Fernando recibió una educación estricta jesuita que culmina en sus años en la Universidad de Ingolstadt.La situación empeoró cuando Fernando II fue coronado en 1618 como rey húngaro y también intentó erradicar al protestantismo en los territorios del Reino de Hungría.El protestantismo era en extremo popular en Transilvania, así que si bien las medidas de Rodolfo II no los afectaban directamente, se sintieron agraviados por los húngaros protestantes que vivían en los dominios del rey Habsburgo.Usando como excusa la guerra religiosa, el Príncipe húngaro Gabriel Bethlen de Transilvania entró en guerra directa con Fernando II, uniéndose a los conflictos que habían estallado en otras partes de Bohemia.Tal y como se había acordado con anterioridad, Fernando le sucedió en el trono.El ahora depuesto Federico huyó a los Países Bajos, y el duque Maximiliano I de Baviera, líder de la Liga Católica, procedió a tomar y confiscar sus tierras en el Palatinado (margen derecha del Rin) a repartir con España (que se quedó con las tierras de la margen izquierda del Rin).Su solución fue encargar al militar bohemio Albrecht von Wallenstein que crease y dirigiese un ejército imperial.En noviembre se produjo la gran Batalla de Lützen, en la que los católicos fueron derrotados, pero el rey Gustavo Adolfo murió.La fuerza sueca se vio muy debilitada, pero Francia entró en la guerra en el lado protestante temiendo la dominación de los Austrias en Europa.Por ello, a pesar de que se firmase el tratado, la paz no cuajó.
