En 1999, el departamento de fútbol se separó del club deportivo y ahora es una entidad independiente llamada formalmente Bayer 04 Leverkusen Fußball GmbH.Cuatro años más tarde, el club se aseguró una plaza en la Bundesliga para empezar a jugar en ella en la temporada 1979-80.Fue entonces, en 1984, cuando las dos mitades del club que se habían separado más de medio siglo antes volvieron a unirse como «TSV Bayer 04 Leverkusen e.V.».[12] La victoria en la Copa de la UEFA 1988, el mayor éxito del Bayer Leverkusen como club,[13] también se produjo durante la era Ribbeck.Los tres jugadores se convirtieron en los favoritos del público y contribuyeron significativamente al equipo.En 2000, el Bayer Leverkusen sólo necesitaba un empate contra el SpVgg Unterhaching para ganar el título, pero un gol en propia meta de Michael Ballack contribuyó a que el equipo sufriera una aplastante derrota por 2-0, mientras que el Bayern de Múnich se adjudicaba el título con una victoria por 3-1 sobre el Werder Bremen.El carismático entrenador Klaus Augenthaler tomó las riendas del equipo en los dos últimos partidos de la temporada y contribuyó a evitar el desastre con una victoria sobre su anterior club, el 1.[24] Sin embargo, el Leverkusen cayó derrotado en la primera ronda eliminatoria ante el Liverpool, a la postre campeón.[31] Sin embargo, a medida que avanzaba la temporada, el equipo no consiguió ninguna victoria contra los mejores clubes de la Bundesliga.[32] El Leverkusen terminó la temporada en novena posición de la Bundesliga y Labbadia se marchó al Hamburgo S.V.[33] En la temporada 2010-11, el Bayer Leverkusen quedó subcampeón, clasificándose así para la Liga de Campeones por primera vez desde 2005.En octubre de 2022, Xabi Alonso se hace cargo del equipo sustituyendo a Gerardo Seoane.Este logro marca un hito significativo para el club, consolidando su posición en la élite del fútbol alemán.[54] En el pecho izquierdo, llevaban un nuevo escudo con el león del Bayer, mostrando así su lealtad a su empleador.Sin embargo, para 1923, cuando los jugadores fundaron su propio club por razones de política deportiva, el negro y el rojo se convirtieron en los colores principales.Aunque muchos aficionados del Bayer 04 estaban disgustados, el equipo adoptó los colores rojo y blanco.[56] En 1932, 18 años más tarde, el equipo se trasladó al Stadion am Stadtpar, con una capacidad de 18 000 espectadores.Lleva el nombre de Ulrich Haberland, primer director general del Bayer tras la Segunda Guerra Mundial.Es así como, en 1997, en el marco de los éxitos futbolísticos logrados en años previos, se inauguró oficialmente la tribuna sur.[56] Fue por eso que a finales de 2007, el estadio inició una remodelación para ampliar su capacidad hasta los 30 000 espectadores.La siguiente tabla muestra todos las apariciones y goles en partidos oficiales con el primer equipo del Bayer Leverkusen.En la larga trayectoria del Bayer Leverkusen, ha habido una serie de entrenadores que han dejado una marca indeleble en el club.Otro entrenador destacado en la historia fue Christoph Daum, quien dirigió al equipo durante cuatro temporadas entre 1996 y 2000.Zinédine Zidane volvió a adelantar al Real Madrid con una impresionante volea con la zurda justo antes del descanso, y el equipo español se alzó con su novena Liga de Campeones.[69][70] Sin embargo, los orígenes empresariales del Bayer Leverkusen distan mucho de ser los únicos.[6] Se trata de orígenes geográficos y tradicionales, ya que ambos bandos reivindican ser la «potencia del Rin».Colonia, sin embargo, el derbi más tradicional contra el Borussia Mönchengladbach tiene una prioridad aún mayor.El Bayer Leverkusen es conocido principalmente por su equipo de fútbol masculino, que compite en la Bundesliga y otras competiciones nacionales e internacionales.Hasta hoy, el club ha ganado más títulos nacionales que cualquier otro equipo de baloncesto alemán.El club cuenta con una sección de balonmano que ha tenido éxito tanto a nivel nacional como internacional.
Ulf Kirsten
, tres veces máximo goleador de la Bundesliga alemana y máximo artillero histórico del Bayer Leverkusen.
El Bayer Leverkusen en un partido de fase de grupos por la
Liga de Campeones 2002-03
. Esta plantilla sería apodada por los medios como el «Neverkusen», debido a la perdida de títulos de manera consecutiva en años anteriores.
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19
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20
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Sami Hyypiä
, director técnico finlandés a cargo del Bayer entre 2012 y 2014 y uno de los técnicos con mayor efectividad en la historia del equipo.
Vista exterior del moderno BayArena, recientemente remodelado en 2009.
Xabi Alonso
, entrenador del primer equipo desde 2022.
Aficionados del Bayer Leverkusen.
Barra
ultra
del Bayer encendiendo bengalas en un partido contra el
F.C Colonia
en 2012.
Parche que muestra los escudos del Bayer Leverkusen y el
Kickers Offenbach
, reflejo de la buena relación entre ambas aficiones.