Alumno de Piero Bellugi, Marzio Conti comenzó muy pronto a ser nombrado director titular en varias orquestas italianas y del extranjero, y desde entonces ha venido desarrollando una actividad que lo lleva constantemente a dirigir prestigiosas orquestas y teatros en todo el mundo, variando del repertorio sinfónico al operístico; es muy habitual también su colaboración con las más importantes compañías de ballet.
Son numerosas sus grabaciones para algunos de los mejores sellos discográficos internacionales.
Entre los solistas notables con los que ha colaborado están Barbara Hendricks, Bryn Terfel, Mariella Devia, Misha Maisky, Midori, Natalia Gutman, Lynn Harrell, Gary Hoffman, Renato Bruson, Rudolph Buchbinder, Katia y Marielle Labeque, Elisso Virssaladze, Leo Nucci, Sabine Mayer Jean-Pierre Rampal, Maurice André, Maurice Bourgue, Max Chamaiou, Brigitte Engerer, Javier De Maistre.
Ha trabajado con los bailarines y coreógrafos Carla Fracci, Yuri Grigorovich, Patrice Bart, Roland Petit, Frederic Flamand, Jean-Christophe Maillot, Alexei Ratmansky; y directores escénicos como Calisto Bieto, Emilio Sagi, La Fura del Baus, Lindsay Kemp, Ugo Gregoretti.
Desde 2014, colabora como director invitado y profesor en Jacob School of Music, Indiana University, Bloomington y es director invitado, desde 2017, del Festival AIMS en Graz.