El Gran Premio de la República Checa de Motociclismo de 2006 (oficialmente Gauloises Grand Prix České Republiky) fue la duodécima prueba del Campeonato del Mundo de Motociclismo de 2006.
Tuvo lugar en el fin de semana del 18 al 20 de agosto de 2006 en el Autódromo de Brno, situado en Brno, Moravia, República Checa.
La carrera de MotoGP fue ganada por Loris Capirossi, seguido de Valentino Rossi y Dani Pedrosa.
Jorge Lorenzo ganó la prueba de 250 cc, por delante de Andrea Dovizioso y Hiroshi Aoyama.
La carrera de 125 cc fue ganada por Álvaro Bautista, Mika Kallio fue segundo y Gábor Talmácsi tercero.