Su delimitación territorial coincide con la del partido judicial homónimo.
[1] La merindad se extiende desde las sierras de Urbasa y Andía hasta las Riberas del Ebro y del bajo Ega pasando por Tierra Estella propiamente dicha.
El río Ega la recorre de oeste a este hasta la ciudad de Estella y desde allí de norte a sur hasta alcanzar el Ebro al sur de San Adrián, aquel y sus afluentes drenan la mayor parte del territorio; otros ríos y barrancos, menos importantes, van directamente al Ebro, y solo el nordeste pertenece a la cuenca hidrográfica del Arga.
En todas abundan las calizas cretácicas o eocénicas, y por eso ofrecen un importante modelado cárstico, tanto más cuanto más al norte.
Otros elementos de importancia morfológica son los diapiros* que originan las cubetas intramontañosas de Estella, Alloz y Salinas de Oro, y los montes de aluviones que jalonan las orillas del Ega y la margen izquierda del Ebro.