Se educó en la música por Davide Perez (compuso la ópera Alessandro nela Indie) y en la pintura por Domingos Sequeira:[1]​ un panel compuesto por ella y su hermana aún se pueden ver en la Basílica de la Estrella.

[1]​ María Benedicta y José no tuvieron hijos, sin embargo ella tuvo dos abortos naturales: en primer lugar en 1781 y en segundo lugar en 1786.

Tres días después de su boda, el padre de Benedicta, el rey José, murió y María le sucedió como reina.

En contraste con otras viudas, que fundaron conventos e iglesias, ella eligió fundar el Hospital Militar el 25 de julio de 1827 que luego se convertiría en el Asilo de Inválidos Militares de Runa.

Fue la última nieta superviviente del rey Juan V de Portugal.