Fue presunta heredera al trono del Sacro Imperio Romano Germánico desde 1711 hasta 1719.Tras el nacimiento de su hermana menor, no tuvieron más hijos, posiblemente debido a la sífilis que su madre contrajo por su marido.La archiduquesa recibió una educación adecuada y fue criada estrictamente católica por su abuela paterna, Leonor Magdalena del Palatinado-Neoburgo.Las fiestas y los eventos de ópera formaron parte del escenario en Dresde.Ofreció un relicario y una hermosa cruz renacentista a los Padres Paulinos de Jasna Góra.Su vida matrimonial fue ejemplar, siendo descrita como feliz, especialmente porque su esposo, a diferencia de su padre, no tenía relaciones con otras mujeres.Sin embargo, nació con una discapacidad, y María Josefa se culpó a sí misma por participar en un viaje de caza durante el embarazo y caer de un caballo en el proceso.Fue solo cuando Wylich le reveló que si su amo le ordenaba usar la fuerza si era necesario, se veía obligada a entregar las llaves de las habitaciones en las que se guardaban los papeles en cuestión.Federico el Grande hizo vigilar a María Josefa de cerca.Su sarcófago descansa específicamente en la "Cripta de los Fundadores", junto a su marido, que la sobrevivió casi seis años.
