Atocha Cercanías constituyen un importante nudo ferroviario en el que confluyen numerosas líneas.
Esta estación viene a sustituir al primitivo apeadero semienterrado que se situaba junto a la vieja estación y que servía de extremo sur del túnel.
En todo este conjunto de acciones hay que incluir diversas actuaciones más o menos coetáneas en el tiempo como son el Pasillo Verde Ferroviario que permitirá unir Príncipe Pío con Atocha-Cercanías así como el nuevo túnel ferroviario desde Aluche hasta Atocha-Cercanías por Embajadores para integrar el servicio de Cercanías a Alcorcón y Móstoles con el resto del núcleo.
Utilizan la estación los trenes hacia el sur que parten de Madrid en ancho ibérico.
Utilizan la estación aquellos trenes de Media Distancia que parten en ancho ibérico hacia el sur.
[3] Este cambio nunca llegó a producirse, anunciándose el 19 de diciembre que el nuevo nombre sería simplemente Atocha.
En su lugar se estableció un servicio sustitutivo de autobús entre esta estación y Valdecarros.
Las líneas sombreadas en rojo no prestan servicio temporalmente en esta estación.