La universidad funcionó inicialmente en el Colegio Sagrados Corazones Recoleta, situado en la plaza Francia de Lima.
En la actualidad cuenta con 15 facultades, una escuela de postgrado, múltiples institutos y un centro cultural.
[5] En 1944, al fallecer el pensador peruano José de la Riva-Agüero y Osma, quien decidió dejar su herencia a la Universidad Católica del Perú, la Universidad Católica del Perú recibió el fundo Pando (un terreno de 45 hectáreas), varios inmuebles en el centro de Lima y terrenos rurales en Lima y Pisco.
En 1959, se empezaron a construir los primeros edificios en el nuevo campus de la universidad.
En 1972, se implementaron los programas de estudios generales constituidos como unidades académicas autónomas, divididas en dos grandes campos: ciencias y letras.
En 1992, se creó el Centro de Servicios y Transferencia Tecnológica (siglas: CTT-PUCP), actualmente INNOVAPUCP, orientando a canalizar la oferta tecnológica de la PUCP a entidades públicas y privadas del país.
[8] La Pontificia Universidad Católica del Perú es autónoma en los ámbitos administrativo, económico, normativo, de gobierno y académico.
[8] La universidad es gobernada por sus docentes, quienes eligen a sus autoridades directamente, con participación parcial de los estudiantes y egresados (tercio estudiantil).
La universidad posee actualmente trece unidades académicas: dos estudios generales, una escuela de graduados y 10 facultades.
Cada especialidad representa a una carrera profesional enseñada en la universidad, cada una de ellas está dirigida por un coordinador.
Los departamentos académicos son las unidades que agrupan a los profesores de la universidad.
Cada departamento académico representa un área del conocimiento tratada en la Universidad sobre la cual se desarrolla investigación, enseñanza y proyección social.
Las direcciones académicas son las unidades encargadas de organizar y supervisar áreas específicas del quehacer institucional.
Actualmente, la universidad cuenta con seis unidades de este tipo, cada una con un director a la cabeza.
En él se encuentran todas las facultades y edificios administrativos de la Universidad.
Del total de 92 universidades licenciadas en el Perú,[14] La Pontificia Universidad Católica del Perú se ha ubicado siempre dentro de los cinco primeros lugares a nivel nacional en los diversos rankings universitarios internacionales.
Junto con la Universidad Nacional Mayor de San Marcos y la Universidad Peruana Cayetano Heredia, es una de las tres únicas universidades peruanas que han llegando a ocupar la primera posición a nivel nacional en determinadas ediciones de las clasificaciones académicas existentes, tales como los University Rankings by Academic Performance del URAP Center,[15] la Clasificación mundial de universidades QS por Quacquarelli Simonds,[16] los Rankings Web of Universities por CSIC conocido como Webometrics,[17] y los SIR World Reports por SCImago Research Center.