Ruta del ácido shikímico

El intermediario principal es el ácido shikímico, un compuesto originalmente aislado de plantas del género Illicium.

Es raro encontrarlo libre: más bien funge como residuo estructural de metabolitos más complejos, por ejemplo antibióticos como la ansatrienina, las trienomicinas, las tiazinotrienomicinas, la asukamicina y en los ácidos grasos ω-ciclohexílicos de ciertas bacterias termófilas y mesófilas (como Alicyclobacillus), por ejemplo el ácido ω-ciclohexilundecanoico.

Al producto formado se adiciona una molécula de amoniaco para dar el ácido 4-amino-3-desoxi-D-arabino heptulosónico-7-fosfato (aminoDHAP).

Después, la DHQ sintasa cataliza el cierre de un anillo para producir el ácido 4-amino-3-deshidroquínico (aminoDHQ).

Una vez que la condensación ha ocurrido, el mitosano sufre interconversiones de grupos funcionales.

El AHBA también es precursor de otros productos naturales anticáncer tales como la rifamicina y la ansamicina.

Estas quinonas se derivan del ácido isocorísmico y de un precursor adicional con 4 carbonos proporcionados por el ácido 2-oxoglutárico, que se incorpora mediante un mecanismo que implica la coenzima tiamina difosfato (TPP), de manera análoga a la piruvato descarboxilasa.

Sin embargo, se encuentra que el fragmento terpenoide reemplaza al grupo carboxilo, y el análogo descarboxilado no está involucrado.

La transformación del ácido 1,4-dihidroxinaftoico en naftoquinona isoprenilada parece estar catalizada por un único enzima.

Esto implica la alquilación, la descarboxilación del β-cetoácido resultante, y finalmente una oxidación a la p-quinona.

Se ha encontrado que los seres vivos pueden catabolizar la tirosina, la fenilalanina y los fenilpropanoides a esqueletos aromáticos con una cadena lateral de dos carbonos.

Este compuesto se oxida a ácido fenilacético por acción de una aldehído deshidrogenasa (EC 1.2.1.5).

Por otro lado, el ácido fenilpirúvico sufre una descarboxilación oxidativa para formar fenilacetaldehído, el cual se puede incorporar a la ruta anteriormente descrita.

La oxidación de esta molécula proporciona norepinefrina que luego es metilada para dar epinefrina.

La PNMT usa la S-adenosilmetionina como cofactor para donar el grupo metilo a la norepinefrina, formando así la adrenalina.

Esta reacción es catalizada por enzimas oxidativas y normalmente es controlada por proteínas de dirección.

[27]​ Los organismos productores de estas enzimas son cruciales para los ciclos ecológicos (por ejemplo, crecimiento / muerte / descomposición / rebrote, ciclo del carbono y restauración del suelo) porque permiten que el tejido vegetal se descomponga rápidamente, liberando la materia orgánica para su reutilización en las nuevas generaciones de vida.

A su vez, las chalconas forman uno de los grupos fitoquímicos más extendidos y representativos en las plantas angiospermas: los flavonoides.

Las 'auronas producen un cierre furanoide (en lugar del piranoide de los flavonoides) y se encuentran restringidas taxonómicamente.

Los alcaloides isoquinolínicos y tetrahidroisoquinolínicos (THIQ) comprenden una diversa gama de compuestos ampliamente distribuidos principalmente en el reino vegetal.

[34]​ La salinosporamida A (Marizomib) es un potente inhibidor del proteasoma que se estudia como posible agente anticanceroso.

Los compuestos carbonílicos condensados con triptamina más comunes son el ácido pirúvico, el cual forma 1-metil β-carbolinas (como la harmina) o aldehídos como la secologanina.

Un derivado de la prekuamicina, la estemadenina, puede formar distintos alcaloides tales como la elipticina: La prekuamicina también es precursora de los sistemas tipo andranginina: La secodina sufre ciclizaciones posteriores para formar los alcaloides tipo Cataranthus.

Muchos alcaloides que contienen un grupo metilo o hidroximetilo en la posición 8 están presentes en el cornezuelo en cantidades mínimas.

La oxidación del metilo terminal de la agroclavina forma el ácido lisérgico, uno de los alcaloides del ergot más conocidos: El ácido lisérgico puede incorporarse a una polipéptido sintasa no ribosomal para formar alcaloides más complejos, como la β-ergocriptina.

Estos alcaloides del cornezuelo manifiestan una variedad compleja de propiedades farmacológicas.

[58]​[59]​ El ácido quinurénico es un alcaloide quinolínico que se forma a partir de un catabolito del triptófano, la quinurenina.

Cuando la cetona tautomeriza a enol, se finaliza así la formación del anillo de quinolina.

Este compuesto se oxida a ácido fenilacético por acción de una aldehído deshidrogenasa (EC 1.2.1.5).

Por otro lado, el ácido fenilpirúvico sufre una descarboxilación oxidativa para formar fenilacetaldehído, el cual se puede incorporar a la ruta anteriormente descrita.

Ruta de biosíntesis del ácido shikímico y otros precursores
Biosíntesis de la rifamicina .
Biosíntesis del ácido corísmico
Biosíntesis de la enterobactina
Estructura general de las ubiquinonas
Lapacho rosado ( Handroanthus impetiginosus ), árbol que produce el pigmento lapachol ).
Alheña ( Lawsonia inermis ), planta que produce el pigmento lawsona ).
Rubia roja ( Rubia tinctorum ), planta que produce el pigmento alizarina ).
Nuez del nogal ( Juglans regia ), planta que produce la juglona ).
Cloranfenicol , antibiótico biosintetizado por Streptomyces venezuelae . La unidad de L-p-aminofenilalanina se forma en etapas tempranas de la ruta de la fenilalanina
Tiroxina , hormona yodada secretada por la glándula tiroides de varios mamíferos. La unidad de L-diyodotirosina se forma a partir de la yodación del anillo aromático del residuo de tirosina del péptido parathormona
Biosíntesis de la L- Tirosina a partir de la L- Fenilalanina .
Clavo ( Syzygium aromaticum ) . Su aceite esencial contiene principalmente eugenol .
Canela ( Cinnamomum verum ) . El cinamaldehído es el componente principal del aroma.
Vainilla ( Vanilla planifolia ) . La vainillina es el principal componente de la fragancia.
Ruta de los fenilpropanoides
Planta de la plata ( Lunaria annua , productora de lunarina.
Ruta de degradación de fenilpropanoides
Biosíntesis de la efedrina
Biosíntesis de la efedrina
Bu Gu Zhi ( Psoralea corylifolia ), planta de la medicina tradicional china de la cual se aisló el psoraleno.
Ameo ( Ammi majus ), umbelífera productora de xantotoxina y bergapteno .
Biosíntesis de la isopimpinelina
Biosíntesis de la cumarina de la novobiociona
Degradación preliminar de la tirosina y la fenilalanina: Los tres principales catabolitos son el ácido homoprotocatecuico, el ácido homogentísico y fenilacetil Coenzima A
Sorgo ( Sorghum bicolor ), cereal productor de durrina .
Mostaza blanca ( Sinapis alba ), planta crucífera productora de sinalbina .
Biosíntesis del glucósido cianogénico y del glucosinolato de la tirosina (durrina y sinalbina)
Rutas de la DOPA
Glándulas suprarrenales ,sitio de biosíntesis de las catecolaminas en animales.
Ruta de las catecolaminas
Biosíntesis de cicloheptanocarbonilos
Biosíntesis de gliotoxina
Biosíntesis de la aranotina
Nocardia es un género de bacterias productoras de vancomicina
Luciérnaga común ( Lampyris noctiluca )
Biosíntesis de la luciferina de Lampyris
Estructura química de algunos lignanos:9,9'-Lignofuranoide, Diepoxilignanano, 2,7'-Ciclolignano (Arildecalina), 2,2'-Ciclolignano
El podófilo ( Podophyllum peltatum ), comúnmente conocido en sus zonas de origen como Mayapple , contiene el ciclolignano fenilnaftalénico podofilotoxina .
Biosíntesis de podofilotoxina
Sección de una rama de tejo ; en color pálido la albura , de color más oscuro el duramen y el centro casi negro de la médula . La lignina es el principal material que confiere rigidez a la madera.
Phanerochaete velutina , hongo degradador de lignina.
Estructura de la lignina.
Las antocianinas otorgan el color rojizo a las hojas de Acer palmatum en el otoño.
Coreopsis grandiflora , planta productora de auronas.
Las semillas de Aiphanes horrida , contienen luteolina, una flavona muy común que se encuentra en se encuentra en las hojas y corteza, y particularmente en el apio, tomillo, diente de león, flor de trébol.
El avellano de brujas ( Hamamelis virginiana ), contiene kaempferol, un flavonol ampliamente distribuido en fuentes vegetales comestibles, como el té verde, brócoli, toronja, uva, coles de Bruselas y manzanas.
Quebracho ( Schinopsis lorentzii ), árbol productor de taninos condensados.
Estructura de un tanino condensado.
Curcuma , productora de curcumina.
La curcumina confiere el color al polvo de cúrcuma .
Biosíntesis de la curcumina
Ácido polipórico, una terfenilquinona.
Xanthoporia radiata , hongo que produce terfenilquinonas.
La coloración naranja del hongo Suillus variegatus se debe al ácido variegático.
Ácido variegático, un derivado del ácido pulvínico .
Ruta de los arilpiruvatos
Ácido hiposudórico
Ruta de los arilpiruvatos
Melanina presente en el material oscuro con forma de gránulos al centro de la imagen en un melanoma pigmentado con tinción de Papanicolaou .
Galanthus , amarilidácea productora de galantaminas.
Crinum , amarilidácea productora de crininas.
Lycoris , amarilidácea productora de licorinas.
Biosíntesis de alcaloides de amarilidáceas
Biosíntesis de alcaloides de amarilidáceas
Colchicum autumnale , productora de colchicina
Biosíntesis de la colchicina
Ipecacuana ( Cephaelis acuminata ), productora de emetina
Biosíntesis de la emetina
Securinega suffruticosa (ahora Flueggea suffruticosa )
Securinina
Secuamamina D
Biosíntesis de alcaloides tipo securinina .Sankawa y colaboradores dedujeron que la securinina puede provenir de una molécula de tirosina y otra de cadaverina . Los precursores lisina, cadaverina, y tirosina fueron los que mostraron mayor incorporación. Los experimentos de degradación revelaron que la [1,5- 14 C]-cadaverina marcó específicamente el anillo de piperidina de securinina y la radioactividad de DL -tirosina-[2- 14 C] fue incorporado en el carbonilo C-11 de la lactona. Los experimentos con L - tirosina [U- 14 C] y L -tirosina-[3’,5’- 3 H;U- 14 C] prueba que el fragmento C 6 – C 2 es derivado del anillo aromático y los carbono C-2 y C-3 de la tirosina. [ 37 ]
Tabaco del diablo, Lobelia tupa .
Las plantas del género Peganum (Fam. Nitrariaceae ) producen alcaloides pirroloquinazolínicos.
Las plantas del género Melicope (Fam. Rutaceae ) producen alcaloides acridínicos.
Metabolitos del antranilato
Las plantas del género Murraya (Fam. Rutaceae ) producen alcaloides carbazólicos.
Biosíntesis del triptófano
Biosíntesis del triptófano
Biosíntesis del DIMBOA.
Psilocybe zapotecorum , hongo alucinógeno.
Síntesis de la estrictosidina
Quina Cinchona , planta que produce quinina .
Mitragyna speciosa , planta productora de ajmalicina
Preparado de Pausinystalia johimbe , planta de la que se extrae la yohimbina .
Ochrosia elliptica , planta productora de elipticina.
Biosíntesis de elipticina.
Las semillas de la nuez vómica ( Strychnos nux-vomica ) contienen estricnina .
Brucina , alcaloide relacionado con la estricnina .
Catharanthus roseus , planta de la que se aisló la vinblastina.
Esponja del género Haliclona , de las cuales se han extraído alcaloides tipo manzamina.
Haba de Calabar ( Physostigma venenosum ), planta productora de fisostigmina .
Physostigmine proposed biosynthesis
Physostigmine proposed biosynthesis
Ergot ( Claviceps purpurea , hongo que produce diversos alcaloides indoloquinolínicos
Peritecio del hongo Chaetomium , de los que se aislaron las quetoglobosinas.
Lobo marcando su territorio. El ácido quinurénico se encuentra en la orina de los cánidos.
Degradación preliminar de la tirosina y la fenilalanina: Los tres principales catabolitos son el ácido homoprotocatecuico, el ácido homogentísico y fenilacetil Coenzima A
Degradación del ácido homoprotocatecuico
Degradación de la fenilacetil Coenzima A
Catabolismo del ácido homogentísico
Degradación del ácido benzoico
Degradación de la benzoil Coenzima A