En 2013, al-Bashir anunció que las Yanjauid se reorganizarían como Fuerzas de Apoyo Rápido (RSF) y también anunció que las RSF quedarían bajo el mando del comandante de las Yanjauid, Mohamed Hamdan Dagalo, más comúnmente conocido como Hemedti.[38] Las FAR son una organización paramilitar sudanesa con raíces en las milicias Janjaweed que operan durante el conflicto de Darfur.[42] En respuesta, las Fuerzas Armadas del Sudán cerraron todos los aeropuertos y llevaron a cabo ataques aéreos contra posiciones de las RSF.Las RSF afirmaron haber repelido un ataque de las Fuerzas Armadas del Sudán y derribado dos helicópteros.[62] La embajada turca en Jartum fue trasladada a Port Sudan después de que el automóvil del embajador turco fuera alcanzado por disparos, y ambas partes del conflicto se culparon mutuamente por el ataque.[64] Las conversaciones de paz entre SAF y RSF se suspendieron debido a violaciones del alto el fuego.[66] En Darfur, las milicias armadas fueron acusadas de llevar a cabo ejecuciones sumarias,[67] exacerbando la crisis humanitaria.Las Fuerzas Armadas del Sudán y las RSF se culparon mutuamente por los incidentes, mientras que el gobierno sudanés tomó medidas contra los enviados internacionales.[72] La embajada saudí en Jartum fue atacada, y las evacuaciones de un orfanato se llevaron a cabo en medio del caos.[74] El Comité Internacional de la Cruz Roja facilitó la liberación del personal retenido por las RSF.El Alto Comisionado de las Naciones Unidas para los Derechos Humanos, Volker Türk, exigió una "investigación rápida, exhaustiva e independiente".[80] El Tercer Frente, conocido como Tamazuj, uno de varios grupos con sede en Darfur y Kordofán que firmaron un acuerdo de paz con el gobierno sudanés en 2020 y habían sido marginados por sus presuntos vínculos con la inteligencia militar sudanesa, declaró formalmente su alianza con las RSF.Varios de sus comandantes habían apoyado previamente a las RSF al comienzo del conflicto.[94] El 10 de septiembre, al menos 43 personas murieron y decenas más resultaron heridas en un ataque aéreo en Jartum.Posteriormente, las guarniciones de las Fuerzas Armadas del Sudán en Darfur Oriental abandonaron sus posiciones y se retiraron, lo que permitió a las RSF ocupar la zona.[119] Las RSF intentaron capitalizar sus logros intensificando los ataques contra posiciones de las SAF en Jartum y Omdurman.[132] Al-Burhan pronunció un discurso público ampliamente promocionado ante los soldados en el Estado del Mar Rojo, prometiendo armar a las milicias civiles para luchar contra las RSF y luchar contra el "colonialismo", lo que fue visto por los observadores como una referencia al apoyo de los Emiratos Árabes Unidos a las RSF.[139] Las RSF están reclutando tropas en el estado de Gezira para intentar arrebatar territorio en El-Gadarif a las Fuerzas Armadas del Sudán.[146] La Fuerza Conjunta de Darfur declaró la guerra a las RSF y se alió con las SAF.[39] En Foro Baranga, en Darfur Occidental, decenas de personas murieron y cientos resultaron heridas.[172] Las Naciones Unidas informaron que la escasez de bienes básicos, como alimentos, agua, medicamentos y combustible, se ha vuelto "extremadamente aguda".[179] La ONU estimó que la actividad económica en Sudán cayó en más de un tercio durante las primeras tres semanas del conflicto.[195] Las Fuerzas Armadas de Sudán dijeron inicialmente que no tenían conocimiento de ninguna coordinación con los mediadores o la comunidad internacional con respecto a una tregua y afirmaron que las FAR planeaban usar este tiempo para encubrir una "derrota aplastante".[200] El 1 de mayo, el enviado especial de las Naciones Unidas a Sudán, Volker Perthes, anunció que las Fuerzas Armadas del Sudán y las RSF habían acordado enviar representantes para las negociaciones mediadas por la ONU, pero no dieron una fecha o lugar para las conversaciones.También impuso restricciones de visa contra las personas involucradas en la violencia, pero no divulgó ningún nombre.Según The Wall Street Journal, el señor de la guerra libio Jalifa Hafter respaldado por los Emiratos Árabes Unidos y el Grupo Wagner de Rusia, envió al menos un avión para transportar suministros militares a las RSF.[212] Los Emiratos Árabes Unidos y el Grupo Wagner también están involucrados en acuerdos comerciales con las FAR.[213] Sin embargo, el jefe del Grupo Wagner, Yevgueni Prigozhin negó apoyar a FAR, diciendo que la compañía no ha tenido presencia en Sudán durante más de dos años.El Ejército Nacional Libio, comandado por Haftar, también negó haber brindado apoyo a ningún grupo en conflicto en Sudán y dijo que estaba listo para desempeñar un papel mediador.Las Fuerzas Armadas de Sudán dijeron que el ejército etíope había llevado a cabo un ataque con tanques, vehículos blindados e infantería y que había infligido grandes pérdidas al personal y equipo etíope.