En 2011 obtuvo la Maestría universitaria en ciencias por esa misma universidad, con una tesis sobre Ecología vegetal.

Ha escrito distintos artículos científicos, entre los cuales destaca "Plant Species Diversity and Composition of Two Wetlands in the Nairobi National Park, Kenya", publicado en el Journal of Wetlands Ecology n.º 6 (2012).

Tras licenciarse en Biología y Zoología por la Universidad de Nairboi en 1990, Ruto trabajó como profesor entre 1990 y 1992 en el norte del Valle del Rift, en donde lideró el coro de una Iglesia local, la African Inland Church(AIC).

[3]​ Desde este cargo, aprendió el funcionamiento de la política keniana y se cree que ya empezó a acumular dinero.

Ruto intentó presentarse por el Movimiento Democrático Naranja (ODM) como candidato a la presidencia, pero su aspiración no prosperó.

Este último y su partido, la ODM, reclamaron la victoria, mientras que Kibaki prestó juramento apresuradamente como presidente, tras lo cual Kenia se vio inmersa en una crisis política violenta.

Finalmente, ésta pudo resolverse cuando Kibaki y Odinga acordaron formar un gobierno, compartiendo el poder.

Se unió a Uhuru Kenyatta para formar la Coalición Jubilee para la elección presidencial de 2013.

[12]​ En respuesta al fallo, Odinga dijo que respetaba la decisión de la Corte Suprema aunque estaba totalmente en desacuerdo con ella.

El objetivo, dijo, debería ser " incluir a la mayoría trabajadora y marginada en la corriente económica principal ".

[24]​ El presidente Ruto propuso una privatización a gran escala de las empresas públicas, señalando que no es económicamente viable seguir inyectando recursos gubernamentales para sostener esas corporaciones.

El 23 de enero de 2012, la Corte Penal Internacional confirmó los cargos contra Ruto y Joshua Cantó, en un caso que también implicó a Uhuru Kenyatta, Francis Muthaura Henry Kosgey y el general Mohammed Hussein Ali.

A comienzos de 2009, después del debate parlamentario, estalló el escándalo del maíz, Ruto fue acusado por Ikolomani MP Bonny Khalwale de vender maíz ilegalmente.

Ruto rechazó el borrador en el referendo constitucional, argumentando que algunas de sus cláusulas eran inadecuadas, mientras que Odinga y Kibaki hicieron campañas a favor de la nueva Constitución.