Después de la deposición del duque sajón Enrique el León las temporalidades episcopales y capitulares (Stift) del Obispado de Halberstadt evolucionaron en un Estado imperial, el Obispado Principesco (Hochstift).
Para eludir las penalidades de la excomunión Conrado se unió a la catastrófica Cuarta Cruzada.
En 1475 la abadesa logró, no sin protestas del obispo, que el emperador le cediese ese derecho sobre la ciudad.
En 1477 se desató finalmente un conflicto armado, al ser invadida Quedlinburgo por los sajones.
La ciudad perdió su autonomía frente a la abadesa y tuvo que pagar reparaciones anuales.
Cabe observar que tal acumulación de cargos era en principio contraria a las costumbres y al Derecho canónico.
Para 1549, las ciudades, pueblos y caballeros de la diócesis se habían convertido a la confesión luterana.
Sólo el Capítulo de la Catedral, los monasterios y el territorio del Principado eclesiástico seguían siendo católicos.
Su elección fue confirmada por el papa Julio III, aunque se sabía de su confesión luterana, se tenía esperanzas que el cisma llegara a su fin, aunque siendo luterano Sigismund permaneció célibe[2] In 1567 the remainder of the cathedral chapter converted to Lutheranism.
Sus políticas moderadas le valieron ser elegido también administrador del Obispado de Minden en 1582, cargo al que renunció en 1585.
Debido a la compleja situación se mantuvo hasta 1648 una biconfesionalidad en el obispado, con una coexistencia inicial más o menos pacífica entre católicos y luteranos.
En el aspecto eclesiástico la diócesis, con sede vacante desde 1480, desde entonces representada solo por administradores, quienes incluso fueron protestantes entre 1552 y 1628, dejó de existir en 1648 también.
La ciudad de Brunswick, situada a ambas márgenes del Oker, originalmente estaba dividida entre Halberstadt y Hildesheim hasta que pasó a manos del Duque Enrique el León en 1142, quien hizo de ella su residencia.