familia de proteínas
Los receptores similares a la rodopsina son una familia de proteínas que comprenden el grupo más grande de receptores acoplados a proteína G. [2]
Alcance
Los receptores acoplados a proteína G, GPCR, constituyen una amplia familia de proteínas que abarca una amplia gama de funciones (incluidos varios procesos autocrinos, paracrinos y endocrinos). Muestran una diversidad considerable a nivel de secuencia, sobre la base de la cual se pueden separar en grupos distintos. Los GPCR generalmente se describen como "superfamilia" porque abarcan un grupo de familias para las cuales hay indicios de relación evolutiva, pero entre las cuales no existe una similitud estadísticamente significativa en la secuencia. [2] Los miembros de la superfamilia actualmente conocidos incluyen los GPCR similares a la rodopsina (esta familia), los GPCR similares a la secretina , los receptores de AMPc , los receptores de feromonas de apareamiento de hongos y la familia de receptores metabotrópicos de glutamato . Existe una base de datos especializada para GPCR . [3]
Función
Los propios GPCR similares a la rodopsina representan una familia de proteínas muy extendida que incluye hormonas, neuropéptidos, neurotransmisores y receptores de luz, todos los cuales transducen señales extracelulares mediante la interacción con proteínas de unión a nucleótidos (G) de guanina. Aunque sus ligandos activadores varían ampliamente en estructura y carácter, las secuencias de aminoácidos de los receptores son muy similares y se cree que adoptan un marco estructural común que comprende siete hélices transmembrana (TM). [4] [5] [6]
Clases
Los GPCR similares a la rodopsina se han clasificado en los siguientes 19 subgrupos (A1-A19) según un análisis filogenético. [7]
Subfamilia A1
Subfamilia A2
Subfamilia A3
Subfamilia A4
Subfamilia A5
Subfamilia A6
Subfamilia A7
Subfamilia A8
Subfamilia A9
Subfamilia A10
Subfamilia A11
Subfamilia A12
Subfamilia A13
Subfamilia A14
Subfamilia A15
Subfamilia A16
- Opsins InterPro : IPR001760 [8]
- Rodopsina ( RHO , OPSD)
- Opsina 1 (pigmentos de cono), sensible a ondas cortas (daltonismo, tritan) ( OPN1SW , OPSB) (opsina sensible al azul)
- Opsina 1 (pigmentos de cono), sensible a la onda media (daltonismo, deutan) ( OPN1MW , OPSG) (opsina sensible al verde)
- Opsina 1 (pigmentos de cono), sensible a ondas largas (daltonismo, protan) ( OPN1LW , OPSR) (opsina sensible al rojo)
- Opsina 3, Panopsina ( OPN3 )
- Opsina 4, Melanopsina ( OPN4 )
- Opsina 5 ( OPN5 , GPR136)
- Receptor acoplado a proteína G de la retina ( RGR )
- Homólogo de rodopsina derivado del epitelio pigmentario de la retina ( RRH , OPSX) (opsina del receptor similar a un pigmento visual) InterPro : IPR001793
Subfamilia A17
Subfamilia A18
Subfamilia A19
Desclasificado
Referencias
- ^ Palczewski K, Kumasaka T, Hori T y col. (Agosto de 2000). "Estructura cristalina de rodopsina: receptor acoplado a proteína AG". Ciencia . 289 (5480): 739–45. Código Bib : 2000 Ciencia... 289..739P. doi : 10.1126/ciencia.289.5480.739. PMID 10926528.
- ^ ab Attwood TK, Findlay JB (1994). "Toma de huellas dactilares de receptores acoplados a proteína G". Ing. Proteínas . 7 (2): 195–203. doi : 10.1093/proteína/7.2.195. PMID 8170923.
- ^ "Sistema de información para receptores acoplados a proteína G". GPCRDB . www.gpcr.org. Archivado desde el original el 22 de abril de 2009 . Consultado el 5 de diciembre de 2008 .
- ^ Birnbaumer L (1990). "Proteínas G en transducción de señales". Año. Rev. Farmacol. Toxicol . 30 : 675–705. doi : 10.1146/annurev.pa.30.040190.003331. PMID 2111655.
- ^ Gilman AG, Casey PJ (1988). "Implicación de la proteína G en el acoplamiento receptor-efector". J. Biol. química . 263 (6): 2577–2580. doi : 10.1016/S0021-9258(18)69103-3 . PMID 2830256.
- ^ Attwood TK, Findlay JB (1993). "Diseño de una huella dactilar discriminante para receptores acoplados a proteína G". Ing. Proteínas . 6 (2): 167–176. doi : 10.1093/proteína/6.2.167. PMID 8386361.
- ^ Joost P, Methner A (2002). "Análisis filogenético de 277 receptores acoplados a proteína G humana como herramienta para la predicción de ligandos de receptores huérfanos". Genoma Biol . 3 (11): investigación 0063.1–0063.16. doi : 10.1186/gb-2002-3-11-research0063 . PMC 133447 . PMID 12429062.
- ^ Terakita A (2005). "Las opsinas". Genoma Biol . 6 (3): 213. doi : 10.1186/gb-2005-6-3-213 . PMC 1088937 . PMID 15774036.
- ^ ab Nordström KJ, Sällman Almén M, Edstam MM, Fredriksson R, Schiöth HB (septiembre de 2011). "Los análisis independientes de HHsearch, Needleman, basados en Wunsch y de motivos revelan la jerarquía general para la mayoría de las familias de receptores acoplados a proteína G". Biología Molecular y Evolución . 28 (9): 2471–80. doi : 10.1093/molbev/msr061 . PMID 21402729.
enlaces externos
- Vriend G, Horn F, Oliveira L, Bywater RP, Cohen FE. "GPCRDB (base de datos de receptores acoplados a proteína G): datos derivados de secuencias". Archivado desde el original el 14 de noviembre de 2007 . Consultado el 10 de diciembre de 2007 .
- Horn F, Bettler E, Oliveira L, Campagne F, Cohen FE, Vriend G (2003). "Sistema de información GPCRDB para receptores acoplados a proteína G". Ácidos nucleicos Res . 31 (1): 294–7. doi :10.1093/nar/gkg103. PMC 165550 . PMID 12520006. Esta base de datos incluye múltiples alineamientos de secuencias de todas las familias y subfamilias de GPCR.
