A la muerte de Alfonso VI, lo sucedió su hermano Pedro II de Portugal, quien reinó desde 1683 hasta 1706 siendo sucedido a su vez por su hijo Juan V de Portugal, que reinó desde 1706 hasta 1750.
Cuando la invasión napoleónica llegó a Portugal, Juan VI de Portugal (hijo de Doña María I y Don Pedro III) se retiró a Brasil, de donde regresó en el año 1821.
Sin embargo María II fue derrocada en 1828 por su tío Miguel I y no recuperaría el trono hasta 1834, cuando Miguel I fue obligado a abdicar.
María II posteriormente contraería matrimonio con el noble alemán Fernando de Sajonia-Coburgo-Gotha, quién reinó con el nombre de Fernando II.
Le sucedió a su vez su hijo Carlos I de Portugal, que reinó desde 1889 hasta que murió asesinado junto a su heredero Luis Felipe de Braganza en 1908 durante el regicidio de Lisboa.