En Mocoa se halla la Concatedral de San Miguel Arcángel.
En 2021 en la diócesis existían 39 parroquias agrupadas en 5 vicarías: Guadalupe, Perpetuo Socorro, San Mateo, Doce Apósteles y Santísima Trinidad.
La nueva prefectura comprendía un inmenso territorio formado por los territorios de los actuales departamentos de Caquetá, Putumayo y Amazonas.
El vicario apostólico no tenía sede fija, residiendo no sólo en Sibundoy, sino también en Mocoa, Florencia y Leticia.
[7] En 1968 los capuchinos, que habían iniciado la misión del Caquetá, dieron paso a los misioneros redentoristas.