[7] Estaba casado con Delia Esther Vieyra, con quien tuvo dos hijos, Eduardo Enrique y Emilio Esteban.[26] Durante su carrera fue condecorado por los gobiernos de Chile, Ecuador, Brasil, Paraguay, Bolivia, Perú, Venezuela, Estados Unidos, Taiwán, Colombia, Corea, España, Gabón, Guatemala, México, Nicaragua, Sudáfrica, y Uruguay.Su gestión como comandante de la Armada Argentina estuvo enmarcada por disputar la preponderancia política al Ejército.[28] Tras la muerte del presidente Perón, precipitó un deterioro de su vínculo con el gobierno.[36][37] Massera aún apartado del poder comienza su proyecto político; crea el Partido para la democracia social apoyado por su diario Convicción cuyos colaboradores eran periodistas detenidos en la ESMA.En 2009 comenzó un juicio en ausencia por la muerte de tres italianos durante la dictadura.De hecho, alguien lo llamó para recordarle que lo esperaban en el Apostadero Naval de San Fernando para pasear en el yate del jefe naval.Sin embargo salió en su vehículo rumbo al norte del conurbano.Mientras Invierno y su asistente Radice comienzan las "investigaciones" infructuosas, es el propio capitán Invierno quien comienza una telaraña de enajenación de bienes de Fernando Branca en Argentina y Estados Unidos, mediante las oportunas y necesarias firmas del propio Fernando Branca (que ya estaba desaparecido).[44][45] Massera intercedió ante el contralmirante contador Andrés Covas, puesto por él en la presidencia del Banco Central, para que autorizara una transferencia internacional por 1 600 000 dólares, para poder comprar los campos de Branca.Massera utilizaba un departamento de la calle Darragueyra, que su padre había comprado a la locutora y exmodelo Teté Coustarot, para sus encuentros con amantes, citas protegidas por su numerosa custodia.La diplomática Elena Holmberg fue secuestrada en 1978, en Buenos Aires, apenas había vuelto de París, en donde trabajaba en la embajada argentina.Su cadáver apareció más tarde en las aguas del Río Luján, en el Tigre.Elena Holmberg trabajaba en el Centro Piloto de la Marina Argentina para contrarrestar la campaña antiargentina en Francia.[44] Holmberg había dicho que tenía una foto de Massera con el dirigente montonero Mario Firmenich y le había contado a Videla de las relaciones entre Massera y la organización montonera.[53][50] El cadáver de Marcelo Dupont mostraba marcas de estrangulación en vida, y se atribuyó a Massera participación en el hecho, tratándose de demostrar que Marcelo Dupont había sido apresado y luego arrojado al vacío por sicarios del almirante.Esta hipótesis se basa en los dichos posteriores de Francisco José Piñón[59] quien contestó, cuando fue interpelado públicamente, que el acto de distinción a Massera se había realizado para "salvar vidas".[61] Gelli habría facilitado las relaciones de Massera con el Vaticano y Estados Unidos.Su apellido se convirtió en trending topic, en los asuntos del día con más referencias en el mundo.
