Desaparecido el mencionado convento, la hermandad de La Sangre se trasladó a la parroquia de S. Andrés, y fue allí donde al parecer surgió La Oración en el Huerto como corporación independiente.
A este respecto, el historiador de la Semana Santa baezana Rafael Rodríguez-Moñino, dice:
La bandera corporativa —de azul semejante al hábito— aparece plegada sobre su asta mostrando la composición heráldica que representa a la corporación.
La Hermandad es fundadora de la Confraternidad Nacional de Hermandades y Cofradías de la Oración en el Huerto, Getsemaní, y así desde 1991 ha venido asitiendo a los congresos organizados por la Confraternidad, siendo en 2003 la organizadora del VII Congreso.
Ha asistido corporativamente al Congreso Internacional del Rosario celebrado del 28 al 30 de octubre de 2004 en Sevilla.