Hijo de Eduardo Juan Macaya Zentilli[4] y María Teresa Danús Larroulet.
Estuvo casado con la abogada Constanza del Pilar Farías Prieto, en el tiempo en que fue investigada por emitir boletas falsas para SQM por 5 millones de pesos en 2012,[5] más en agosto de 2021 y debido a la inexistencia de una querella por parte del SII, la fiscalía decide no perseverar en la investigación existente en su contra.
Su tesis versó sobre "Las denominaciones de origen en la legislación nacional, es especial en la industria vitivinícola".
En el año 2003 cursó un diplomado en Vino Chileno, Producción, Elaboración y Degustación, en la Universidad Católica de Chile.
Entre 2005 y 2006 participó un diplomado en Reforma Procesal Penal en la Universidad de Valparaíso.
Es socio del estudio jurídico Long y Macaya Abogados de Santiago (2008).
Además formó parte del comité parlamentario de la UDI.
[8][9][10] Macaya también ha sido acusado de dispersar fake news en diversas oportunidades.
[11][12][13] En noviembre del mismo año, declaró en el programa de televisión Tolerancia cero una serie de afirmaciones falsas en contra de Izkia Siches, médico y vocera del candidato presidencial Gabriel Boric, que fueron desmentidas por ésta en redes sociales, acusándole a su vez de instalar «una vez más el miedo y la mentira».
[16] Javier declaró ese mismo día que las acusaciones eran falsas.