Como empresario fundó la Negociación Fermín Málaga Santolalla e Hijos, que inició la explotación del tungsteno en los departamentos de La Libertad y Pasco; en su época fue conocido como el Rey del Tungsteno.

en la mina Santa Lucía en Hualgayoc, así como en la planta de lixiviación "La Tahona" en la misma provincia.

[1]​[2]​[3]​ En la Mina Perpetuo Socorro descubrió una boya de rosicler que entonces produjo abundantes beneficios.

Permaneció allí hasta 1903, separándose del negocio al ser elegido ese año diputado nacional.

Este negocio le produjo grandes utilidades y fue conocido como el “Rey del Tungsteno”.

[1]​ En 1910, se pronunció contra las obras del ferrocarril que uniría Lima con Huacho.

Gracias a su aporte, los representantes del gobierno modificaron el contrato con la empresa North Western Railway of Peru Limited.

[11]​[12]​[13]​ Derrocado Billinghurst en 1914, Málaga, junto con otros parlamentarios del grupo de Augusto Leguía, sostuvo los derechos del primer vicepresidente Roberto Leguía, hermano de dicho caudillo.

Pero consolidado en el poder el general Óscar R. Benavides, Málaga y todo su grupo parlamentario optaron por apoyar al nuevo mandatario.

Su hija Clorinda Málaga llegó a ser la segunda esposa del presidente Manuel Prado Ugarteche.