Actualmente se encuentra libre tras dirigir al FC Haka Valkeakoski de la Veikkausliiga, la máxima categoría finlandesa.

Tres años después, se incorporó al club holandés Willem II, donde militó cuatro temporadas.

En 1999 fue fichado por el Liverpool,[1]​ donde tuvo gran éxito, llegando incluso a ser capitán del equipo.

En la temporada 2004/05 obtuvo la Champions League luego de una memorable final frente al AC Milan, convirtiéndose después de Jari Litmanen en el segundo futbolista finlandés en ganar el título más valorado del fútbol europeo.

En la Bundesliga 2013-14 fue de más a menos: el equipo terminó la primera vuelta como 2.º clasificado, pero luego enlazó una mala racha de resultados y Hyypiä fue despedido tras una derrota la jornada 29 que dejaba al equipo en 5.ª posición (la primera que no da acceso a la Champions).