Nacido en Newark, Nueva Jersey, McGregor actuó en 55 filmes estrenados entre 1922 y 1936.
Su última película muda fue Tropical Nights, de Elmer Clifton (con Patsy Ruth Miller y Russell Simpson), estrenada en 1928.
Entre sus otras películas destacan The Circle (1925, de Frank Borzage, con Eleanor Boardman), Lady of the Night (1925, de Monta Bell, con Norma Shearer) y A Million Bid (1927, de Michael Curtiz, con Dolores Costello y Warner Oland).
Malcolm McGregor falleció en 1945 en Hollywood, California, a causa de las quemaduras sufridas en un fuego ocurrido en su domicilio y provocado por un cigarrillo mientras él dormía.
Fue enterrado en el Cementerio Forest Lawn Memorial Park, en Glendale (California).