[7] En la misma temporada llegó a la final de la Champions League, en donde su equipo cayó frente al F. C. Barcelona, quedando subcampeón del torneo.
[9] En la temporada 2005-2006, Javier jugó con el Chivas Coras, un equipo filial de Tepic, Nayarit.
También jugó 6 partidos entre 2007 y 2008 con el Guadalajara, aunque sin ninguna anotación.
No fue sino hasta el Torneo Apertura 2009 cuando Javier comenzó a sobresalir en su equipo, terminando como el tercer máximo goleador del torneo, al haber anotado 11 goles en 17 partidos, convirtiéndose en un jugador titular del Guadalajara.
[25] Hernández anotó en el partido de pretemporada del Manchester United ante League of Ireland XI.
Hernández entró en el segundo tiempo y al minuto 76 consiguió la anotación.
Y así cubrir el espacio que dejó Gonzalo Higuaín tras sufrir una lesión en la espalda,[34][35] pero al final nada se concretó ya que Javier tiene una cláusula de contrato por 50 millones de euros.
Siendo este su segundo gol del año, con un pase por parte de su compañero Nani al minuto 27.
[45] El 8 de abril, Hernández se reveló como un contendiente para el Premio PFA al jugador joven del año junto a su compañero de equipo Nani.
[59] Hernández volvió a anotar en el siguiente juego en casa del Newcastle United, cuando un disparo de Wayne Rooney fue bloqueado por un defensa y rebotando contra su cuerpo haciendo así su sexto gol.
Marca su primer gol en UEFA Europa league ante el Ajax en el Amsterdam Arena ganando 0-2 y volviendo a marcar en la vuelta en Old trafford (caen 1-2) para sellar la clasificación del Manchester united con marcador global de 2-3.
El 29 de octubre anotó 2 goles en la Capital One Cup, venciendo 4-0 al Norwich City.
El 19 de enero anotó su segundo gol en la Premier League perdiendo 3-1 frente al Chelsea en Stamford Bridge.
[70] Sería confirmado su regreso de la cesión por el mismo técnico Van Gaal para llevarlo a la gira por América.
[75] Su segundo doblete sería el 21 de noviembre en la victoria 3-1 visitando al Eintracht Frankfurt.
Dos días más tarde, fue nombrado jugador de la Bundesliga del Mes por tercera vez en la temporada.
Dos días más tarde, se informó que Hernández se perdería el primer partido de Bayer de la temporada contra el Borussia Mönchengladbach después sufrir una fractura en la mano.
La semana siguiente, Hernández anotó sus dos primeros goles para el West Ham en la derrota 3-2 ante Southampton.
En respuesta, Moyes se refirió a él como un "máximo goleador" y "un brillante finalizador".
En septiembre, el gerente del West Ham, Manuel Pellegrini, declaró que Hernández sufría de fiebre glandular, lo que le hizo perder varios partidos, se recuperaría y volvería a entrenar en octubre.
Aunque su equipo fue derrotado por 2-1, Javier dio una asistencia a Paul Aguilar para la anotación del único gol de la selección mexicana.
[90] Su cuarto gol con la selección mexicana ocurrió el 17 de marzo de 2010 ante Corea del Norte, al haber anotado al minuto 68 el gol que le dio la victoria a México por 2-1.
Se creía que había sido marcado cómo autogol por parte de Miralem Pjanić, el arbitraje final le concedió a Hernández la autoría del gol.
A ellos se suma un gol en tres partidos con la selección sub-20 en la Copa Mundial de 2007.
Javier Hernández acumula un total de 109 partidos con su selección, situándose entre los quince jugadores que más veces han sido internacionales por México.
En cuanto a la faceta anotadora, el jugador es el máximo goleador histórico de la selección mexicana con un total de 52 goles,[120] superando a Jared Borgetti con 46 goles anotados.
Fuentes: ESPN Deportes, Historial de partidos México y Estadísticas National Football
[125][126] Un estudio de ESPN - Sports Science reflejó que su aceleración alcanza los 34,6 kilómetros por hora en tan solo 2 segundos y medio.
El periódico inglés The Sun lo comparó con Ole Gunnar Solskjær, por su forma de juego.
[129] También ha sido comparado en muchas ocasiones con Hugo Sánchez y expertos afirman que superará sus marcas.