San Isidro tuvo como antecedentes al Club Deportivo Quesada, escuadra que militaba en los torneos Interdistritales.
Y los ciudadanos isidreños se interesaron por constituir un equipo que los representara en los torneos cantonales; utilizando como base las juveniles del cantón para competir en las terceras divisiones.
Ya en 1976 el club logra el torneo distrital de fútbol y un año después ingresan a la 3.ª.
Sin embargo, es hasta 1981 que alcanza su primer logro; un campeonato regional júvenil de cuarta división y un 4.º puesto a nivel nacional.
Pero por asuntos resueltos por la comisión de competición, la Asociación Deportivo Quesada juega la eliminatoria provincial.