Se encuentra entre Macizo Colombiano y el Piedemonte Amazónico en la llamada Bota Caucana.

Por este inhóspito lugar se abrieron paso desde Pitalito (Huila) internándose en la selva virgen utilizando hachas y machetes.

A medida que avanzaba la construcción de la carretera también se fueron formando nuevos caseríos o aldeas, es así como en 1953 se funda la vereda La Petrolera, a 10 kilómetros de Santo Domingo.

La escuela fue fundada al año siguiente bajo el liderazgo de la profesora Carlina Hernández.

[1]​ Fray Montclar tuvo un impacto fundamental en el desarrollo y conocimiento de la zona.

Durante 19 años se detuvo la construcción de la carretera, facilitando el asentamiento en San Juan.

Geográficamente se ubica en plena vía a Mocoa, por lo que funciona como punto medio entre la población que habita en la zona baja y la zona alta de Media Bota Caucana.

En 1969 llega a la región el Padre Redentorista José Restrepo López, mediante el convenio denominado 'Contrato de Escuelas Nacionales, las escuelas pertenecían al Vicariato de Sibundoy en ese momento.

Bajo el liderazgo de este sacerdote se produjeron grandes avances en la región.

[1]​ Montclar mediante un mapa llamó la atención en Popayán, capital del departamento, e hizo que el territorio tuviera reconocimiento gubernamental.

Ayudó a la separación de cierta población que habitaba en el caserío La Petrolera y creó el caserío La Quebradona, con su respectiva escuela construida en material, la primera maestra fue Alicia Castaño Molina.

En dirección Pitalito – Mocoa los senderos son en su totalidad: Santo Domingo, La Petrolera, La Quebradona, La Esmeralda, Santa María, La Florida, San Eduardo, Las Palmeras, San Juan, Sajonia, Buenos Aires y Betania.

Los árboles fueron talados y vendidos a intermediarios que llegaron con camiones y los cargaron al interior del país, para ser vendidos en Cali, Valle del Cauca, a la empresa Cartones de Colombia, actualmente propiedad de la transnacional Smurfit Kappa.

Los ancianos cuentan que cuando se asentaron por primera vez en el territorio, llovió durante un año seguido.

Económicamente, el cultivo y cosecha del lulo significó la acumulación de capital para los colonos campesinos que habitaban la región.

Esta era una ocupación puramente masculina, al igual que la extracción de madera.

Las principales ocupaciones según el censo ocupacional son agricultura, empleado privado, empleado público, comerciantes y madereros, además de las mujeres amas de casa que tienen el mayor número con 238, también hay panel trabajadores, recicladores, cafetaleros y cañeros.

[3]​ [4]​ San Juan de Villalobos está habitado por una población mixta, incluyendo campesinos, afrocolombianos e indígenas.

No existe camino para comunicarse directamente con Santa Rosa, ya que su única vía de acceso al Departamento del Cauca es a través de la carretera Pitalito (Huila) – Mocoa (Putumayo).