El 25 de enero fue designado como su primer titular el ingeniero Eduardo López de Romaña, que luego sería Presidente del Perú.
Posteriormente fue trasladado al local donde hoy se levanta el Palacio Municipal.
En 1910 se dispuso su traslado permanente al Palacio de la Exposición, donde compartía las instalaciones con el Concejo Municipal de Lima; con el tiempo este local resultó insuficiente y el ministerio se albergó en un edificio ubicado en la avenida 28 de Julio.
La fundación de este Ministerio constituyó un hito en la reestructuración del estado peruano, post guerra del Pacífico.
A lo largo del siglo XX, este Ministerio fue disgregándose en otros: Trabajo, Salud, Agricultura, Pesquería, Industria y Turismo, Minería, Transportes y Comunicaciones, Vivienda y Construcción, etc.[4]