También mantiene un enfrentamiento con Bayern de Múnich, el equipo más exitoso del país.

El club consiguió más tarde algunas victorias en pequeños torneos y campeonatos locales.

La relación sin embargo fue corta y en menos de dos meses el Bremen decidió continuar como club independiente.

Siguió creciendo como equipo después de que tuviese lugar la Primera Guerra Mundial, y dicho éxito les llevó a acoger también la práctica de otros deportes y a adoptar su nombre definitivo: Sportverein Werder Bremen.

El Werder Bremen realizó apariciones regulares en la Norddeutscher Fußball Verband durante los años veinte y principios de los treinta, pero no alzó ningún título ni obtuvo ningún éxito destacable.

Con la proclamación del Tercer Reich en 1933 el fútbol alemán pasó a estar dividido en dieciséis ligas conocidas como Gauligen.

Con la llegada de la Segunda Guerra Mundial la contienda internacional se situó en territorio alemán las Gauligen comenzaron a hacerse más locales.

Bundesliga y desde 2008 pasó a ser la 4.ª categoría del fútbol alemán por la creación de la 3.

Al igual que otras organizaciones en toda Alemania el club fue disuelto tras la victoria aliada en la guerra y la ocupación alemana.

Esta temporada cuatro entrenadores estuvieron activos en Bremen y al final de una temporada en la que el conjunto estrella que no coincidía entre sí solo pudo brillar en raras excepciones, la caída culminó con el descenso a la 2.

Bundesliga por primera y última vez en la temporada 1979-80 después de haber finalizado decimoséptimos.

En 1993 el Werder obtuvo una vez más la Bundesliga y al año siguiente su tercera Copa de Alemania.

[14]​ Otto Rehhagel dejó el club en junio de 1995 para entrenar al Bayern Múnich.

La partida de Rehhagel se hizo notar rápidamente en el club, que tras ser dirigido por varios entrenadores distintos (Aad de Mos, Dixie Dörner, Wolfgang Sidka y Felix Magath) pasó a estar en una situación crítica.

En mayo de 1999 firmó como entrenador el exdefensa Thomas Schaaf, quien detuvo la crisis del Werder Bremen e hizo al equipo ganar la Copa tan solo una semanas después.

No obstante, volvieron a ser eliminados de la competición continental en octavos, esta vez por la Juventus.

La temporada siguiente aseguraron su tercera participación consecutiva en la competición europea tras acabar el año segundos.

Durante la temporada 2019-20, deberían jugar el playoff contra FC Heidenheim para mantenerse en primera división y no descender.

En la temporada 2020-21 el club no alcanzó los puntos necesarios para quedarse en la primera división de Alemania, por lo que descendió por segunda vez en su historia a la 2.

Bundesliga tras perder 4-2 en casa ante el Borussia Mönchengladbach en la última fecha, quedando penúltimo con 31 puntos a dos puntos del FC Köln, que finalizó 16.º En la temporada 2021 se dio la particularidad de que tanto el Werder Bremen como su clásico rival, el Hamburgo SV, dos clubes históricos de Alemania, se hayan enfrentado en segunda división.

[19]​ Esto fue un cambio radical pues encarrilaron 10 partidos seguidos invictos ganando 9 de estos.

Fue un candidato para acoger partidos en la Copa Mundial de Fútbol 2006 disputada en Alemania, pero finalmente se rechazó la idea.

[23]​[24]​ En este momento se están llevando a cabo obras de remodelación en el estadio.

El objetivo es convertirlo en un espacio únicamente dedicado al fútbol: se van a acercar las gradas al campo de modo que los espectadores estén más cercanos al mismo, y por tanto se va a eliminar el espacio existente entre los asientos y el terreno de juego en los fondos, añadiendo también una tercera grada.

La afición del Werder Bremen cuenta con algunos grupos ultras como Recaille Verte[29]​ o The Infamous Youth, que se suelen situar en la conocida como "Ostkurve" cada partido.

[31]​ El himno oficial del Werder Bremen se conoce como "Lebenslang Grün-Weiß" (Larga vida al verde-blanco).

También hay animadversión hacia otros clubes, donde destaca en particular el Bayern de Múnich por ser el equipo más laureado del fútbol alemán por delante del Werder Bremen y por la importancia que suelen tener los partidos ante ellos, que generalmente se consideran como uno de los grandes encuentros del país o incluso como el gran clásico de la liga.

[44]​ El primer equipo femenino es parte de SV Werder Bremen GmbH & Co.

[46]​ El mejor resultado de la temporada maestra ha anotando a Tomi Nybäck con 10 puntos en 13 partidas y Gennady Fish 11.5 desde 13.

Allí MegaBit (Xbox) derrotó a su compañero de equipo MoAuba (PlayStation) en una pura "final del Bremen", quienes se habían clasificado para la final al ganar sus respectivos torneos de consolas.