[13] Fuenzalida llegó a las divisiones inferiores de Universidad Católica en 1996, subiendo al primer equipo en el año 2004.
[16] La fecha próximo anotó nuevamente, esta vez en el triunfo por 3-2 frente a Deportes Temuco.
[17] Su buena racha goleadora continuó la siguiente semana, donde volvería a marcar durante el triunfo de visitante por 3-1 sobre Santiago Wanderers.
[18] Tras quedar en el primer lugar del Grupo D con 32 puntos, lograron acceder a los Play-Offs, pero fueron eliminados en semifinales por Unión Española tras perder en los penales por 4-3 (habían empatado en un marcador global de 4-4).
En el ámbito internacional, Los Cruzados participaron en la Copa Libertadores 2006, pero no lograron superar la Fase de grupos.
Fuenzalida disputó los 6 partidos en la copa y anotó frente a Tigres en la victoria por 3-2 el 8 de febrero.
Colo-Colo quedó ubicado en el primer lugar del Grupo C con 27 puntos, logrando la clasificación a los Play-Offs.
[34] Tras cumplir una buena campaña, O'Higgins se clasificó a los Play-Offs tras quedar en el segundo lugar del Grupo 3 con 28 puntos.
[47] Su reestreno con la camiseta alba ocurrió el 31 de enero en la victoria por 3-1 sobre Cobreloa válida por la segunda fecha del torneo, siendo substituido a los 61 minutos por Charles Aránguiz.
[50] En agosto disputaron la Copa Sudamericana 2010, teniendo que enfrentar en primera fase a Universitario de Sucre.
El equipo disputó en ese semestre la Copa Libertadores 2011, pero no lograron superar la fase de grupos, jugando Fuenzalida 4 partidos.
[59] Fuenzalida fue uno de los jugadores con más presencias en el torneo, jugando 20 partidos y anotando 4 goles.
Durante el año 2013, "Chapita" tuvo mayor protagonismo dentro del equipo a pesar de las irregulares campañas.
[75] Colo-Colo terminó en el octavo lugar del Campeonato y Fuenzalida disputó todos los partidos, anotando 3 goles.
El 13 de abril, Fuenzalida fue titular en la victoria por 1-0 sobre Santiago Wanderers, con la cual, Colo-Colo consiguió salir campeón del torneo, bajando su estrella número 30.
[86] Boca Juniors finalmente se coronó campeón de esa edición derrotando a Rosario Central.
[91] El 16 de diciembre de 2015, se confirmó que Fuenzalida no renovaría contrato con Boca Juniors,[92] llegando a tener un pre acuerdo con Newell's Old Boys para ser su nueva incorporación para 2016, sin embargo, dicho traspaso no se concreto.
[128] Fuenzalida por la segunda rueda marcó solo en el triunfo 5 a 3 ante Deportes Antofagasta donde se anotó con un doblete.
[139] Pese a ser su temporada con menos anotaciones, se convirtió en el máximo asistidor del torneo con 10 habilitaciones.
Fuenzalida fue nominado nuevamente en febrero de 2012 para el amistoso frente a Paraguay, siendo titular en la derrota por 2-0.
Sampaoli le convocó para los partidos amistosos en enero de 2013 frente a Senegal y Haití.
El 15 de enero se jugaba la Final de la China Cup ante Islandia, Chapita también fue titular y tuvo un bajo partido, salió reemplazado al 79' por Junior Fernandes, finalmente La Roja ganó por 1-0 y se proclamó campeón en continente asiático.
[172] Jugó los 2 partidos de la China Cup 2017, estuvo 149 minutos en cancha y tuvo una baja actuación.
[175] El 14 de junio por la última fecha del Grupo D, Fuenzalida debuta como titular (como extremo derecho) ante Panamá triunfo de la Roja por 4-2 y Fuenzalida asistió a Alexis Sánchez para que marcarse el 4-2 final.
Chile debutaría frente a Japón donde Fuenzalida fue titular hasta el minuto 80 donde fue reemplazado por Óscar Opazo y jugó de manera destacable.
Ante Uruguay no jugó donde jugadores como Óscar Opazo y Pedro Pablo Hernández tuvieron su oportunidad.
En cuartos de final, Chile se enfrentó a Colombia donde Fuenzalida fue sustituido por Esteban Pavez en el minuto 74.
En semifinales se enfrentó a Perú donde nuevamente tuvo un bajo nivel, sumado al pésimo nivel del resto del equipo, y Chile cayó 3-0 quedando eliminado sin chances de clasificar a la final.
Fuenzalida en total jugó 4 partidos (259 minutos), anotó 1 gol y fue de más a menos en la copa.
El 10 de octubre, Chile cayó por 3-0 ante Brasil en Sao Paulo y quedó eliminado de Rusia 2018, en ese partido Fuenzalida actuó como volante central en lugar del suspendido Arturo Vidal y salió al 62' por Edson Puch.