La Copa Chile 2021 siguió con el sistema de eliminación directa, con llaves que se jugaron a 2 partidos (ida y vuelta).Los 15 clubes clasificados se emparejarán para conformar las 8 llaves; en esta fase ingresa a la competencia Colo-Colo por ser el campeón defensor.Los equipos que tengan un número mayor respecto a su rival, serán quienes sean los locales en el partido de vuelta.Los 8 clubes clasificados se enfrentarán en partidos de ida y vuelta, y según su numeración se determinará quién será local en el primer partido de la fase.Nota: En las series a dos partidos, el equipo con el mayor número adquirido por sorteo, define como local.Nota: En las series a dos partidos, el equipo con el mayor número adquirido por sorteo, define como local.