La visión cristocéntrica del mundo y el trabajo benevolente de su madre dieron forma a toda su vida futura.
Antes de su matrimonio, ya había madurado hasta convertirse en una mujer muy educada, que también enriqueció su conocimiento leyendo en inglés y francés.
La ceremonia ecuménica, por entonces inusual, tuvo lugar en Burgschloss, dirigida por el obispo católico Johann Baptist von Keller (1774-1845), y el capellán ducal evangélico luterano, el prelado August Heinrich d'Autel (1779-1835).
El matrimonio produjo cinco hijos: Las dos primeras esposas del archiduque José Antonio fueron, primero la gran duquesa rusa Alejandra Pávlovna, y luego la princesa Herminia de Anhalt-Bernburg-Schaumburg-Hoym; ambas habían muerto durante el parto.
El archiduque encontró en María Dorotea, prima de su segunda esposa, una madrastra que cuidara a los hijos de ésta, y ella misma dio a luz otros cinco hijos.
Como agradecimiento, la comunidad de Bratislava le ofreció en la iglesia un magnífico asiento honorario.
María Dorotea también se interesó en la literatura hebrea y creía en el regreso de los judíos a Tierra Santa.
Durante un servicio, escuchó predicar al joven y educado pastor Georg Bauhofer.
María Dorotea estaba tan entusiasmada con el sermón que le envió un espléndido libro de regalo.
Se construyó en estilo Imperio y fue utilizado por la pequeña comunidad protestante inicialmente alemana de Budapest durante 50 años.
En 1819, la archiduquesa María Dorotea introdujo el árbol de Navidad en Hungría, que durante mucho tiempo llevó el nombre Dorotheenbaum.
20: 6): "Muchos hombres se jactan de su bondad; pero, ¿quién encuentra uno que sea confiable?".
Gracias al compromiso del antropólogo húngaro István Kiszely, los huesos dispersos se pudieron volver a juntar y enterrar debidamente.