Su origen es incierto, pero están señalados, por Maturanzio y por la antigua tradición popular, entre las familias de noble linaje militar de origen germánico que descendieron a Italia en el séquito del emperador Federico I Barbarroja.
En 1416, Braccio da Montone nombró señor feudal de Cannara a Malatesta I.
Se construyó una imponente casa señorial como residencia privada para la familia,[5] de la que hoy sólo queda la parte incorporada en la Rocca Paolina.
En cambio, todavía se pueden ver los palacios Baglioni de Spello, Bettona y Torgiano.
Astorre I Baglioni, inmediatamente después el matrimonio público con Lavinia Colonna celebrado para sancionar su ascenso al poder, fue asesinado por Grifonetto Baglioni, hijo de Atalanta y Grifone, segundo hijo de Braccio.
En ese mismo año, la residencia de Braccio fue demolida para dar paso a la fortaleza diseñada por Antonio da Sangallo el Joven en la petición del Papa Pablo III.
[9] Los Baglioni actuales descienden de Percivalle di Guido, viviendo en Florencia, Ferrara y en su ancestral Perugia.
[10] Hoy dedicados a las artes y las ciencias, hace tiempo que dejaron de ser líderes.
Entre estos se encuentran Pietro alias Melindo Turrenio (literario), Benedetto (filósofo), Astorre (historiador), Enzo (grabador - pintor).