El Campeonato de Fútbol de Tercera División 1969, fue la edición número 46 de Tercera División de Costa Rica en disputarse, organizada por la FEDEFUTBOL.
Este campeonato constó de 77 equipos debidamente inscritos en el Campeonato Nacional de Terceras Divisiones (Segunda División de Ascenso).
Se jugaron dos vueltas, en donde los equipos debían enfrentarse todos contra todos.
Fue la Selección de San Rafael de Heredia, conocido como el Real Deportivo Rafaeleño quien le gana la final a Golfito F.C y alcanza el cetro; subiendo a la segunda división.
Consultado en agosto del 2012.