En 1754 los mercedarios tuvieron que entregar sus doctrinas al clero secular y San Gaspar pasó a ser parte del curato de Malacatán en la Provincia y Alcaldía Mayor de Totonicapam.

[5]​ Este estado fue recuperado por la fuerza y reintegrado al Estado de Guatemala por el general conservador Rafael Carrera en 1840.

Aunque se trata de entidades autónomas, se encuentran sujetos a la legislación nacional y las principales leyes que los rigen desde 1985 son: El gobierno de los municipios está a cargo de un Concejo Municipal[9]​ mientras que el código municipal —ley ordinaria que contiene disposiciones que se aplican a todos los municipios— establece que «el concejo municipal es el órgano colegiado superior de deliberación y de decisión de los asuntos municipales […] y tiene su sede en la circunscripción de la cabecera municipal»; el artículo 33 del mencionado código establece que «[le] corresponde con exclusividad al concejo municipal el ejercicio del gobierno del municipio».

[10]​ El concejo municipal se integra con el alcalde, los síndicos y concejales, electos directamente por sufragio universal y secreto para un período de cuatro años, pudiendo ser reelectos.

Los alcaldes que ha habido en el municipio son: San Gaspar Ixchil fue fundado durante la época colonial; el documento más antiguo en el que se menciona el poblado de San Gaspar Ixchil es el que realizó la Audiencia de Guatemala en el sigloxvi en los años 1558 a 1577.

[12]​ En su visita pastoral de 1770, el arzobispo Pedro Cortés y Larraz reportó que en San Gaspar Ixchil vivían solamente familias indígenas.