazada con perder su patrimonio, Margarita finalmente se vio obligada a cederle el condado de Tirol al cuñado de su hijo fallecido, el duque (y "archiduque" autoproclamado) Rodolfo IV de Austria, que lo anexó a sus dominios austriacos.

En la disputa por su divorcio y segundas nupcias, Margarita recibió el apodo Maultasch (literalmente "boca de bolsa", cf.

Maultasche, que significa "prostituta" o "mujer despiadada") en la propaganda eclesiástica contemporánea.