Esa misma temporada, en calidad de campeón Provincial, el elenco se alzó con la Copa Francisco Candelori tras vencer al campeón Metropolitano Unión Española por un marcador global de 1-0,[10]​ pasando a ser el primer y único título del equipo lila en Primera División.

En las giras europeas enfrentó a rivales de la talla del Real Zaragoza y el Rayo Vallecano.

La excelente trayectoria durante el año otorgó a Deportes Concepción la calidad de subcampeón del certamen.

El experimento no cumple con las expectativas y Oyarzún dejó la dirección técnica, pero quedó como una recordada experiencia.

Sin embargo, y ocupando el 14° lugar entre 16 equipos participantes, Deportes Concepción desciende a la Segunda División de Chile por primera vez en 1981.

Difíciles temporadas teniendo presente la crisis económica nacional y la deficiente administración interna, factores que afectaron severamente al club, llevándolo a un nivel de endeudamiento que marcaría su futuro y gatillaría el cambio institucional desde su forma inicial como Club Social a una Corporación de Fútbol, en 1984.

La liguilla se disputó íntegramente en Santiago, y el equipo fue dirigido en la ocasión por Luis Vera, que había reemplazado al renunciado Fernando Cavalleri.

Un nuevo descenso se produce en 1993, tras la peor campaña en la historia del club, con apenas 3 partidos ganados en los 30 disputados en la temporada, y rematando último entre 16 equipos.

El campeonato se consiguió en la penúltima jornada del torneo, gracias a una goleada 5-0 sobre Unión San Felipe.

Con sueldos impagos, los jugadores lilas al mando de Oscar Garré lograron pese a todo clasificar a la Liguilla Pre-Libertadores 2000, donde además de jugarse la clasificación, se jugaban el futuro inmediato del club, amenazado por el receso y la quiebra.

Los lilas eliminan por 1-0 a Audax Italiano con gol de oro en tiempo extra y luego disputan una recordada final con la Universidad Católica.

Concepción ganaba 2-0 hasta los 30 minutos del segundo tiempo, con dos goles de Mauricio Pozo, cuando los cruzados logran empatar el partido.

En la primera ronda, tras un dubitativo inicio que detonó la salida temprana del técnico Sergio Nichiporuk y el segundo retorno de Fernando Cavalleri, los morados empatan como locales ante Nacional (0-0) y logran derrotar al campeón argentino San Lorenzo de Almagro (3-2), entonces dirigido por el chileno Manuel Pellegrini, en un vibrante partido que terminaría con incidentes.

[18]​[19]​ El acuerdo consideró la venta del 90 por ciento de la institución al grupo económico, durante los próximos 30 años, renovables por un período similar.

Solo un amistoso gestionado con Iván Zamorano en formato fútbol sala[44]​ jugado en el Gimnasio Municipal de Concepción, permitió dejar alguna ganancia para saldar las deudas del club.

Destacaron en esta campaña el arquero Luis de Agustini, Alexis Salazar y Patricio Almendra.

En este escenario, Concepción juega como local en siete estadios, durante 52 partidos y en un período que duró 910 días, mayoritariamente en el Estadio Municipal de Hualpén, cancha utilizada por equipos amateur y que debió ser acondicionada para su uso en el fútbol profesional.

Tres votos fueron a favor de la permanencia: el propio Deportes Concepción, Cobreloa y Santiago Morning.

Tras empatar en el duelo de ida con Deportivo Pilmahue en Villarrica, Los Lilas pierden por la mínima en Concepción, quedando subcampeones del torneo.

El 24 de marzo Deportes Concepción vuelve al profesionalismo y se enfrenta a Santiago Wanderers en partido válido por la Fase 1 de la Copa Chile, teniendo, como resultado final, una dolorosa goleada por 4-1, por parte del elenco caturro, poniéndole fin a su participación en el torneo.

En la Segunda Fase se volverían a ver las caras contra Santiago Wanderers equipo al cual le ganaron en la ida 0-1[79]​ y empatarían de local en la vuelta 1-1,[80]​ con un marcador global 2-1.

Durante la primera rueda, los lilas lograron un rendimiento destacado, ubicándose en la tercera posición con un registro de 5 victorias, 4 empates y 2 derrotas.

No obstante, en la segunda rueda el equipo sufrió una notable caída en su desempeño, consiguiendo solo 1 victoria, 1 empate y 7 derrotas.

Este triunfo en la última jornada permitió al equipo asegurar la permanencia en la categoría, finalizando en la 10.ª posición con 26 puntos.

Durante la primera rueda, tres entrenadores pasaron por el banquillo: César Bustamante, Claudio Rojas y Nicolás Fernández (como interino).

Para la segunda rueda, Christian Lovrincevich asumió la dirección técnica, logrando un cambio significativo en el desempeño del equipo.

[84]​ De cara a la temporada 2024, el club realizó varios fichajes destacados, entre ellos Fabián Núñez, Sebastián Silva, Brayan Valdivia, Ignacio Mesías, Joaquín Araya y Fabrizio Manzo.

[86]​ Para la segunda rueda, Manuel Suárez asumió la dirección técnica y bajo su gestión, el equipo mostró una notable mejoría.

Salvo variaciones en la tonalidad a lo largo de los años y cambios en los diseños (que han incorporado vivos blancos, rojos e incluso amarillos según el auspiciador y la temporada), el color de la camiseta se ha mantenido constante desde la fundación del equipo.

El Estadio Municipal Alcaldesa Ester Roa Rebolledo, se ubica en la ciudad de Concepción, Chile, popularmente conocido como Collao.