La Copa Chile 2019 mantiene el sistema de eliminación directa, con llaves que se juegan a 2 partidos (ida y vuelta).
En caso de que el equipo Campeón ya esté clasificado a la Copa Libertadores por medio del Campeonato AFP PlanVital Primera División 2019, este cederá su cupo internacional al Subcampeón.
Del mismo modo, si este también llegara a estar clasificado a la Copa Libertadores por el mismo método, este cederá su cupo al 4.° lugar del torneo de Primera División, ocurriendo el mecanismo de sucesión que le permite al 8.° lugar de la tabla disputar la Copa Sudamericana.
El equipo que se corone campeón del certamen, clasificará como Chile 4 a la Copa Conmebol Libertadores 2020.
Si un equipo que milita en la Primera B se corona campeón de este torneo, clasificará como Chile 4 a la Copa Conmebol Libertadores 2020, sin importar que no esté jugando ese mismo año en la Primera División.