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Variantes del SARS-CoV-2

Mutaciones positivas, negativas y neutras durante la evolución de coronavirus como el SARS-CoV-2.

Las variantes del coronavirus 2 del síndrome respiratorio agudo severo ( SARS-CoV-2 ) son virus que, si bien son similares al original, tienen cambios genéticos que son de suficiente importancia como para llevar a los virólogos a etiquetarlos por separado. El SARS-CoV-2 es el virus que causa la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19). Se ha declarado que algunos son de particular importancia debido a su potencial de mayor transmisibilidad, [1] mayor virulencia o reducción de la eficacia de las vacunas contra ellos. [2] [3] Estas variantes contribuyen a la continuación de la pandemia de COVID-19 .

En marzo de 2024, solo Omicron está designado como variante circulante preocupante por la Organización Mundial de la Salud . [4] [ verificación fallida ]

Descripción general

No se ha identificado el origen del SARS-CoV-2. [5] Sin embargo, la aparición del SARS-CoV-2 puede haber sido el resultado de eventos de recombinación entre un coronavirus similar al SARS de murciélago y un coronavirus de pangolín a través de la transmisión entre especies. [6] [7] Los primeros genomas virales del SARS-CoV-2 disponibles se recolectaron de pacientes en diciembre de 2019, y los investigadores chinos compararon estos primeros genomas con cepas de coronavirus de murciélago y pangolín para estimar el tipo ancestral de coronavirus humano; el tipo de genoma ancestral identificado se denominó "S" y su tipo derivado dominante se denominó "L" para reflejar los cambios de aminoácidos mutantes. De forma independiente, investigadores occidentales llevaron a cabo análisis similares pero denominaron el tipo ancestral "A" y el tipo derivado "B". El tipo B mutó en otros tipos, incluido el B.1, que es el antepasado de las principales variantes de preocupación mundial, etiquetadas en 2021 por la OMS como variantes alfa , beta , gamma , delta y omicrón . [8] [9] [10]

Al principio de la pandemia, el número relativamente bajo de infecciones (en comparación con etapas posteriores de la pandemia) dio lugar a menos oportunidades de mutación del genoma viral y, por tanto, a menos oportunidades de aparición de variantes diferenciadas. [11] Dado que la aparición de variantes era más rara, la observación de mutaciones de la proteína S en la región del dominio de unión al receptor (RBD) que interactúa con ACE2 tampoco fue frecuente. [12]

Con el paso del tiempo, la evolución del genoma del SARS-CoV-2 (mediante mutaciones aleatorias) llevó a que se seleccionaran de forma natural especímenes mutantes del virus (es decir, variantes genéticas), que se consideraban más transmisibles. En particular, se observó que tanto la variante Alfa como la Delta eran más transmisibles que las cepas virales identificadas previamente. [13]

Algunas variantes del SARS-CoV-2 se consideran preocupantes ya que mantienen (o incluso aumentan) su capacidad de replicación frente al aumento de la inmunidad de la población, [14] ya sea mediante la recuperación de la infección o mediante la vacunación. Algunas de las variantes preocupantes muestran mutaciones en el RBD de la proteína S. [15]

La siguiente tabla presenta información y el nivel de riesgo relativo [16] para las variantes preocupantes (VOC) que circulan actualmente y anteriormente. [a] Los intervalos asumen un nivel de confianza o credibilidad del 95% , a menos que se indique lo contrario. Actualmente, todas las estimaciones son aproximaciones debido a la limitada disponibilidad de datos para los estudios. Para Alfa, Beta, Gamma y Delta, no hay cambios en la precisión de la prueba , [20] [25] y algunos anticuerpos monoclonales retienen la actividad de los anticuerpos neutralizantes . [18] [26] Las pruebas de PCR continúan detectando la variante Omicron. [27]

  Riesgo muy alto   Alto riesgo   Riesgo medio   Riesgo bajo   Riesgo desconocido

  1. ^ Eficacia de la infección natural contra la reinfección cuando esté disponible.
  2. ^ del 7 de febrero al 22 de junio de 2021, Ontario. CFR 0,04% para el grupo de <50 años no vacunados, 6,5% para el grupo de >50 años no vacunados [33]
  3. ^ ab Las diferencias pueden deberse a diferentes políticas e intervenciones adoptadas en cada área estudiada en diferentes momentos, a la capacidad del sistema de salud local o a diferentes variantes que circulan en el momento y lugar del estudio.
  4. ^ 1 de abril - 6 de junio de 2021, Escocia. [32] Otro estudio preliminar en Ontario encontró que la hospitalización por Delta aumentó en un 120% en relación con los linajes sin VOC . [ANTES DE CRISTO]
  5. ^ El estudio en Israel rastreó a 46.035 personas recuperadas no vacunadas y a 46.035 vacunadas de la misma distribución de edad, para comparar la aparición de infecciones en el período de seguimiento. Se registraron 640 contagios en el grupo vacunado y 108 contagios en el grupo recuperado.
  6. ^ Neutralización moderadamente reducida con Covaxin. [35]
  7. ^ abc B.1.1.7 con E484K se supone que solo difiere de B.1.1.7 en la actividad de los anticuerpos neutralizantes. [21]
  8. ^ desde el 23 de noviembre de 2020 al 31 de enero de 2021, Inglaterra. [44] CFR 0,06% para el grupo de <50 años, 4,8% para el grupo de >50 años [33]
  9. ^ El intervalo de confianza o credibilidad informado tiene una probabilidad baja, por lo que el valor estimado solo puede entenderse como posible, no seguro ni probable.
  10. ^ Marzo de 2020 - febrero de 2021, Manaos. [C]
  11. ^ Excepto Pfizer-BioNTech. [20]
  12. ^ Oxford-AstraZeneca, Novavax.

Nomenclatura

Diagrama de árbol de linajes del SARS-CoV-2 según el sistema de nomenclatura Pango.

Las variantes del SARS-CoV-2 se agrupan según su linaje y mutaciones componentes. [14] Muchas organizaciones, incluidos gobiernos y medios de comunicación, se refirieron coloquialmente a variantes preocupantes según el país en el que se identificaron por primera vez. [60] [61] [62] Después de meses de discusiones, la Organización Mundial de la Salud anunció nombres de letras griegas para cepas importantes el 31 de mayo de 2021, [63] para que se pudiera hacer referencia a ellas de una manera simple, fácil de decir y moda no estigmatizante. [64] [65] Es posible que esta decisión se haya tomado parcialmente debido a las críticas de los gobiernos sobre el uso de nombres de países para referirse a variantes del virus; La OMS mencionó la posibilidad de que mencionar nombres de países cause estigma. [66] Después de usar todas las letras del Alfa al Mu (ver más abajo), en noviembre de 2021 la OMS se saltó las dos siguientes letras del alfabeto griego, Nu y Xi, y usó Omicron, lo que generó especulaciones de que se omitió a Xi para evitar ofender a los chinos . líder Xi Jinping . [67] La ​​OMS dio como explicación que Nu se confunde muy fácilmente con "nuevo" y Xi es un apellido común . [67] En el caso de que la OMS utilice la totalidad del alfabeto griego, la agencia consideró nombrar variantes futuras en honor a las constelaciones . [68]

Varias variantes del SARS-CoV-2 que fueron informadas oficialmente por los CDC y NIH en mayo de 2021 en relación con las mutaciones L452R y E484K

Linajes y clados

Si bien existen miles de variantes del SARS-CoV-2, [69] los subtipos del virus se pueden clasificar en grupos más grandes, como linajes o clados . [c] Se han propuesto tres nomenclaturas principales de uso general [70] :

Cada instituto nacional de salud pública también puede instituir su propio sistema de nomenclatura con el fin de rastrear variantes específicas. Por ejemplo, Public Health England designó cada variante rastreada por año, mes y número en el formato [AAAA] [MM]/[NN], anteponiendo 'VUI' o 'VOC' para una variante bajo investigación o una variante preocupante , respectivamente. [19] Este sistema ahora ha sido modificado y ahora usa el formato [AA] [MMM]-[NN], donde el mes se escribe usando un código de tres letras. [19]

Clasificación de variantes

Las variantes que parecen cumplir uno o más criterios específicos considerados durante la pandemia de COVID-19 pueden denominarse "variantes de interés" o "variantes bajo investigación" ("VUI") en espera de la verificación y validación de estas propiedades. Una vez validadas, las organizaciones de seguimiento, como los CDC de EE. UU., pueden cambiar el nombre de las variantes de interés/VUI a "variantes preocupantes". [77] [78] [79] Una categoría relacionada es "variante de altas consecuencias", utilizada por los CDC si hay evidencia clara de que la efectividad de las medidas de prevención o intervención para una variante particular se reduce sustancialmente. [80]

Secuencia de referencia

Como actualmente no se sabe cuándo ocurrió el caso índice o "paciente cero", la elección de la secuencia de referencia para un estudio determinado es relativamente arbitraria, y las elecciones de diferentes estudios de investigación notables varían de la siguiente manera:

Los investigadores consideran que la variante muestreada e identificada por primera vez en Wuhan, China, difiere del genoma progenitor en tres mutaciones. [81] [87] Posteriormente, han evolucionado muchos linajes distintos de SARS-CoV-2. [75]

Criterios de notabilidad

Los virus generalmente adquieren mutaciones con el tiempo, dando lugar a nuevas variantes. Cuando una nueva variante parece estar creciendo en una población, se la puede etiquetar como "variante emergente". En el caso del SARS-CoV-2, los nuevos linajes suelen diferir entre sí en apenas unos pocos nucleótidos. [14]

Algunas de las posibles consecuencias de las variantes emergentes son las siguientes: [42] [88]

Las variantes que parezcan cumplir uno o más de estos criterios pueden denominarse "variantes bajo investigación" o "variantes de interés" en espera de la verificación y validación de estas propiedades. La característica principal de una variante de interés es que muestra evidencia que demuestra que es la causa de una mayor proporción de casos o grupos de brotes únicos; sin embargo, también debe tener una prevalencia o expansión limitada a nivel nacional, o la clasificación se elevaría a " variante preocupante ". [19] [78] Si hay evidencia clara de que la efectividad de las medidas de prevención o intervención para una variante particular se reduce sustancialmente, esa variante se denomina "variante de alta consecuencia". [18]

Variantes preocupantes (OMS)

A continuación se enumeran las variantes preocupantes (COV) reconocidas por la Organización Mundial de la Salud a octubre de 2022 . [17] Otras organizaciones como los CDC en los Estados Unidos han utilizado en ocasiones una lista ligeramente diferente; por ejemplo, los CDC redujeron la variante Delta el 14 de abril de 2022, [18] mientras que la OMS lo hizo el 7 de junio de 2022.

Micrografía electrónica de transmisión en falso color de una variante del coronavirus B.1.1.7. Se cree que la mayor transmisibilidad de la variante se debe a cambios en la estructura de las proteínas de pico, que se muestran aquí en verde.

Omicrón

Linaje B.1.1.529

La variante Omicron, conocida como linaje B.1.1.529, fue declarada variante preocupante por la Organización Mundial de la Salud el 26 de noviembre de 2021. [89]

La variante tiene una gran cantidad de mutaciones , algunas de las cuales son preocupantes. Alguna evidencia muestra que esta variante tiene un mayor riesgo de reinfección . Se están realizando estudios para evaluar el impacto exacto sobre la transmisibilidad, la mortalidad y otros factores. [90]

Denominado Omicron por la OMS, [89] [91] fue identificado en noviembre de 2021 en Botswana y Sudáfrica ; [92] un caso había viajado a Hong Kong , [93] [4] [94] un caso confirmado fue identificado en Israel en un viajero que regresaba de Malawi , [95] junto con dos que regresaron de Sudáfrica y uno de Madagascar. [96] Bélgica confirmó el primer caso detectado en Europa el 26 de noviembre de 2021 en una persona que había regresado de Egipto el 11 de noviembre. [97] El Consorcio de Genómica del SARS-CoV-2 de la India (INSACOG) en su boletín de enero de 2022 señaló que Omicron está en transmisión comunitaria en la India, donde los nuevos casos han aumentado exponencialmente. [98]

LICENCIADO EN LETRAS. sublinajes

Según la OMS, BA.1, BA.1.1 y BA.2 eran los sublinajes más comunes de Omicron a nivel mundial en febrero de 2022 . [99] BA.2 contiene 28 cambios genéticos únicos, incluidos cuatro en su proteína de pico, en comparación con BA.1, que ya había adquirido 60 mutaciones desde la cepa ancestral de Wuhan, incluidas 32 en la proteína de pico. [100] BA.2 es más transmisible que BA.1. [101] Estaba causando la mayoría de los casos en Inglaterra a mediados de marzo de 2022 y, a finales de marzo, BA.2 se volvió dominante en los EE. UU. [102] [100] A partir de mayo de 2022 , los sublinajes BA.1 a BA.5, incluidos todos sus descendientes, están clasificados como variantes preocupantes por la OMS, [4] los CDC, [18] y el ECDC [103] ( este último excluye BA.3).

Surgen más sublinajes en 2022

Durante 2022, surgieron varias cepas nuevas en diferentes localidades, incluida XBB.1.5, que evolucionó a partir de la cepa XBB de Omicron. El primer caso de XBB en Inglaterra se detectó a partir de una muestra tomada el 10 de septiembre de 2022 y desde entonces se han identificado más casos en la mayoría de las regiones inglesas. A finales de año, XBB.1.5 representaba el 40,5% de los casos nuevos en Estados Unidos y era la cepa dominante; La variante preocupante BQ.1 rondaba el 18,3% y BQ.1.1 representaba el 26,9% de los casos nuevos, mientras que la cepa BA.5 estaba en declive, con un 3,7%. En esta etapa, era poco común en muchos otros países; por ejemplo, en el Reino Unido representaba alrededor del 7% de los casos nuevos, según los datos de secuenciación de la UKHSA. [104]

El 22 de diciembre de 2022, el Centro Europeo para el Control de Enfermedades escribió en un resumen que las cepas XBB representaron alrededor del 6,5% de los casos nuevos en cinco países de la UE con un volumen suficiente de secuenciación o genotipado para proporcionar estimaciones. [104]

Otros sublinajes surgirán en 2023: EG.5 "Eris", BA.2.86 y JN.1 "Pirola"

Durante 2023, el SARS-CoV-2 siguió circulando entre la población mundial y evolucionando, con una serie de nuevas cepas que acapararon los titulares. Se redujeron las tasas de pruebas, secuenciación y presentación de informes. [105]

EG.5 , una subvariante de XBB.1.9.2 (apodada "Eris" por algunos medios [106] ) surgió en febrero de 2023. [107] El 6  de agosto de 2023, la Agencia de Seguridad Sanitaria del Reino Unido informó que la cepa EG.5 era responsable de uno de cada siete nuevos casos en el Reino Unido durante la tercera semana de julio. [108]

BA.2.86 se detectó por primera vez en una muestra del 24  de julio de 2023 y fue designada como variante bajo seguimiento por la Organización Mundial de la Salud el 17 de agosto de 2023. [109]

JN.1 (a veces denominado "Pirola"), una subvariante de BA.2.86 Omicron, surgió en agosto de 2023 en Luxemburgo. En diciembre de 2023, se había detectado en 12 países, incluidos el Reino Unido y Estados Unidos. [110] [111] El 19 de diciembre, la OMS declaró que JN.1 era una variante de interés independientemente de su cepa original BA.2.86, pero se determinó que el riesgo general para la salud pública era bajo. [112] Dado que JN.1 representa alrededor del 60% de los casos en Singapur, en diciembre de 2023, Singapur e Indonesia recomendaron el uso de máscaras en los aeropuertos. [113] Los CDC estimaron que la variante representó el 44% de los casos en los EE. UU. el 22 de diciembre de 2023 y el 62% de los casos el 5 de enero de 2024. [114]

Al 9 de febrero de 2024 , la OMS estimó que la JN.1 era la variante más prevalente del SARS-CoV-2 (prevalencia del 70% al 90% en cuatro de las seis regiones del mundo; datos insuficientes en las regiones del Mediterráneo Oriental y África). . Se esperaba que el nivel general de inmunidad de la población y la inmunidad de las versiones de refuerzo XBB.1.5 de la vacuna COVID-19 proporcionaran cierta protección (reactividad cruzada) a JN.1. [115]

Variantes de linajes preocupantes bajo seguimiento (OMS)

El 25 de mayo de 2022, la Organización Mundial de la Salud introdujo una nueva categoría para sublinajes potencialmente preocupantes de variantes generalizadas de preocupación, denominada linajes VOC bajo seguimiento (VOC-LUM). Esta decisión se tomó para reflejar que ya en febrero de 2022, más del 98% de todas las muestras secuenciadas pertenecían a la familia Omicron, y ha habido una evolución significativa dentro de esta familia. [4]

Variantes de interés (OMS)

A continuación se enumeran las variantes de interés (VOI) reconocidas por la Organización Mundial de la Salud . [17] Otras organizaciones como los CDC en los Estados Unidos pueden en ocasiones utilizar una lista ligeramente diferente. [18]

A partir del 15 de marzo de 2023 , [117] La ​​OMS define una VOI como una variante "con cambios genéticos que se predicen o se sabe que afectan las características del virus como la transmisibilidad, la virulencia, la evasión de anticuerpos, la susceptibilidad a la terapéutica y la detectabilidad" y que está circulando. más que otras variantes en más de una región de la OMS, hasta tal punto que se puede sugerir un riesgo para la salud pública mundial. [118] Además, la actualización indicaba que "se hará referencia a las VOI utilizando sistemas de nomenclatura científica establecidos, como los utilizados por Nextstrain y Pango". [118]

A 20 de diciembre de 2023 , la OMS enumera XBB.1.5, XBB.1.16, EG.5, BA.2.86 y JN.1 como variantes circulantes de interés. [119]

Variantes bajo seguimiento (OMS)

A continuación se enumeran las variantes bajo seguimiento (VUM) reconocidas por la OMS. Las VUM se definen como variantes con cambios genéticos que se sospecha que afectan las características del virus y algunos indicios de que representan un riesgo futuro, pero con evidencia poco clara de impacto fenotípico o epidemiológico, lo que requiere un mayor seguimiento y una nueva evaluación después de nueva evidencia. [17]

A partir del 21 de noviembre de 2023 , la OMS enumera DV.7, XBB, XBB.1.9.1, XBB.1.9.2, XBB.2.3 como variantes circulantes bajo seguimiento. [4]

Variantes previamente circulantes y anteriormente monitoreadas (OMS)

La OMS define una variante que circulaba anteriormente como una variante que "ha demostrado que ya no representa un riesgo adicional importante para la salud pública mundial en comparación con otras variantes circulantes del SARS-CoV-2", pero que aún así debe ser monitoreada. [4]

El 15 de marzo de 2023, la OMS publicó una actualización sobre el sistema de seguimiento de COV, anunciando que solo a los COV se les asignarán letras griegas. [117]

Variantes preocupantes (VOC) que circulaban anteriormente

Las variantes que se enumeran a continuación habían sido designadas anteriormente como variantes preocupantes, pero fueron desplazadas por otras variantes. En mayo de 2022 , la OMS enumera las siguientes como "variantes preocupantes que circulaban anteriormente": [4]

Alfa (linaje B.1.1.7)

Detectado por primera vez en octubre de 2020 durante la pandemia de COVID-19 en el Reino Unido a partir de una muestra tomada el mes anterior en Kent, [120] el linaje B.1.1.7, [121] denominado variante Alfa por la OMS, se conocía anteriormente como primera variante bajo investigación en diciembre de 2020 (VUI – 202012/01) [122] y posteriormente anotada como VOC-202012/01. [19] También se le conoce como 20I (V1), [28] 20I/501Y.V1 [123] (antes 20B/501Y.V1), [42] [124] [125] o 501Y.V1. [126] De octubre a diciembre de 2020, su prevalencia se duplicó cada 6,5 ​​días, el presunto intervalo generacional. [127] [128] Se correlaciona con un aumento significativo en la tasa de infección por COVID-19 en el Reino Unido , asociado en parte con la mutación N501Y. [127] Hubo cierta evidencia de que esta variante tenía entre un 40% y un 80% más de transmisibilidad (con la mayoría de las estimaciones situadas entre el extremo medio y superior de este rango), [129] [130] y los primeros análisis sugirieron un aumento en la letalidad, [131 ] [132] aunque trabajos posteriores no encontraron evidencia de una mayor virulencia. [133] En mayo de 2021, la variante Alfa se había detectado en unos 120 países. [134]

El 16 de marzo de 2022, la OMS redujo la variante Alfa y sus subvariantes a "variantes preocupantes que circulaban anteriormente". [135] [136]

B.1.1.7 con E484K

La variante de preocupación 21FEB-02 (anteriormente escrita como VOC -202102/02), descrita por Public Health England (PHE) como "B.1.1.7 con E484K" [19] es del mismo linaje en el sistema de nomenclatura Pango, pero tiene una mutación E484K adicional. Al 17 de marzo de 2021, había 39 casos confirmados de VOC -21FEB-02 en el Reino Unido. [19] El 4 de marzo de 2021, los científicos informaron sobre B.1.1.7 con mutaciones E484K en el estado de Oregon . En 13 muestras de prueba analizadas, una tenía esta combinación, que parecía haber surgido de manera espontánea y local, en lugar de ser importada. [137] [138] [139] Otros nombres para esta variante incluyen B.1.1.7+E484K [140] y B.1.1.7 Lineage con S:E484K. [141]

Beta (linaje B.1.351)

El 18 de diciembre de 2020, la variante 501.V2 , también conocida como 501.V2, 20H (V2), [28] 20H/501Y.V2 [123] (anteriormente 20C/501Y.V2), 501Y.V2, [142] VOC-20DEC-02 (anteriormente VOC -202012/02), o linaje B.1.351, [42] se detectó por primera vez en Sudáfrica y fue informado por el departamento de salud del país . [143] La OMS la ha etiquetado como variante Beta. Investigadores y funcionarios informaron que la prevalencia de la variante era mayor entre los jóvenes sin problemas de salud subyacentes y, en comparación con otras variantes, en esos casos resulta con mayor frecuencia en enfermedades graves. [144] [145] El departamento de salud de Sudáfrica también indicó que la variante puede estar impulsando la segunda ola de la epidemia de COVID-19 en el país debido a que la variante se propaga a un ritmo más rápido que otras variantes anteriores del virus. [143] [144]

Los científicos notaron que la variante contiene varias mutaciones que le permiten unirse más fácilmente a las células humanas debido a las siguientes tres mutaciones en el dominio de unión al receptor (RBD) en la glicoproteína de pico del virus: N501Y, [143] [146] K417N y E484K. [147] [148] La mutación N501Y también se ha detectado en el Reino Unido. [143] [149]

El 16 de marzo de 2022, la OMS redujo la variante Beta y sus subvariantes a "variantes preocupantes que circulaban anteriormente". [135] [136]

Gamma (linaje P.1)

La variante Gamma o linaje P.1, denominada Variante de preocupación 21JAN-02 [19] (anteriormente VOC-202101/02) por Public Health England, [19] 20J (V3) [28] o 20J/501Y.V3 [123 ] de Nextstrain , o simplemente 501Y.V3, [126] fue detectado en Tokio el 6 de enero de 2021 por el Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas (NIID). La OMS la ha etiquetado como variante Gamma. La nueva variante se identificó por primera vez en cuatro personas que llegaron a Tokio procedentes del estado brasileño de Amazonas el 2 de enero de 2021. [150] El 12 de enero de 2021, el Centro CADDE Brasil-Reino Unido confirmó 13 casos locales de la nueva variante Gamma en el Selva amazónica. [151] Esta variante del SARS-CoV-2 ha sido denominada linaje P.1 (aunque es descendiente de B.1.1.28, el nombre B.1.1.28.1 [20] [152] no está permitido y, por lo tanto, El nombre resultante es P.1), y tiene 17 cambios de aminoácidos únicos, 10 de los cuales en su proteína de pico, incluidas las tres mutaciones relacionadas: N501Y, E484K y K417T. [151] [152] [153] [154] : Figura 5 

Las mutaciones N501Y y E484K favorecen la formación de un complejo estable RBD-hACE2, mejorando así la afinidad de unión de RBD a hACE2. Sin embargo, la mutación K417T favorece la formación de complejos entre RBD y hACE2, que se ha demostrado que reduce la afinidad de unión. [1]

La nueva variante estuvo ausente en las muestras recolectadas de marzo a noviembre de 2020 en Manaos , estado de Amazonas, pero se detectó en la misma ciudad en el 42% de las muestras del 15 al 23 de diciembre de 2020, seguida del 52,2% entre el 15 y el 31 de diciembre y 85,4 % entre el 1 y el 9 de enero de 2021. [151] Un estudio encontró que las infecciones por Gamma pueden producir casi diez veces más carga viral en comparación con las personas infectadas por uno de los otros linajes identificados en Brasil (B.1.1.28 o B.1.195). ). Gamma también mostró una transmisibilidad 2,2 veces mayor con la misma capacidad de infectar tanto a adultos como a personas mayores, lo que sugiere que los linajes P.1 y similares a P.1 tienen más éxito en infectar a humanos más jóvenes independientemente del sexo. [155]

Un estudio de muestras recolectadas en Manaos entre noviembre de 2020 y enero de 2021 indicó que la variante Gamma es entre 1,4 y 2,2 veces más transmisible y demostró ser capaz de evadir entre el 25 y el 61% de la inmunidad heredada de enfermedades anteriores por coronavirus, lo que lleva a la posibilidad de reinfección después de recuperarse de una infección anterior por COVID-19. En cuanto a la tasa de mortalidad, también se encontró que las infecciones por Gamma eran entre un 10% y un 80% más letales. [156] [157] [158]

Un estudio encontró que las personas completamente vacunadas con Pfizer o Moderna tienen un efecto de neutralización significativamente menor contra Gamma, aunque el impacto real en el curso de la enfermedad es incierto. Un estudio previo a la impresión de la Fundación Oswaldo Cruz publicado a principios de abril encontró que el desempeño en el mundo real de las personas con la dosis inicial de la vacuna Coronavac de Sinovac tenía una tasa de eficacia de aproximadamente el 50%. Esperaban que la eficacia fuera mayor después de la segunda dosis. En julio de 2021, el estudio está en curso. [159]

Los datos preliminares de dos estudios indican que la vacuna Oxford-AstraZeneca es eficaz contra la variante Gamma, aunque aún no se ha publicado el nivel exacto de eficacia. [160] [161] Los datos preliminares de un estudio realizado por el Instituto Butantan sugieren que CoronaVac también es eficaz contra la variante Gamma y, a julio de 2021, aún no se ha ampliado para obtener datos definitivos. [162]

El 16 de marzo de 2022, la OMS redujo la variante Gamma y sus subvariantes a "variantes preocupantes que circulaban anteriormente". [135] [136]

Delta (linaje B.1.617.2)

La variante Delta, también conocida como B.1.617.2, G/452R.V3, 21A [28] o 21A/S:478K, [123] fue una variante dominante a nivel mundial que se extendió a al menos 185 países. [163] Fue descubierto por primera vez en la India . Descendiente del linaje B.1.617, que también incluye la variante Kappa bajo investigación, fue descubierta por primera vez en octubre de 2020 y desde entonces se ha extendido internacionalmente. [164] [165] [166] [167] [168] El 6 de mayo de 2021, los científicos británicos declararon B.1.617.2 (que en particular carece de mutación en E484Q) como una "variante preocupante", etiquetándola como VOC-21APR- 02, después de que señalaron evidencia de que se propaga más rápidamente que la versión original del virus y podría propagarse más rápido o tan rápido como Alpha. [169] [21] [170] [171] Lleva mutaciones L452R y P681R en Spike; [30] a diferencia de Kappa, lleva T478K pero no E484Q.

El 3 de junio de 2021, Public Health England informó que doce de las 42 muertes por la variante Delta en Inglaterra se produjeron entre personas completamente vacunadas y que se estaba propagando casi el doble de rápido que la variante Alfa. [172] También el 11 de junio, el Centro Médico Foothills en Calgary, Canadá, informó que la mitad de sus 22 casos de la variante Delta ocurrieron entre personas completamente vacunadas. [173]

En junio de 2021 comenzaron a aparecer informes de una variante de Delta con la mutación K417N. [174] La mutación, también presente en las variantes Beta y Gamma, generó preocupación sobre la posibilidad de una eficacia reducida de las vacunas y los tratamientos con anticuerpos y un mayor riesgo de reinfección. [175] La variante, denominada "Delta con K417N" por Public Health England, incluye dos clados correspondientes a los linajes Pango AY.1 y AY.2. [176] Ha sido apodado "Delta plus" [177] de "Delta plus K417N". [178] El nombre de la mutación, K417N, se refiere a un intercambio mediante el cual la lisina (K) es reemplazada por asparagina (N) en la posición 417. [179] El 22 de junio, el Ministerio de Salud y Bienestar Familiar de la India declaró el "Delta plus "La variante de COVID-19 es una variante preocupante, después de que se informaran 22 casos de la variante en la India. [180] Después del anuncio, los principales virólogos dijeron que no había datos suficientes para respaldar el etiquetado de la variante como una variante distinta de preocupación, señalando el pequeño número de pacientes estudiados. [181] En el Reino Unido, en julio de 2021, se identificó AY.4.2. Además de las mencionadas anteriormente, también se ganó el sobrenombre de 'Delta Plus', debido a sus mutaciones adicionales, Y145H y A222V. Estos no son exclusivos de ella, pero la distinguen de la variante Delta original. [182]

El 7 de junio de 2022, la OMS redujo la variante Delta y sus subvariantes a "variantes preocupantes que circulaban anteriormente". [136] [183]

Variantes de interés (VOI) que circularon previamente

Épsilon (linajes B.1.429, B.1.427, CAL.20C)

La variante o linaje Epsilon B.1.429, también conocida como CAL.20C [184] o CA  VUI1, [185] 21C [28] o 20C/S:452R, [123] se define por cinco mutaciones distintas (I4205V y D1183Y en el gen ORF1ab , y S13I, W152C, L452R en el gen S de la proteína de pico), de los cuales el L452R (anteriormente también detectado en otros linajes no relacionados) fue de particular preocupación. [55] [186] Del 17 de marzo al 29 de junio de 2021, los CDC enumeraron la B.1.429 y la B.1.427 relacionada como "variantes preocupantes". [30] [187] [188] [189] A partir de julio de 2021, Epsilon ya no es considerada una variante de interés por la OMS, [17] ya que fue superada por Alpha. [190]

Desde septiembre de 2020 hasta enero de 2021, fue entre un 19% y un 24% más transmisible que variantes anteriores en California. La neutralización contra él mediante anticuerpos procedentes de infecciones naturales y vacunaciones se redujo moderadamente, [191] pero siguió siendo detectable en la mayoría de las pruebas de diagnóstico. [192]

Epsilon (CAL.20C) fue observado por primera vez en julio de 2020 por investigadores del Centro Médico Cedars-Sinai , California , en una de las 1230 muestras de virus recolectadas en el condado de Los Ángeles desde el inicio de la epidemia de COVID-19 . [193] No se volvió a detectar hasta septiembre, cuando reapareció entre las muestras en California, pero las cifras se mantuvieron muy bajas hasta noviembre. [194] [195] En noviembre de 2020, la variante Epsilon representó el 36 por ciento de las muestras recolectadas en el Centro Médico Cedars-Sinai, y en enero de 2021, la variante Epsilon representó el 50 por ciento de las muestras. [186] En un comunicado de prensa conjunto de la Universidad de California, San Francisco , el Departamento de Salud Pública de California y el Departamento de Salud Pública del Condado de Santa Clara , [196] la variante también se detectó en varios condados del norte de California. De noviembre a diciembre de 2020, la frecuencia de la variante en casos secuenciados del norte de California aumentó del 3% al 25%. [197] En una preimpresión, se describe que CAL.20C pertenece al clado 20C y contribuye con aproximadamente el 36 % de las muestras, mientras que una variante emergente del clado 20G representa aproximadamente el 24 % de las muestras en un estudio centrado en el sur de California. Sin embargo, tenga en cuenta que en los EE. UU. en su conjunto, el clado 20G predomina a partir de enero de 2021. [55] Tras el creciente número de Epsilon en California, la variante se ha detectado con diferentes frecuencias en la mayoría de los estados de los EE. UU. Se han detectado pequeñas cantidades en otros países de América del Norte y en Europa, Asia y Australia. [194] [195] Después de un aumento inicial, su frecuencia disminuyó rápidamente a partir de febrero de 2021, ya que estaba siendo superada por Alpha, más transmisible . En abril, Epsilon seguía siendo relativamente frecuente en algunas partes del norte de California, pero prácticamente había desaparecido del sur del estado y nunca había podido establecerse en ningún otro lugar; sólo el 3,2% de todos los casos en los Estados Unidos fueron Epsilon, mientras que más de dos tercios fueron Alpha. [190]

Zeta (linaje P.2)

La variante Zeta o linaje P.2, un sublinaje de B.1.1.28 como Gamma (P.1), fue detectada por primera vez en circulación en el estado de Río de Janeiro ; alberga la mutación E484K, pero no las mutaciones N501Y y K417T. [154] Evolucionó de forma independiente en Río de Janeiro sin estar directamente relacionado con la variante Gamma de Manaos. [151] Aunque anteriormente Zeta fue etiquetada como una variante de interés, a partir de julio de 2021, la OMS ya no la considera como tal. [17]

Eta (linaje B.1.525)

La variante o linaje Eta B.1.525, también llamada VUI -21FEB-03 [19] (anteriormente VUI-202102/03) por Public Health England (PHE) y anteriormente conocida como UK1188, [19] 21D [28] o 20A/ S:484K, [123] no porta la misma mutación N501Y que se encuentra en Alpha , Beta y Gamma , pero porta la misma mutación E484K que se encuentra en las variantes Gamma, Zeta y Beta, y también porta la misma deleción ΔH69/ΔV70. (una eliminación de los aminoácidos histidina y valina en las posiciones 69 y 70) como se encuentra en Alpha, variante N439K (B.1.141 y B.1.258) y variante Y453F ( Grupo 5 ). [198] Eta se diferencia de todas las demás variantes por tener tanto la mutación E484K como una nueva mutación F888L (una sustitución de fenilalanina (F) por leucina (L) en el dominio S2 de la proteína de pico). Al 5 de marzo de 2021, se había detectado en 23 países. [199] [200] [201] También se ha informado en Mayotte , el departamento/región de ultramar de Francia. [199] Los primeros casos se detectaron en diciembre de 2020 en el Reino Unido y Nigeria, y hasta el 15 de febrero de 2021, había ocurrido con la frecuencia más alta entre las muestras en este último país. [201] Al 24 de febrero se encontraron 56 casos en el Reino Unido. [19] Dinamarca, que secuencia todos sus casos de COVID-19, encontró 113 casos de esta variante del 14 de enero al 21 de febrero de 2021, de los cuales siete estaban directamente relacionados con viajes al extranjero a Nigeria. [200]

En julio de 2021, los expertos del Reino Unido lo están estudiando para determinar el riesgo que podría representar. Actualmente se considera una "variante bajo investigación", pero, a la espera de más estudios, puede convertirse en una " variante preocupante ". Ravi Gupta , de la Universidad de Cambridge , dijo en una entrevista a la BBC que el linaje B.1.525 parecía tener "mutaciones significativas" ya observadas en algunas de las otras variantes más nuevas, lo que significa que su efecto probable es hasta cierto punto más predecible. [202]

Theta (linaje P.3)

El 18 de febrero de 2021, el Departamento de Salud de Filipinas confirmó la detección de dos mutaciones de COVID-19 en Visayas Central después de que se enviaran muestras de pacientes para someterlos a la secuenciación del genoma. Posteriormente, las mutaciones se denominaron E484K y N501Y, y se detectaron en 37 de 50 muestras, y ambas mutaciones coexistieron en 29 de ellas. [203]

El 13 de marzo, el Departamento de Salud confirmó que las mutaciones constituyen una variante que fue designada como linaje P.3. [204] El mismo día, también confirmó el primer caso de COVID-19 causado por la variante Gamma en el país. Filipinas tenía 98 casos de la variante Theta el 13 de marzo. [205] El 12 de marzo se anunció que Theta también se había detectado en Japón. [206] [207] El 17 de marzo, el Reino Unido confirmó sus dos primeros casos, [208] donde PHE lo denominó VUI-21MAR-02. [19] El 30 de abril de 2021, Malasia detectó 8 casos de la variante Theta en Sarawak. [209]

A partir de julio de 2021, la OMS ya no considera a Theta como una variante de interés. [17]

Iota (linaje B.1.526)

En noviembre de 2020, se descubrió una variante mutante en la ciudad de Nueva York, que recibió el nombre de linaje B.1.526. [210] Al 11 de abril de 2021, la variante se ha detectado en al menos 48 estados de EE. UU. y 18 países. En un patrón que refleja a Epsilon, Iota inicialmente pudo alcanzar niveles relativamente altos en algunos estados, pero en mayo de 2021 fue superado por Delta y Alpha, más transmisibles. [190]

Kappa (linaje B.1.617.1)

La variante Kappa [17] es uno de los tres sublinajes del linaje B.1.617 . También se conoce como linaje B.1.617.1, 21B [28] o 21A/S:154K, [123] y se detectó por primera vez en India en diciembre de 2020. [211] A finales de marzo de 2021, Kappa representaba más Más de la mitad de las secuencias se enviaron desde la India. [212] El 1 de abril de 2021, Public Health England la designó variante bajo investigación (VUI-21APR-01). [29] Tiene las mutaciones notables L452R, E484Q, P681R. [213]

Lambda (linaje C.37)

La variante Lambda, también conocida como linaje C.37, se detectó por primera vez en Perú en agosto de 2020 y fue designada por la OMS como variante de interés el 14 de junio de 2021. [17] Se propagó a al menos 30 países [214] alrededor en todo el mundo y, a julio de 2021 , se desconoce si es más infecciosa y resistente a las vacunas que otras cepas. [215] [216] El 16 de marzo de 2022, la OMS redujo la variante Lambda a "variantes preocupantes que circulaban anteriormente". [135] [136]

Mu (linaje B.1.621)

La variante Mu, también conocida como linaje B.1.621, se detectó por primera vez en Colombia en enero de 2021 y fue designada por la OMS como variante de interés el 30 de agosto de 2021. [17] Ha habido brotes en América del Sur y Europa. [217] [218] El 16 de marzo de 2022, la OMS redujo la variante Mu y sus subvariantes a "variantes preocupantes que circulaban anteriormente". [135] [136]

Variantes previamente monitoreadas (OMS)

Las variantes que se enumeran a continuación alguna vez estuvieron incluidas en las variantes bajo monitoreo, pero se reclasificaron debido a que ya no circulan a un nivel significativo, no han tenido un impacto significativo en la situación o la evidencia científica de que la variante no tiene propiedades preocupantes. [4]

Otras variantes notables

Lineage B.1.1.207 se secuenció por primera vez en agosto de 2020 en Nigeria; [219] Las implicaciones para la transmisión y la virulencia no están claras, pero los Centros para el Control de Enfermedades de EE. UU. la han catalogado como una variante emergente . [42] Secuenciada por el Centro Africano de Excelencia para la Genómica de Enfermedades Infecciosas en Nigeria, esta variante tiene una mutación P681H, compartida con la variante Alfa . No comparte otras mutaciones con la variante Alfa y, a finales de diciembre de 2020, esta variante representa alrededor del 1% de los genomas virales secuenciados en Nigeria, aunque esta cifra puede aumentar. [219] Hasta mayo de 2021, se ha detectado el linaje B.1.1.207 en 10 países. [220]

El linaje B.1.1.317, si bien no se considera una variante preocupante , es digno de mención porque Queensland Health obligó a 2 personas que estaban en cuarentena en un hotel en Brisbane , Australia, a someterse a una cuarentena adicional de 5 días además de los 14 días obligatorios después de su confirmación. fueron infectados con esta variante. [221]

Se informó que el linaje B.1.616, identificado en Bretaña , oeste de Francia, a principios de enero de 2021 y designado por la OMS como "variante en investigación" en marzo de 2021, era difícil de detectar mediante el método de muestreo con hisopo nasofaríngeo para la detección de coronavirus y la detección del El virus necesita depender de muestras del tracto respiratorio inferior. [ cita necesaria ]

El linaje B.1.618 se aisló por primera vez en octubre de 2020. Tiene la mutación E484K en común con varias otras variantes y mostró una propagación significativa en abril de 2021 en Bengala Occidental , India. [222] [223] Al 23 de abril de 2021, la base de datos PANGOLIN mostró 135 secuencias detectadas en la India, con números de una sola cifra en cada uno de los otros ocho países del mundo. [224]

En julio de 2021, los científicos informaron en una preimpresión que se publicó en una revista en febrero de 2022, la detección de linajes anómalos de SARS-CoV-2 de huéspedes desconocidos y anómalos mediante la vigilancia de aguas residuales en la ciudad de Nueva York. Plantearon la hipótesis de que "estos linajes se derivan de infecciones humanas por COVID-19 no muestreadas o que indican la presencia de un reservorio animal no humano ". [225] [226]

El linaje B.1.640.2 (también conocido como variante IHU [227] ) fue detectado en octubre de 2021 por investigadores del Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) de Marsella. [228] Encontraron la variante en un viajero que regresó a Francia desde Camerún y supuestamente infectó a 12 personas. [229] [230] El linaje B.1.640, que incluye B.1.640.2, fue designado variante bajo seguimiento (VUM) por la Organización Mundial de la Salud (OMS) el 22 de noviembre de 2021. [231] Sin embargo, la OMS ha informó que el linaje B.1.640.2 se ha extendido mucho más lentamente que la variante Omicron , por lo que es relativamente poco preocupante. [230] [232] Según un estudio preimpreso, el linaje B.1.640.2 tiene dos mutaciones de proteína de pico ya conocidas , E484K y N501Y, entre un total de 46 sustituciones de nucleótidos y 37 eliminaciones. [229] [233] [234]

En marzo de 2022, los investigadores informaron sobre virus recombinantes variantes del SARS-CoV-2 que contienen elementos de Delta y Omicron – Deltacron (también llamado "Deltamicron"). [235] [236] [237] [238] [239] La recombinación ocurre cuando un virus combina partes de un virus relacionado con su secuencia genética mientras ensambla copias de sí mismo. No está claro si Deltacron –que no debe confundirse con "Deltacron" informado en enero , aunque la primera detección también fue en enero [239] [240] – podrá competir con Omicron y si eso sería perjudicial para la salud. [241]

En julio de 2023, el profesor Lawrence Young, virólogo de la Universidad de Warwick , anunció una variante Delta supermutada a partir de un hisopo de un caso indonesio con 113 mutaciones únicas, 37 de las cuales afectaban a la proteína de pico. [242]

Mutaciones sin sentido notables

Se han observado varias mutaciones sin sentido del SARS-CoV-2.

del 69-70

El nombre de la mutación, del 69-70, o 69-70 del, u otras notaciones similares, se refiere a la eliminación del aminoácido en la posición 69 a 70. La mutación se encuentra en la variante Alfa y podría provocar un "pico". fallo del objetivo genético" y dar como resultado un resultado falso negativo en la prueba de virus de PCR. [243]

RSYLTPGD246-253N

También conocido como del 246-252, u otra expresión similar, se refiere a la eliminación del aminoácido de la posición 246 a 252, en el dominio N-terminal de la proteína de pico, acompañada de un reemplazo del ácido aspártico (D ) en la posición 253 para la asparagina (N). [244] [245]

La mutación por eliminación de 7 aminoácidos se describe actualmente como única en la variante Lambda y se la ha atribuido como una de las causas de la mayor capacidad de la cepa para escapar de los anticuerpos neutralizantes, según el artículo preimpreso. [246]

N440K

El nombre de la mutación, N440K, se refiere a un intercambio mediante el cual la asparagina (N) se reemplaza por lisina (K) en la posición 440. [247]

Se ha observado que esta mutación en cultivos celulares es 10 veces más infectiva en comparación con la cepa A2a previamente extendida (sustitución A97V en la secuencia RdRP) y 1000 veces más en la cepa A3i menos extendida (sustitución D614G en Spike y sustitución P323L en RdRP). ). [248] Estuvo involucrado en rápidos aumentos de casos de COVID-19 en India en mayo de 2021. [249] India tiene la mayor proporción de variantes mutadas N440K, seguida de Estados Unidos y Alemania. [250]

G446V

El nombre de la mutación, G446V, se refiere a un intercambio mediante el cual la glicina (G) se reemplaza por valina (V) en la posición 446. [247]

Se dice que la mutación, identificada en Japón entre los viajeros entrantes a partir de mayo, y entre 33 muestras de individuos relacionados con los Juegos Olímpicos de Tokio 2020 y los Juegos Paralímpicos de Tokio 2020 , puede afectar la afinidad de los anticuerpos monoclonales múltiples , aunque su impacto clínico contra el El uso de medicamentos con anticuerpos aún no se conoce. [251]

L452R

El nombre de la mutación, L452R, se refiere a un intercambio mediante el cual la leucina (L) se reemplaza por arginina (R) en la posición 452. [247]

L452R se encuentra en las variantes Delta y Kappa que circularon por primera vez en la India, pero que desde entonces se han extendido por todo el mundo. L452R es una mutación relevante en esta cepa que mejora la capacidad de unión al receptor ACE2 y puede reducir la unión de los anticuerpos estimulados por la vacuna a esta proteína de pico alterada.

Algunos estudios muestran que L452R podría incluso hacer que el coronavirus sea resistente a las células T , que son necesarias para atacar y destruir las células infectadas por el virus. Se diferencian de los anticuerpos que son útiles para bloquear las partículas de coronavirus y evitar que prolifere. [165]

Y453F

El nombre de la mutación, Y453F, se refiere a un intercambio mediante el cual la tirosina (Y) se reemplaza por fenilalanina (F) en la posición 453. Se ha encontrado que la mutación está potencialmente relacionada con la propagación del SARS-CoV-2 entre los visones en los Países Bajos. en 2020. [252]

S477G/N

En varios estudios se identificó mediante métodos bioinformáticos y estadísticos una región altamente flexible en el dominio de unión al receptor (RBD) del SARS-CoV-2, que comienza desde el residuo 475 y continúa hasta el residuo 485. La Universidad de Graz [253] y la empresa de biotecnología Innophore [254] han demostrado en una publicación reciente que estructuralmente la posición S477 muestra la mayor flexibilidad entre ellas. [255]

Al mismo tiempo, S477 es hasta ahora el residuo de aminoácido que se intercambia con más frecuencia en los RBD de los mutantes del SARS-CoV-2. Mediante el uso de simulaciones de dinámica molecular de RBD durante el proceso de unión a hACE2, se ha demostrado que tanto S477G como S477N fortalecen la unión del pico de SARS-COV-2 con el receptor hACE2. El desarrollador de vacunas BioNTech [256] hizo referencia a este intercambio de aminoácidos como relevante con respecto al diseño futuro de vacunas en una preimpresión publicada en febrero de 2021. [257]

E484Q

El nombre de la mutación, E484Q, se refiere a un intercambio mediante el cual el ácido glutámico (E) se reemplaza por glutamina (Q) en la posición 484. [247]

La variante Kappa que circula en India tiene E484Q. Estas variantes fueron inicialmente (pero engañosamente) denominadas "doble mutante". [258] E484Q puede mejorar la capacidad de unión al receptor ACE2 y puede reducir la capacidad de los anticuerpos estimulados por la vacuna para unirse a esta proteína de pico alterada. [165]

E484K

El nombre de la mutación, E484K, se refiere a un intercambio mediante el cual el ácido glutámico (E) se reemplaza por lisina (K) en la posición 484. [247] Se le conoce como "Eeek". [259]

Se ha informado que E484K es una mutación de escape (es decir, una mutación que mejora la capacidad de un virus para evadir el sistema inmunológico del huésped [260] [261] ) de al menos una forma de anticuerpo monoclonal contra el SARS-CoV-2, lo que indica que puede haber ser un "posible cambio en la antigenicidad ". [262] La variante Gamma (linaje P.1), [151] la variante Zeta (linaje P.2, también conocida como linaje B.1.1.28.2) [154] y la variante Beta (501.V2) exhiben esta mutación. . [262] También se ha detectado un número limitado de genomas del linaje B.1.1.7 con la mutación E484K. [263] Se informa que los anticuerpos monoclonales y derivados del suero son de 10 a 60 veces menos efectivos para neutralizar el virus que porta la mutación E484K. [264] [265] El 2 de febrero de 2021, científicos médicos del Reino Unido informaron de la detección de E484K en 11 muestras (de 214.000 muestras), una mutación que puede comprometer la eficacia de la vacuna actual. [266] [267]

F490S

F490S denota un cambio de fenilalanina (F) a serina (S) en la posición del aminoácido 490. [268]

Es una de las mutaciones encontradas en Lambda y se ha asociado con una susceptibilidad reducida a los anticuerpos generados por quienes estaban infectados con otras cepas, lo que significa que el tratamiento con anticuerpos contra personas infectadas con cepas que portan dicha mutación sería menos efectivo. [269]

N501Y

N501Y denota un cambio de asparagina (N) a tirosina (Y) en la posición del aminoácido 501. [270] N501Y ha sido apodada "Nelly". [259]

PHE cree que este cambio aumenta la afinidad de unión debido a su posición dentro del dominio de unión al receptor de la glicoproteína de pico , que se une a ACE2 en las células humanas; Los datos también respaldan la hipótesis de una mayor afinidad de unión debido a este cambio. [43] El modelado de interacciones moleculares y los cálculos de energía libre de unión han demostrado que la mutación N501Y tiene la mayor afinidad de unión en las variantes preocupantes de RBD a hACE2. [1] Las variantes con N501Y incluyen Gamma, [262] [151] Alpha (VOC 20DEC-01), Beta y COH.20G/501Y (identificada en Columbus, Ohio ). [1] Esta última se convirtió en la forma dominante del virus en Columbus a finales de diciembre de 2020 y enero y parece haber evolucionado independientemente de otras variantes. [271] [272]

N501S

N501S denota un cambio de asparagina (N) a serina (S) en la posición del aminoácido 501. [273]

En septiembre de 2021, hay 8 casos de pacientes en todo el mundo infectados con la variante Delta que presenta esta mutación N501S. Como se considera una mutación similar a N501Y, se sospecha que tiene características similares a la mutación N501Y, que se cree que aumenta la infectividad del virus; sin embargo, aún se desconoce el efecto exacto. [274]

D614G

Prevalencia de la mutación D614G en todas las cepas GISAID reportadas durante el transcurso de 2020. La convergencia con la unidad coincide estrechamente con el extremo superior de la curva logística . [275]

D614G es una mutación sin sentido que afecta la proteína de pico del SARS-CoV-2. Desde sus primeras apariciones en el este de China a principios de 2020, la frecuencia de esta mutación en la población viral mundial aumentó al principio de la pandemia. [276] La G ( glicina ) reemplazó rápidamente a la D ( ácido aspártico ) en la posición 614 en Europa, aunque más lentamente en China y el resto de Asia oriental, lo que apoya la hipótesis de que la G aumentó la tasa de transmisión, lo que es consistente con títulos virales más altos y infectividad in vitro. [53] Los investigadores de la herramienta PANGOLIN apodaron esta mutación "Doug". [259]

En julio de 2020, se informó que la variante D614G SARS-CoV-2, más infecciosa, se había convertido en la forma dominante de la pandemia. [277] [278] [279] [280] PHE confirmó que la mutación D614G tenía un "efecto moderado sobre la transmisibilidad" y estaba siendo rastreada internacionalmente. [270] [281]

La prevalencia global de D614G se correlaciona con la prevalencia de pérdida del olfato ( anosmia ) como síntoma de COVID-19, posiblemente mediada por una mayor unión del RBD al receptor ACE2 o una mayor estabilidad proteica y, por lo tanto, una mayor infectividad del epitelio olfativo . [282]

Las variantes que contienen la mutación D614G se encuentran en el clado G de GISAID [53] y en el clado B.1 de la herramienta PANGOLIN . [53]

Q677P/H

El nombre de la mutación, Q677P/H, se refiere a un intercambio mediante el cual la glutamina (Q) se reemplaza por prolina (P) o histidina (H) en la posición 677. [247] Hay varios sublinajes que contienen la mutación Q677P; seis de ellos, que también contienen varias combinaciones diferentes de otras mutaciones, reciben nombres de aves. Uno de los primeros observados, por ejemplo, se conoce como "Pelican", mientras que el más común a principios de 2021 se llamaba provisionalmente "Robin 1". [283]

La mutación se ha informado en múltiples linajes que circulan dentro de los Estados Unidos a finales de 2020 y también en algunos linajes fuera del país. 'Pelican' se detectó por primera vez en Oregón y, a principios de 2021, 'Robin 1' se encontró con frecuencia en el medio oeste de los Estados Unidos , mientras que otro sublinaje Q667H, 'Robin 2', se encontró principalmente en el sureste de los Estados Unidos. [283] La frecuencia de registro de dicha mutación ha aumentado desde finales de 2020 hasta principios de 2021. [284]

P681H

Prevalencia logarítmica de P681H en 2020 según secuencias en la base de datos GISAID [275]

El nombre de la mutación, P681H, se refiere a un intercambio mediante el cual la prolina (P) se reemplaza por histidina (H) en la posición 681. [275]

En enero de 2021, los científicos informaron en un preprint que la mutación P681H, un rasgo característico de la variante Alfa y linaje B.1.1.207 (identificada en Nigeria), está mostrando un aumento exponencial significativo en su frecuencia a nivel mundial, siguiendo así una tendencia a ser esperado en la parte inferior de la curva logística. Esto se puede comparar con la tendencia del D614G, que ahora prevalece a nivel mundial. [275] [285]

P681R

El nombre de la mutación, P681R, se refiere a un intercambio mediante el cual la prolina (P) se reemplaza por arginina (R) en la posición 681. [247]

El Consorcio de Genómica del SARS-CoV-2 de la India ( INSACOG ) descubrió que, además de las dos mutaciones E484Q y L452R, también existe una tercera mutación significativa, P681R en el linaje B.1.617. Las tres mutaciones preocupantes se encuentran en la proteína de pico, la parte operativa del coronavirus que se une a las células receptoras del cuerpo. [165]

A701V

Según los primeros informes de los medios de comunicación, el Ministerio de Salud de Malasia anunció el 23 de diciembre de 2020 que había descubierto una mutación en el genoma del SARS-CoV-2, que designaron como A701B(sic), entre 60 muestras recolectadas del grupo Benteng Lahad Datu en Sabá . La mutación se caracterizó por ser similar a la encontrada recientemente en ese momento en Sudáfrica, Australia y los Países Bajos, aunque no estaba claro si esta mutación era más infecciosa o agresiva [ se necesita aclaración ] que antes. [286] El gobierno provincial de Sulu en la vecina Filipinas suspendió temporalmente los viajes a Sabah en respuesta al descubrimiento de 'A701B' debido a la incertidumbre sobre la naturaleza de la mutación. [287]

El 25 de diciembre de 2020, el Ministerio de Salud de Malasia describió una mutación A701V como circulante y presente en el 85% de los casos (la D614G estuvo presente en el 100% de los casos) en Malasia. [288] [289] Estos informes también se referían a muestras recolectadas del grupo Benteng Lahad Datu. [288] [289] El texto del anuncio se reflejó textualmente en la página de Facebook de Noor Hisham Abdullah , Director General de Salud malayo, quien fue citado en algunos de los artículos de noticias. [289]

La mutación A701V tiene el aminoácido alanina (A) sustituido por valina (V) en la posición 701 de la proteína de pico. A nivel mundial, Sudáfrica, Australia, Países Bajos e Inglaterra también informaron sobre el A701V aproximadamente al mismo tiempo que Malasia. [288] En GISAID, la prevalencia de esta mutación es aproximadamente del 0,18%. de los casos. [288]

El 14 de abril de 2021, el Ministerio de Salud de Malasia informó que la tercera ola, que había comenzado en Sabah, había supuesto la introducción de variantes con mutaciones D614G y A701V. [290]

Variantes recombinantes

El gobierno británico ha informado sobre varias variantes recombinantes del SARS-CoV-2. [291] A estos linajes recombinantes se les han asignado los identificadores de linaje Pango XD, XE y XF. [292]

XE es un linaje recombinante de los linajes BA.1 y BA.2 de Pango. [293] En marzo de 2022, se creía que XE tenía una tasa de crecimiento un 9,8% mayor que BA.2. [291]

Efectividad diferencial de las vacunas

La interacción entre el virus SARS-CoV-2 y sus huéspedes humanos fue inicialmente natural, pero luego comenzó a verse alterada por la creciente disponibilidad de vacunas observada en 2021. [294] La posible aparición de una variante del SARS-CoV-2 que sea moderada o Totalmente resistente a la respuesta de anticuerpos provocada por las vacunas COVID-19 puede requerir una modificación de las vacunas. [295] La aparición de variantes resistentes a las vacunas es más probable en una población altamente vacunada con transmisión no controlada. [296]

En febrero de 2021, la Administración de Medicamentos y Alimentos de EE. UU . creía que todas las vacunas autorizadas por la FDA seguían siendo eficaces para proteger contra las cepas circulantes del SARS-CoV-2. [295]

Evasión inmune por variantes

A diferencia de otras variantes investigadas anteriormente, la variante Omicron del SARS-CoV-2 [297] [298] [299] [300] [301] y sus subvariantes BA.4/5 [302] han evadido la inmunidad inducida por las vacunas, lo que puede provocar infecciones irruptivas a pesar de la vacunación reciente. Sin embargo, se cree que las vacunas brindan protección contra enfermedades graves, hospitalizaciones y muertes debido a Omicron. [303]

Ajustes de vacunas

En junio de 2022, Pfizer y Moderna desarrollaron vacunas bivalentes para proteger contra el SARS-CoV-2 de tipo salvaje y la variante Omicron. Las vacunas bivalentes son bien toleradas y ofrecen a Omicron una inmunidad superior a las vacunas de ARNm anteriores. [304] En septiembre de 2022, la Administración de Medicamentos y Alimentos de los Estados Unidos (FDA) autorizó el uso de vacunas bivalentes en los Estados Unidos. [305] [306] [307]

En junio de 2023, la FDA recomendó a los fabricantes que la formulación 2023-2024 de las vacunas contra la COVID-19 para su uso en los EE. UU. se actualizara para que fuera una vacuna contra la COVID-19 monovalente que utilizara el linaje XBB.1.5 de la variante Omicron. [308] [309]

Datos y métodos

La secuenciación moderna del ADN , cuando esté disponible, puede permitir la detección rápida (a veces conocida como "detección en tiempo real") de variantes genéticas que aparecen en patógenos durante los brotes de enfermedades. [310] Mediante el uso de software de visualización de árboles filogenéticos , los registros de secuencias del genoma se pueden agrupar en grupos de genomas idénticos, todos los cuales contienen el mismo conjunto de mutaciones. Cada grupo representa una "variante", un "clado" o un "linaje", y la comparación de las secuencias permite deducir el camino evolutivo de un virus. Para el SARS-CoV-2, hasta marzo de 2021, se habían generado más de 330.000 secuencias genómicas virales mediante estudios de epidemiología molecular en todo el mundo. [311]

Detección y evaluación de nuevas variantes

El 26 de enero de 2021, el gobierno británico dijo que compartiría sus capacidades de secuenciación genómica con otros países para aumentar la tasa de secuenciación genómica y rastrear nuevas variantes, y anunció una "Plataforma de evaluación de nuevas variantes". [312] En enero de 2021 , más de la mitad de toda la secuenciación genómica de COVID-19 se llevó a cabo en el Reino Unido. [313]

Se demostró que la vigilancia de las aguas residuales es una técnica para detectar variantes del SARS-CoV-2 [226] y rastrear su aumento para estudiar la dinámica de la infección en curso relacionada. [314] [315] [316]

Pruebas

Que una o más mutaciones visibles en las pruebas de RT-PCR puedan usarse de manera confiable para identificar una variante depende de la prevalencia de otras variantes que circulan actualmente en la misma población. [317] [318]

Teoría de la incubación de múltiples variantes mutadas.

Los investigadores han sugerido que pueden surgir múltiples mutaciones en el curso de la infección persistente de un paciente inmunocomprometido , particularmente cuando el virus desarrolla mutaciones de escape bajo la presión de selección de anticuerpos o tratamiento con plasma de convaleciente , [320] [321] con las mismas deleciones en la superficie. antígenos que se repiten repetidamente en diferentes pacientes. [322]

Transmisión entre especies

Existe el riesgo de que el COVID-19 se transfiera de los humanos a otras poblaciones animales y se combine con otros virus animales para crear aún más variantes que sean peligrosas para los humanos. [323] Los efectos de contagio de la zoonosis inversa pueden causar reservorios de variantes mutantes que repercuten en los humanos, otra posible fuente de variantes preocupantes, además de las personas inmunocomprometidas. [324]

Grupo 5

A principios de noviembre de 2020, el Grupo 5 , también denominado ΔFVI-spike por el Instituto Estatal Danés del Suero (SSI), [325] fue descubierto en el norte de Jutlandia , Dinamarca. Se cree que se transmitió de los visones a los humanos a través de granjas de visones . El 4 de noviembre de 2020, se anunció que la población de visones en Dinamarca sería sacrificada para evitar la posible propagación de esta mutación y reducir el riesgo de que se produjeran nuevas mutaciones. Se introdujeron cierres y restricciones de viaje en siete municipios del norte de Jutlandia para evitar la propagación de la mutación, que podría comprometer las respuestas nacionales o internacionales a la pandemia de COVID-19 . Hasta el 5 de noviembre de 2020, se habían detectado unos 214 casos humanos relacionados con visones. [326]

La OMS afirmó que el grupo 5 tenía una "sensibilidad moderadamente disminuida a los anticuerpos neutralizantes". [327] SSI advirtió que la mutación podría reducir el efecto de las vacunas COVID-19 en desarrollo, aunque era poco probable que las hiciera inútiles. Tras el confinamiento y las pruebas masivas, SSI anunció el 19 de noviembre de 2020 que con toda probabilidad el grupo 5 se había extinguido. [328] Al 1 de febrero de 2021, los autores de un artículo revisado por pares , todos ellos del SSI, evaluaron que el grupo 5 no estaba en circulación entre la población humana. [329]

Ver también

Notas

  1. ^ Basado en varios rastreadores [17] [18] [19] [20] [21] e informes periódicos. [22] [23] [24]
  2. ^ ab En otra fuente, GISAID nombra un conjunto de 7 clados sin el clado O pero que incluye un clado GV. [59]
  3. ^ Según la OMS, "los linajes o clados se pueden definir en función de virus que comparten un ancestro común determinado filogenéticamente". [70]
  4. ^ A partir de enero de 2021 , se debe cumplir al menos uno de los siguientes criterios para contar como un clado en el sistema Nextstrain (cita de la fuente): [52]
    1. Un clado alcanza >20% de frecuencia global durante 2 o más meses
    2. Un clado alcanza >30% de frecuencia regional durante 2 o más meses
    3. Se reconoce un VOC ('variante preocupante') (se aplica actualmente [6 de enero de 2021] a 501Y.V1 y 501Y.V2)
  5. ^ Produce falla en el objetivo del gen S (SGTF) en TaqPath.
  6. ^ abc Detectable mediante el ensayo TIB MolBiol utilizando el método de la curva de fusión.

Referencias

  1. ^ abcd Shahhosseini N, Babuadze GG, Wong G, Kobinger GP (abril de 2021). "Firmas de mutación y acoplamiento in silico de nuevas variantes preocupantes del SARS-CoV-2". Microorganismos . 9 (5): 926. doi : 10.3390/microorganismos9050926 . PMC  8146828 . PMID  33925854. S2CID  233460887.
  2. ^ "Variantes y mutaciones del coronavirus: la ciencia explicada". Noticias de la BBC . 6 de enero de 2021. Archivado desde el original el 22 de febrero de 2021 . Consultado el 2 de febrero de 2021 .
  3. ^ Kupferschmidt K (15 de enero de 2021). "Las nuevas variantes del coronavirus podrían provocar más reinfecciones, requieren vacunas actualizadas". Ciencia . doi : 10.1126/ciencia.abg6028. S2CID  234141081. Archivado desde el original el 22 de febrero de 2021 . Consultado el 2 de febrero de 2021 .
  4. ^ abcdefghi Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2. www.who.int , consultado el 26 de mayo de 2022. Actualizado con frecuencia.
  5. ^ "Orígenes de los coronavirus". NIH.gov . Institutos Nacionales de Salud de Estados Unidos. 16 de marzo de 2022. Archivado desde el original el 21 de enero de 2023 . Consultado el 3 de febrero de 2023 . Hasta la fecha no se ha identificado el origen del SARS-CoV-2 que provocó la pandemia de COVID-19.
  6. ^ Shahhosseini N, Wong G, Kobinger GP, Chinikar S (junio de 2021). "Transmisión de desbordamiento de SARS-CoV-2 debido a un evento de recombinación". Informes genéticos . 23 : 101045. doi : 10.1016/j.genrep.2021.101045. PMC 7884226 . PMID  33615041. 
  7. ^ "El ascenso y la caída de la hipótesis de las fugas de laboratorio sobre el origen del SARS-CoV-2 | Medicina basada en la ciencia". sciencebasedmedicine.org . 1 de agosto de 2022 . Consultado el 4 de noviembre de 2022 .
  8. ^ Tang X, Wu C, Li X, Song Y (3 de marzo de 2020). "Sobre el origen y continua evolución del SARS-CoV-2". Revista Nacional de Ciencias . 7 (6): 1012-1023. doi : 10.1093/nsr/nwaa036 . PMC 7107875 . PMID  34676127. 
  9. ^ Forster P, Forster L, Renfrew C, Forster M (8 de abril de 2020). "Análisis de redes filogenéticas de genomas del SARS-CoV-2". Procedimientos de la Academia Nacional de Ciencias . 117 (17): 9241–9243. Código Bib : 2020PNAS..117.9241F. doi : 10.1073/pnas.2004999117 . ISSN  0027-8424. PMC 7196762 . PMID  32269081. 
  10. ^ Rambaut A, Holmes EC, OToole A, Hill V, McCrone JT, Ruis C, et al. (15 de julio de 2020). "Una propuesta de nomenclatura dinámica para los linajes del SARS-CoV-2 para ayudar a la epidemiología genómica". Microbiología de la naturaleza . 5 (11): 1403-1407. doi : 10.1038/s41564-020-0770-5 . PMC 7610519 . PMID  32669681. 
  11. ^ Tregoning JS, Flight KE, Higham SL, Wang Z, Pierce BF (9 de agosto de 2021). "Avance del esfuerzo de la vacuna COVID-19: virus, vacunas y variantes versus eficacia, efectividad y escape". Inmunología de Reseñas de la Naturaleza . 21 (10): 626–636. doi :10.1038/s41577-021-00592-1. PMC 8351583 . PMID  34373623. 
  12. ^ Piplani S, Singh PK, Winkler DA, Petrovsky N (diciembre de 2021). "Comparación in silico de las afinidades de unión de la proteína de pico del SARS-CoV-2-ACE2 entre especies e implicaciones para el origen del virus". Informes científicos . 11 (1): 13063. Código bibliográfico : 2021NatSR..1113063P. doi :10.1038/s41598-021-92388-5. PMC 8225877 . PMID  34168168. 
  13. ^ Gallagher J (12 de junio de 2021). "Covid: ¿Existe un límite en cuanto a lo peor que pueden empeorar las variantes?". BBC . Archivado desde el original el 15 de junio de 2021 . Consultado el 12 de junio de 2021 .
  14. ^ abc Tao K, Tzou PL, Nouhin J, Gupta RK, de Oliveira T, Kosakovsky Pond SL, et al. (17 de septiembre de 2021). "La importancia biológica y clínica de las variantes emergentes del SARS-CoV-2". Naturaleza Reseñas Genética . 22 (12): 757–773. doi :10.1038/s41576-021-00408-x. PMC 8447121 . PMID  34535792. 
  15. ^ Hendy M, Kaufman S, Ponga M (diciembre de 2021). "Estrategias moleculares para la unión y escape de anticuerpos del SARS-CoV-2 y sus mutaciones". Informes científicos . 11 (1): 21735. Código bibliográfico : 2021NatSR..1121735H. doi :10.1038/s41598-021-01081-0. PMC 8571385 . PMID  34741079. 
  16. ^ "Variantes del SARS-CoV-2: marco de evaluación de riesgos" (PDF) . GOBIERNO DEL REINO UNIDO . Servicio Digital Gubernamental . Salud pública de Inglaterra. 22 de mayo de 2021. GOV-8426. Archivado (PDF) desde el original el 27 de mayo de 2021 . Consultado el 22 de junio de 2021 .
  17. ^ abcdefghij "Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2". quién.int . Organización Mundial de la Salud. Archivado desde el original el 18 de junio de 2021 . Consultado el 22 de junio de 2021 .Actualizado con frecuencia.
  18. ^ abcdefghijk "Clasificaciones y definiciones de variantes del SARS-CoV-2". CDC.gov . Centros de Control y Prevención de Enfermedades. 11 de febrero de 2020. Archivado desde el original el 29 de junio de 2021 . Consultado el 18 de junio de 2021 .Actualizado con frecuencia.
  19. ^ abcdefghijklm "Variantes: distribución de datos de casos". Salud pública de Inglaterra . Servicio Digital Gubernamental . Archivado desde el original el 7 de junio de 2021 . Consultado el 16 de febrero de 2021 .Actualizado con frecuencia. Datos hasta el 19 de mayo de 2021 incluidos en la actualización del 2 de julio de 2021.
  20. ^ abcde "Living Evidence - variantes del SARS-CoV-2". Agencia de Innovación Clínica. nsw.gov.au.​ Ministerio de Salud (Nueva Gales del Sur) . 23 de julio de 2021. Archivado desde el original el 16 de abril de 2021 . Consultado el 22 de marzo de 2021 .Actualizado con frecuencia.
  21. ^ abc "Variantes preocupantes del SARS-CoV-2". ECDC.eu.​ Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades. 30 de abril de 2021. Archivado desde el original el 16 de junio de 2021 . Consultado el 12 de mayo de 2021 .Actualizado con frecuencia.
  22. ^ "Informes de situación de la enfermedad por coronavirus (COVID-19)". quién.int . Organización Mundial de la Salud. Archivado desde el original el 26 de enero de 2020 . Consultado el 14 de junio de 2021 .Actualizado con frecuencia.
  23. ^ "Investigación de variantes del SARS-CoV-2: sesiones informativas técnicas". GOBIERNO DEL REINO UNIDO . Servicio Digital Gubernamental . Salud pública de Inglaterra . Consultado el 18 de noviembre de 2021 .Actualizado con frecuencia.
  24. ^ "Investigación de variantes preocupantes del SARS-CoV-2: evaluaciones de riesgo de variantes". GOBIERNO DEL REINO UNIDO . Servicio Digital Gubernamental . Salud pública de Inglaterra. Archivado desde el original el 19 de junio de 2021 . Consultado el 19 de junio de 2021 .Actualizado con frecuencia.
  25. ^ abcdefg Actualización epidemiológica semanal sobre COVID-19 - 20 de julio de 2021 (Informe de situación). Organización Mundial de la Salud. 20 de julio de 2021. Archivado desde el original el 23 de julio de 2021 . Consultado el 24 de julio de 2021 .
  26. ^ Planas D, Veyer D, Baidaliuk A, Staropoli I, Guivel-Benhassine F, Rajah MM, et al. (27 de mayo de 2021). "Sensibilidad reducida de la variante B.1.617.2 infecciosa del SARS-CoV-2 a anticuerpos monoclonales y sueros de personas convalecientes y vacunadas". bioRxiv 10.1101/2021.05.26.445838 . 
  27. ^ ab "Clasificación de Omicron (B.1.1.529): variante preocupante del SARS-CoV-2". Organización Mundial de la Salud. 26 de noviembre de 2021 . Consultado el 26 de noviembre de 2021 .
  28. ^ abcdefgh Actualización epidemiológica semanal sobre COVID-19 - 22 de junio de 2021 (Informe de situación). Organización Mundial de la Salud. 22 de junio de 2021. Archivado desde el original el 29 de junio de 2021 . Consultado el 26 de junio de 2021 .
  29. ^ ab Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 y variantes bajo investigación en Inglaterra, informe técnico 10 (PDF) (Reunión informativa). Salud pública de Inglaterra. 7 de mayo de 2021. GOV-8226. Archivado (PDF) desde el original el 8 de mayo de 2021 . Consultado el 6 de junio de 2021 .
  30. ^ abcd "Clasificaciones y definiciones de variantes del SARS-CoV-2". CDC.gov . Centros de Control y Prevención de Enfermedades. 29 de junio de 2021. Archivado desde el original el 16 de junio de 2021 . Consultado el 19 de febrero de 2021 .Actualizado frecuentemente.
  31. ^ abcd Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, Jinnai Y, Konings F, Batra N, et al. (junio de 2021). "Aumento de la transmisibilidad y propagación global de las variantes preocupantes del SARS-CoV-2 en junio de 2021". Vigilancia del euro . 26 (24): 2100509. doi :10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509. PMC 8212592 . PMID  34142653. 
  32. ^ Sheikh A, McMenamin J, Taylor B, Robertson C (junio de 2021). "SARS-CoV-2 Delta VOC en Escocia: demografía, riesgo de ingreso hospitalario y eficacia de la vacuna". Lanceta . 397 (10293): 2461–2462. doi :10.1016/S0140-6736(21)01358-1. PMC 8201647 . PMID  34139198. 
  33. ^ ab "Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 y variantes bajo investigación en el Informe técnico 21 de Inglaterra" (PDF) . Salud pública de Inglaterra . 20 de agosto de 2021. p. 16 y 22. Archivado (PDF) desde el original el 29 de agosto de 2021 . Consultado el 29 de agosto de 2021 .
  34. ^ ab Evaluación de riesgos para la variante Delta del SARS-CoV-2 (PDF) (Evaluación). Salud pública de Inglaterra. 23 de julio de 2021. Archivado (PDF) desde el original el 25 de julio de 2021 . Consultado el 24 de julio de 2021 .
  35. ^ Yadav PD, Sapkal GN, Abraham P, Ella R, Deshpande G, Patil DY, et al. (mayo de 2021). "Neutralización de la variante en investigación B.1.617 con sueros de vacunados BBV152". Enfermedades Infecciosas Clínicas . Prensa de la Universidad de Oxford. 74 (ciab411): 366–368. bioRxiv 10.1101/2021.04.23.441101 . doi :10.1093/cid/ciab411. PMID  33961693. 
  36. ^ Callaway E (25 de noviembre de 2021). "La variante del coronavirus muy mutada pone a los científicos en alerta". Naturaleza . 600 (7887): 21. Bibcode :2021Natur.600...21C. doi : 10.1038/d41586-021-03552-w . PMID  34824381. S2CID  244660616.
  37. ^ Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 y variantes bajo investigación en Inglaterra, informe técnico 29 (PDF) (Reunión informativa). Salud pública de Inglaterra. 26 de noviembre de 2021. GOV-10481. Archivado (PDF) desde el original el 27 de noviembre de 2021 . Consultado el 26 de noviembre de 2021 .
  38. ^ abc Evaluación de riesgos para la variante Omicron del SARS-CoV-2 (PDF) (Evaluación). Salud pública de Inglaterra. 22 de diciembre de 2021. GOV-10869 . Consultado el 23 de diciembre de 2021 .
  39. ^ ab Nyberg T, Ferguson NM, Nash SG, Webster HH, Flaxman S, Andrews N, et al. (16 de marzo de 2022). "Análisis comparativo de los riesgos de hospitalización y muerte asociados con las variantes ómicrón (B.1.1.529) y delta (B.1.617.2) del SARS-CoV-2 en Inglaterra: un estudio de cohorte". La lanceta . 399 (10332): 1303–1312. doi :10.1016/S0140-6736(22)00462-7. ISSN  0140-6736. PMC 8926413 . PMID  35305296. 
  40. ^ Rambaut A, Loman N, Pybus O, Barclay W, Barrett J, Carabelli A, et al. (18 de diciembre de 2020). "Caracterización genómica preliminar de un linaje emergente de SARS-CoV-2 en el Reino Unido definido por un nuevo conjunto de mutaciones de pico". Virológico . Archivado desde el original el 21 de diciembre de 2020 . Consultado el 14 de junio de 2021 .
  41. ^ Investigación de la nueva variante del SARS-COV-2, informe técnico 1 (PDF) (informe informativo). Salud pública de Inglaterra. 21 de diciembre de 2020. Archivado (PDF) desde el original el 15 de junio de 2021 . Consultado el 6 de junio de 2021 .
  42. ^ abcdefg "Variantes emergentes del SARS-CoV-2". CDC.gov (Resumen científico). Centros de Control y Prevención de Enfermedades. 28 de enero de 2021. Archivado desde el original el 15 de mayo de 2021 . Consultado el 4 de enero de 2021 . Dominio publicoEste artículo incorpora texto de esta fuente, que se encuentra en el dominio público .
  43. ^ ab Chand y col. (2020), pág. 6, Impacto potencial de la variante de pico N501Y.
  44. ^ Nyberg T, Twohig KA, Harris RJ, Seaman SR, Flannagan J, Allen H, et al. (junio de 2021). "Riesgo de ingreso hospitalario para pacientes con variante B.1.1.7 del SARS-CoV-2: análisis de cohorte". BMJ . 373 :n1412. arXiv : 2104.05560 . doi :10.1136/bmj.n1412. PMC 8204098 . PMID  34130987. S2CID  235187479. 
  45. ^ "Casos confirmados de variantes de COVID-19 identificados en el Reino Unido". GOBIERNO DEL REINO UNIDO . Salud pública de Inglaterra. 15 de enero de 2021. Archivado desde el original el 7 de mayo de 2021 . Consultado el 5 de marzo de 2021 .
  46. ^ Horby P, Barclay W, Gupta R, Huntley C (27 de enero de 2021). Documento NERVTAG: nota sobre la variante P.1 (Nota). Salud pública de Inglaterra. Archivado desde el original el 6 de junio de 2021 . Consultado el 6 de junio de 2021 .
  47. ^ Horby P, Barclay W, Huntley C (13 de enero de 2021). Documento de NERVTAG: breve nota sobre las variantes del SARS-CoV-2 (Nota). Salud pública de Inglaterra. Archivado desde el original el 6 de junio de 2021 . Consultado el 6 de junio de 2021 .
  48. ^ Esta tabla es una adaptación y ampliación de Alm et al., figura 1.
  49. ^ ab Rambaut A, Holmes EC, O'Toole Á, Hill V, McCrone JT, Ruis C, et al. (noviembre de 2020). "Una propuesta de nomenclatura dinámica para los linajes del SARS-CoV-2 para ayudar a la epidemiología genómica". Microbiología de la naturaleza . 5 (11): 1403-1407. doi : 10.1038/s41564-020-0770-5 . PMC 7610519 . PMID  32669681. S2CID  220544096. Citado en Alm et al.
  50. ^ ab Alm E, Broberg EK, Connor T, Hodcroft EB, Komissarov AB, Maurer-Stroh S, et al. (Los laboratorios de secuenciación de la Región Europea de la OMS y el grupo GISAID EpiCoV) (agosto de 2020). "Distribución geográfica y temporal de los clados del SARS-CoV-2 en la región europea de la OMS, de enero a junio de 2020". Vigilancia del euro . 25 (32). doi :10.2807/1560-7917.ES.2020.25.32.2001410. PMC 7427299 . PMID  32794443. 
  51. ↑ «Nextclade» (¿Cuáles son los clados?) . nextstrain.org . Archivado desde el original el 19 de enero de 2021 . Consultado el 19 de enero de 2021 .
  52. ^ abcd Bedford T, Hodcroft B, Neher RA (6 de enero de 2021). "Estrategia actualizada de denominación del clado Nextstrain SARS-CoV-2". nextstrain.org . Archivado desde el original el 18 de enero de 2021 . Consultado el 19 de enero de 2021 .
  53. ^ abcdef Zhukova A, Blassel L, Lemoine F, Morel M, Voznica J, Gascuel O (noviembre de 2020). "Origen, evolución y propagación global del SARS-CoV-2". Comptes Rendus Biologías . 344 : 57–75. doi : 10.5802/crbiol.29 . PMID  33274614.
  54. ^ "Epidemiología genómica del nuevo coronavirus: submuestreo global (filtrado a B.1.617)". nextstrain.org . Archivado desde el original el 13 de julio de 2021 . Consultado el 5 de mayo de 2021 .
  55. ^ abcd Zhang W, Davis B, Chen SS, Martinez JS, Plummer JT, Vail E (2021). "Aparición de una nueva variante del SARS-CoV-2 en el sur de California". JAMA . 325 (13): 1324-1326. doi :10.1001/jama.2021.1612. ISSN  0098-7484. PMC 7879386 . PMID  33571356 . Consultado el 2 de octubre de 2021 . 
  56. ^ ¿ Cuáles son los clados? clades.nextstrain.org , consultado el 29 de noviembre de 2021.
  57. ^ "Linajes PANGO-Linaje B.1.1.28". cov-lineages.org . Archivado desde el original el 24 de febrero de 2021 . Consultado el 4 de febrero de 2021 .[ verificación fallida ]
  58. ^ "Variante: 20J/501Y.V3". covariantes.org . 1 de abril de 2021. Archivado desde el original el 23 de marzo de 2021 . Consultado el 6 de abril de 2021 .
  59. ^ "árbol de clados (de 'Nomenclatura de clados y linajes')". GISAID . 4 de julio de 2020. Archivado desde el original el 9 de enero de 2021 . Consultado el 7 de enero de 2021 .
  60. ^ "No la llames 'variante británica'. Utilice el nombre correcto: B.1.1.7". ESTADÍSTICA . 9 de febrero de 2021. Archivado desde el original el 4 de junio de 2021 . Consultado el 12 de febrero de 2021 .
  61. ^ Flanagan R (2 de febrero de 2021). "Por qué la OMS no la llamará 'variante del Reino Unido', y usted tampoco debería hacerlo" . Noticias CTV . Archivado desde el original el 1 de mayo de 2021 . Consultado el 12 de febrero de 2021 .
  62. ^ Para obtener una lista de fuentes que utilizan nombres que se refieren al país en el que se identificaron las variantes por primera vez, consulte, por ejemplo, Charla: variante de COVID de Sudáfrica y Charla: variante del coronavirus del Reino Unido .
  63. ^ "Hoy, @WHO anuncia etiquetas nuevas y fáciles de pronunciar para las variantes de preocupación (VOC) e interés (VOI) de #SARSCoV2". Archivado desde el original el 7 de julio de 2021 . Consultado el 7 de julio de 2021 .
  64. ^ Branswell H (31 de mayo de 2021). "El juego de nombres para las variantes del coronavirus se ha vuelto un poco más fácil". Noticias estadísticas . Archivado desde el original el 17 de junio de 2021 . Consultado el 28 de junio de 2021 .
  65. ^ Organización Mundial de la Salud (15 de enero de 2021). "Declaración de la sexta reunión del Comité de Emergencia del Reglamento Sanitario Internacional (2005) en relación con la pandemia de enfermedad por coronavirus (COVID-19)" . Archivado desde el original el 7 de febrero de 2021 . Consultado el 18 de enero de 2021 .
  66. ^ "Covid: la OMS cambia el nombre del Reino Unido y otras variantes con letras griegas". Noticias de la BBC . 31 de mayo de 2021. Archivado desde el original el 31 de mayo de 2021 . Consultado el 7 de julio de 2021 .
  67. ^ ab "La OMS omitió dos letras del alfabeto griego al nombrar la variante del coronavirus". La Prensa Asociada . 27 de noviembre de 2021.
  68. ^ "Las nuevas variantes de COVID podrían recibir nombres de constelaciones una vez que se agote el alfabeto griego". Noticias del cielo. 8 de agosto de 2021 . Consultado el 30 de noviembre de 2021 .
  69. ^ Koyama T, Platt D, Parida L (julio de 2020). "Análisis de variantes de los genomas del SARS-CoV-2". Boletín de la Organización Mundial de la Salud . 98 (7): 495–504. doi : 10.2471/BLT.20.253591 . PMC 7375210 . PMID  32742035. Detectamos en total 65776 variantes con 5775 variantes distintas. 
  70. ^ abc Sede de la OMS (8 de enero de 2021). "3.6 Consideraciones para la nomenclatura y denominación de virus". Secuenciación genómica del SARS-CoV-2 para objetivos de salud pública: orientación provisional, 8 de enero de 2021. Organización Mundial de la Salud. pag. 6. Archivado desde el original el 23 de enero de 2021 . Consultado el 2 de febrero de 2021 .
  71. ^ "Filogenia global, actualizada por Nextstrain". GISAID. 18 de enero de 2021. Archivado desde el original el 20 de enero de 2021 . Consultado el 19 de enero de 2021 .
  72. ^ Hadfield J, Megill C, Bell SM, Huddleston J, Potter B, Callender C, et al. (Diciembre de 2018). Kelso J (ed.). "Nextstrain: seguimiento en tiempo real de la evolución de patógenos". Bioinformática . 34 (23): 4121–4123. doi : 10.1093/bioinformática/bty407. PMC 6247931 . PMID  29790939. 
  73. ^ "Próxima cepa COVID-19". Próxima cepa . Archivado desde el original el 21 de enero de 2021 . Consultado el 1 de junio de 2021 .
  74. ^ "cov-lineages/pangolin: paquete de software para asignar secuencias del genoma del SARS-CoV-2 a linajes globales". Github. Archivado desde el original el 15 de febrero de 2021 . Consultado el 2 de enero de 2021 .
  75. ^ ab "Descripciones de linaje". cov-lineages.org . Equipo Pango . Archivado desde el original el 4 de junio de 2021 . Consultado el 24 de diciembre de 2020 .
  76. ^ Rambaut A, Holmes EC, O'Toole Á, Hill V, McCrone JT, Ruis C, et al. (Marzo de 2021). "Apéndice: una propuesta de nomenclatura dinámica para los linajes del SARS-CoV-2 para ayudar a la epidemiología genómica". Microbiología de la naturaleza . 6 (3): 415. doi :10.1038/s41564-021-00872-5. PMC 7845574 . PMID  33514928. 
  77. ^ "Variantes: distribución de datos de casos". GOBIERNO DEL REINO UNIDO . 28 de enero de 2021. En "Diferencias entre una variante preocupante y una variante bajo investigación" . Consultado el 19 de febrero de 2021 . Las variantes del SARS-CoV-2, si se considera que tienen propiedades epidemiológicas, inmunológicas o patógenas preocupantes, se plantean para una investigación formal. En este punto, se les designa Variante bajo investigación (VUI) con un año, mes y número. Después de una evaluación de riesgos con el comité de expertos correspondiente, pueden ser designados Variante de Preocupación (VOC)
  78. ^ ab Griffiths E, Tanner J, Knox N, Hsiao W, Van Domselaar G (15 de enero de 2021). Recomendaciones provisionales de CanCOGeN para nombrar, identificar y notificar variantes preocupantes del SARS-CoV-2 (PDF) . CanCOGeN (nccid.ca) (Reporte). 1.0. Archivado (PDF) desde el original el 17 de abril de 2021.
  79. ^ Investigación de variantes preocupantes del SARS-CoV-2 en Inglaterra Informe técnico 6 13 de febrero de 2021 (Ver sección: Nomenclatura de variantes en el Reino Unido, P.3) activos.publishing.service.gov.uk , consultado el 27 de febrero de 2021
  80. ^ CDC (11 de febrero de 2020). "Casos, Datos y Vigilancia". Centros de Control y Prevención de Enfermedades . Consultado el 16 de marzo de 2021 .
  81. ^ abc Kumar S, Tao Q, Weaver S, Sanderford M, Caraballo-Ortiz MA, Sharma S, et al. (mayo de 2021). "Un retrato evolutivo del progenitor SARS-CoV-2 y sus vástagos dominantes en la pandemia de COVID-19". Biología Molecular y Evolución . 38 (8): 3046–3059. doi :10.1093/molbev/msab118. PMC 8135569 . PMID  33942847. 
  82. ^ Wu F, Zhao S, Yu B, Chen YM, Wang W, Song ZG y col. (Marzo de 2020). "Un nuevo coronavirus asociado con enfermedades respiratorias humanas en China". Naturaleza . 579 (7798): 265–269. Código Bib : 2020Natur.579..265W. doi :10.1038/s41586-020-2008-3. PMC 7094943 . PMID  32015508. 
  83. ^ Chiara M, Horner DS, Gissi C, Pesole G (mayo de 2021). "La genómica comparada revela la aparición temprana y la distribución espaciotemporal sesgada del SARS-CoV-2". Biología Molecular y Evolución . 38 (6): 2547–2565. doi :10.1093/molbev/msab049. PMC 7928790 . PMID  33605421. 
  84. ^ Zhou P , Yang XL, Wang XG, Hu B, Zhang L, Zhang W, et al. (Marzo de 2020). "Un brote de neumonía asociado a un nuevo coronavirus de probable origen en murciélagos". Naturaleza . 579 (7798): 270–273. Código Bib :2020Natur.579..270Z. doi :10.1038/s41586-020-2012-7. PMC 7095418 . PMID  32015507. 
  85. ^ Okada P, Buathong R, Phuygun S, Thanadachakul T, Parnmen S, Wongboot W, et al. (febrero de 2020). "Patrones de transmisión temprana de la enfermedad por coronavirus 2019 (COVID-19) en viajeros de Wuhan a Tailandia, enero de 2020". Vigilancia del euro . 25 (8). doi :10.2807/1560-7917.ES.2020.25.8.2000097. PMC 7055038 . PMID  32127124. 
  86. ^ "Secuencia de referencia oficial de hCoV-19". www.gisaid.org . Archivado desde el original el 6 de mayo de 2021 . Consultado el 14 de mayo de 2021 .
  87. ^ "El antepasado de la cepa Wuhan del SARS-CoV-2 circulaba a finales de octubre de 2019". Noticias Médicas . Archivado desde el original el 24 de julio de 2021 . Consultado el 10 de mayo de 2020 . Referencia de la revista: Kumar, S. et al. (2021). Un retrato evolutivo...
  88. ^ Colaborador de IDSA "Megavariante" de COVID y ocho criterios para una plantilla para evaluar todas las variantes. La ciencia habla: noticias de identificación global . 2 de febrero de 2021. Archivado desde el original el 21 de abril de 2021 . Consultado el 20 de febrero de 2021 .
  89. ^ ab "Clasificación de Omicron (B.1.1.529): variante preocupante del SARS-CoV-2". www.who.int . Consultado el 26 de noviembre de 2021 .
  90. ^ Callaway E (25 de noviembre de 2021). "La variante del coronavirus muy mutada pone a los científicos en alerta". Naturaleza . 600 (7887): 21. Bibcode :2021Natur.600...21C. doi : 10.1038/d41586-021-03552-w . PMID  34824381. S2CID  244660616.
  91. ^ Fernando MJ. "Expertos mundiales celebran una reunión especial sobre la nueva y preocupante variante de COVID-19 en Sudáfrica: últimas actualizaciones". EE.UU. Hoy en día .
  92. ^ "brote.info". brote.info . Consultado el 26 de noviembre de 2021 .
  93. ^ Covid: la nueva variante B.1.1.529 muy mutada en Sudáfrica genera preocupación, 25 de noviembre de 2021, BBC News, consultado el 25 de noviembre de 2021
  94. ^ Whiteside P (30 de noviembre de 2021). "COVID-19: cómo la propagación de Omicron pasó del paciente cero a todo el mundo". Noticias del cielo . Consultado el 3 de enero de 2022 .
  95. ^ @BNODesk (26 de noviembre de 2021). "Declaración del Ministerio de Salud de Israel informando 1 caso confirmado de la nueva variante de coronavirus B.1.1.529" ( Tweet ) . Consultado el 26 de noviembre de 2021 , vía Twitter .
  96. ^ 14:30 4 מאומתים לווריאנט החדש התגלו בארץ, רה"מ יקיים מסיבת עיתונאים traducido: "...Verificado para Se descubrieron en el país la nueva cepa 4 verificada para la nueva variante…” , m.ynet.co. il , consultado el 26 de noviembre de 2021.
  97. ^ "Bélgica detecta el primer caso de una nueva variante de COVID-19 en Europa". Reuters . 26 de noviembre de 2021 . Consultado el 26 de noviembre de 2021 .
  98. ↑ «BOLETÍN SEMANAL DEL INSACOG» (PDF) . dbtindia.gov.in . 10 de enero de 2022 . Consultado el 24 de enero de 2022 .
  99. ^ "Declaración sobre el sublinaje BA.2 de Omicron". www.who.int . Consultado el 4 de abril de 2022 .
  100. ^ ab Schmidt C. "Lo que sabemos hasta ahora sobre la variante BA.2 de Omicron". Científico americano . Consultado el 4 de abril de 2022 .
  101. ^ "Las infecciones por Covid vuelven a aumentar en todo el Reino Unido - ONS". Noticias de la BBC . 11 de marzo de 2022.
  102. ^ Jessica Rendall (29 de marzo de 2022). "BA.2 es ahora la variante de COVID dominante en EE. UU., según muestran los datos de los CDC".
  103. ^ ECDC (12 de mayo de 2022). "Cambios en la lista de variantes preocupantes del SARS-CoV-2, variantes de interés y variantes bajo seguimiento" (PDF) .
  104. ^ ab Peter Russell (6 de enero de 2023). "Omicron XBB.1.5: ¿Qué sabemos hasta ahora?" . Consultado el 8 de enero de 2023 .
  105. ^ "Actualización de la tasa de crecimiento y prevalencia de la secuencia del genoma del SARS-CoV-2: 8 de noviembre de 2023". GOBIERNO DEL REINO UNIDO . 6 de diciembre de 2023 . Consultado el 21 de diciembre de 2023 .
  106. ^ Johnson A. "Lo que sabemos sobre la variante EG.5 de Covid 'Eris': la cepa dominante que impulsa un aumento en los casos". Forbes . Consultado el 11 de agosto de 2023 .
  107. ^ "cov-lineages.org" . Consultado el 11 de agosto de 2023 .
  108. ^ Mundasad S (10 de agosto de 2023). "Lo que sabemos sobre la variante de Covid EG.5 denominada 'Eris'". Noticias de la BBC . BBC . Consultado el 10 de agosto de 2023 .
  109. ^ "Actualización epidemiológica semanal de COVID-19 (edición 156 publicada el 17 de agosto de 2023)" (PDF) . Organización Mundial de la Salud. 17 de agosto de 2023 . Consultado el 30 de agosto de 2023 .
  110. ^ "Covid: todo lo que sabemos sobre el nuevo descendiente de Omicron a medida que aumenta la gripe invernal". El independiente . 8 de diciembre de 2023 . Consultado el 16 de diciembre de 2023 .
  111. ^ Bartel A, Grau JH, Bitzegeio J, Werber D, Linzner N, Schumacher V, et al. (10 de enero de 2024). "El monitoreo oportuno de los fragmentos de ARN del SARS-CoV-2 en aguas residuales muestra la aparición de JN.1 (BA.2.86.1.1, Clado 23I) en Berlín, Alemania". Virus . 16 (1): 102. doi : 10.3390/v16010102 . ISSN  1999-4915. PMC 10818819 . PMID  38257802. 
  112. ^ "Evaluación inicial de riesgos de JN.1, 19 de diciembre de 2023" (PDF) . Organización Mundial de la Salud. 19 de diciembre de 2023 . Consultado el 11 de enero de 2024 .
  113. ^ "¿El regreso de la máscara? Singapur e Indonesia recuperan los límites a medida que aumentan los casos de Covid". menta . 14 de diciembre de 2023 . Consultado el 16 de diciembre de 2023 .
  114. ^ "La actividad de COVID-19 aumenta a medida que continúa aumentando la prevalencia de la variante JN.1". Centros de Control y Prevención de Enfermedades. 5 de enero de 2024 . Consultado el 11 de enero de 2024 .
  115. ^ Evaluación de riesgos actualizada de JN.1, 9 de enero de 2023 [fecha mal etiquetada] (PDF) , Organización Mundial de la Salud , 9 de febrero de 2024, Wikidata  Q124477897, archivado (PDF) desde el original el 10 de febrero de 2024
  116. ^ "Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2". Organización Mundial de la Salud . 10 de febrero de 2023.
  117. ^ ab "Declaración sobre la actualización de las definiciones de trabajo y el sistema de seguimiento de la OMS para las variantes preocupantes y de interés del SARS-CoV-2". www.who.int . Consultado el 29 de diciembre de 2023 .
  118. ^ ab "Definiciones de trabajo actualizadas y acciones principales para las variantes del SARSCoV2". www.who.int . Consultado el 29 de diciembre de 2023 .
  119. ^ "Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2". www.who.int . 19 de diciembre de 2023 . Consultado el 20 de diciembre de 2023 .
  120. ^ "Covid: Irlanda, Italia, Bélgica y Países Bajos prohíben vuelos desde el Reino Unido". Noticias de la BBC . 20 de diciembre de 2020. Archivado desde el original el 21 de diciembre de 2020 . Consultado el 23 de diciembre de 2020 .
  121. ^ Chand M, Hopkins S, Dabrera G, Achison C, Barclay W, Ferguson N, et al. (21 de diciembre de 2020). Investigación de la nueva variante del SARS-COV-2: Variante preocupante 202012/01 (PDF) (Reporte). Salud pública de Inglaterra. Archivado (PDF) desde el original el 22 de febrero de 2021 . Consultado el 23 de diciembre de 2020 .
  122. ^ "PHE investiga una nueva cepa de COVID-19". Salud Pública de Inglaterra (PHE). 14 de diciembre de 2020.
  123. ^ abcdefg Actualización epidemiológica semanal sobre COVID-19 del 8 de junio de 2021 (Informe de situación). Organización Mundial de la Salud. 8 de junio de 2021. Archivado desde el original el 15 de junio de 2021 . Consultado el 14 de junio de 2021 .
  124. ^ Rambaut A, Loman N, Pybus O, Barclay W, Barrett J, Carabelli A, et al. (2020). Caracterización genómica preliminar de un linaje emergente de SARS-CoV-2 en el Reino Unido definido por un nuevo conjunto de mutaciones de pico (Informe). Escrito en nombre del COVID-19 Genomics Consortium del Reino Unido. Archivado desde el original el 22 de febrero de 2021 . Consultado el 20 de diciembre de 2020 .
  125. ^ Kupferschmidt K (20 de diciembre de 2020). "El coronavirus mutante en el Reino Unido hace saltar las alarmas pero su importancia aún no está clara". Revista de Ciencias . Archivado desde el original el 21 de diciembre de 2020 . Consultado el 21 de diciembre de 2020 .
  126. ^ ab Collier DA, De Marco A, Ferreira IA, Meng B, Datir RP, Walls AC, et al. (mayo de 2021). "Sensibilidad del SARS-CoV-2 B.1.1.7 a los anticuerpos provocados por la vacuna de ARNm". Naturaleza (Publicado). 593 (7857): 136-141. doi : 10.1038/s41586-021-03412-7 . PMID  33706364. Por lo tanto, generamos pseudovirus que portaban las mutaciones de pico B.1.1.7 con o sin la sustitución adicional E484K y los probamos contra sueros obtenidos después de la primera y segunda dosis de la vacuna de ARNm BNT162b2, así como contra sueros de convalecientes. Después de la segunda dosis de vacuna, observamos una pérdida considerable de actividad neutralizante para el pseudovirus con las mutaciones de pico B.1.1.7 y E484K (Fig. 3d, e). El cambio medio para la variante de pico B.1.1.7 que contiene E484K fue 6,7 en comparación con 1,9 para la variante B.1.1.7, en relación con la proteína de pico de tipo salvaje (Fig. 3a-c y Datos ampliados, Fig. 5). ). De manera similar, cuando probamos un panel de sueros convalecientes con un rango de títulos de neutralización (Fig. 1f, gy Datos ampliados Fig. 5), observamos una pérdida adicional de actividad contra el pico mutante B.1.1.7 con E484K, con veces cambio de 11,4 en relación con la proteína de pico de tipo salvaje (Fig. 3f, gy Datos ampliados Fig. 5).
  127. ^ ab "Nueva evidencia sobre VUI-202012/01 y revisión de la evaluación de riesgos para la salud pública". Centro de conocimiento . 15 de diciembre de 2020. Archivado desde el original el 21 de diciembre de 2020 . Consultado el 25 de diciembre de 2020 .
  128. ^ "Evento de exhibición de COG-UK". Archivado desde el original el 14 de junio de 2021 . Consultado el 25 de diciembre de 2020 a través de YouTube.
  129. ^ Davies NG, Abbott S, Barnard RC, Jarvis CI, Kucharski AJ, Munday JD y col. (abril de 2021). "Transmisibilidad estimada e impacto del linaje B.1.1.7 del SARS-CoV-2 en Inglaterra". Ciencia . 372 (6538): eabg3055. doi : 10.1126/science.abg3055. PMC 8128288 . PMID  33658326. 
  130. ^ Volz E, Mishra S, Chand M, Barrett JC, Johnson R, Geidelberg L, et al. (mayo de 2021). "Evaluación de la transmisibilidad del linaje B.1.1.7 del SARS-CoV-2 en Inglaterra". Naturaleza . 593 (7858): 266–269. Código Bib :2021Natur.593..266V. doi : 10.1038/s41586-021-03470-x . hdl : 10044/1/87474 . PMID  33767447.
  131. ^ Horby P, Huntley C, Davies N, Edmunds J, Ferguson N, Medley G, et al. (11 de febrero de 2021). "Documento de NERVTAG sobre la variante preocupante B.1.1.7 de COVID-19: nota de actualización de NERVTAG sobre la gravedad de B.1.1.7 (11 de febrero de 2021)" (PDF) . GOBIERNO DEL REINO UNIDO . Archivado (PDF) desde el original el 13 de abril de 2021 . Consultado el 26 de febrero de 2021 .
  132. ^ Gallagher J (22 de enero de 2021). "Coronavirus: la variante del Reino Unido 'puede ser más mortal'". Noticias de la BBC . Archivado desde el original el 23 de mayo de 2021 . Consultado el 22 de enero de 2021 .
  133. ^ Frampton D, Rampling T, Cross A, Bailey H, Heaney J, Byott M, et al. (abril de 2021). "Características genómicas y efecto clínico del linaje emergente SARS-CoV-2 B.1.1.7 en Londres, Reino Unido: una secuenciación del genoma completo y un estudio de cohorte hospitalario". La lanceta. Enfermedades infecciosas . 21 (9): 1246-1256. doi :10.1016/S1473-3099(21)00170-5. PMC 8041359 . PMID  33857406. 
  134. ^ "Linajes PANGO Linaje B.1.1.7". cov-lineages.org . 15 de mayo de 2021. Archivado desde el original el 16 de junio de 2021 . Consultado el 15 de mayo de 2021 .
  135. ^ abcde "Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2 (actualizado el 16 de marzo de 2022)". www.who.int . 16 de marzo de 2022. Archivado desde el original el 17 de marzo de 2022 . Consultado el 17 de marzo de 2022 .
  136. ^ abcdef "Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2 (actualizado el 7 de marzo de 2022)". www.who.int . 7 de marzo de 2022. Archivado desde el original el 15 de marzo de 2022 . Consultado el 21 de mayo de 2022 .
  137. ^ Mandavilli A (5 de marzo de 2021). "En Oregón, los científicos encuentran una variante del virus con una mutación preocupante. En una sola muestra, los genetistas descubrieron una versión del coronavirus identificada por primera vez en Gran Bretaña con una mutación reportada originalmente en Sudáfrica". Los New York Times . Archivado desde el original el 6 de marzo de 2021 . Consultado el 6 de marzo de 2021 .
  138. ^ Chen RE, Zhang X, Caso JB, Winkler ES, Liu Y, VanBlargan LA, et al. (abril de 2021). "Resistencia de las variantes del SARS-CoV-2 a la neutralización por anticuerpos policlonales monoclonales y derivados del suero". Medicina de la Naturaleza . 27 (4): 717–726. doi : 10.1038/s41591-021-01294-w . PMC 8058618 . PMID  33664494. 
  139. ^ "B.1.1.7 Linaje con informe S: E484K". brote.info . 5 de marzo de 2021. Archivado desde el original el 7 de marzo de 2021 . Consultado el 7 de marzo de 2021 .
  140. ^ Moustafa AM, Bianco C, Denu L, Ahmed A, Neide B, Everett J, et al. (21 de abril de 2021). "Análisis comparativo de aislados emergentes de SARS-CoV-2 B.1.1.7 + E484K de Pensilvania". bioRxiv 10.1101/2021.04.21.440801 . 
  141. ^ "B.1.1.7 Linaje con informe S: E484K". brote.info . Archivado desde el original el 3 de julio de 2021 . Consultado el 28 de mayo de 2021 .
  142. ^ Riesgo relacionado con la propagación de nuevas variantes preocupantes del SARS-CoV-2 en la UE/EEE: primera actualización (evaluación de riesgos). Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades. 2 de febrero de 2021. Archivado desde el original el 25 de marzo de 2021 . Consultado el 22 de marzo de 2021 .
  143. ^ abcd "Sudáfrica anuncia una nueva variante del coronavirus". Los New York Times . 18 de diciembre de 2020. Archivado desde el original el 21 de diciembre de 2020 . Consultado el 20 de diciembre de 2020 .
  144. ^ ab Wroughton L, Bearak M (18 de diciembre de 2020). "Coronavirus de Sudáfrica: segunda ola impulsada por una nueva cepa, festivales de rabia para adolescentes'". El Washington Post . Archivado desde el original el 27 de diciembre de 2020 . Consultado el 20 de diciembre de 2020 .
  145. ^ Mkhize Z (18 de diciembre de 2020). "Actualización sobre Covid-19 (18 de diciembre de 2020)" (Presione soltar). Sudáfrica. Portal en línea sudafricano COVID-19. Archivado desde el original el 4 de mayo de 2021 . Consultado el 23 de diciembre de 2020 . Nuestros médicos también nos han advertido que las cosas han cambiado y que personas más jóvenes, antes sanas, ahora están enfermando gravemente.
  146. ^ Abdool Karim SS (19 de diciembre de 2020). "La segunda ola de Covid-19 en Sudáfrica: transmisibilidad y una variante 501.V2, undécima diapositiva". www.scribd.com. Archivado desde el original el 6 de enero de 2021 . Consultado el 23 de diciembre de 2020 .
  147. ^ Lowe D (22 de diciembre de 2020). "Las nuevas mutaciones". En la tuberia . Asociación Estadounidense para el Avance de la Ciencia . Archivado desde el original el 29 de enero de 2021 . Consultado el 23 de diciembre de 2020 . Debo señalar aquí que hay otra cepa en Sudáfrica que está generando preocupaciones similares. Éste tiene ocho mutaciones en la proteína Spike, tres de ellas (K417N, E484K y N501Y) que pueden tener algún papel funcional.
  148. ^ "Declaración del Grupo de Trabajo de la OMS sobre Modelos Animales COVID-19 (WHO-COM) sobre las nuevas variantes del SARS-CoV-2 del Reino Unido y Sudáfrica" ​​(PDF) . Organización Mundial de la Salud. 22 de diciembre de 2020. Archivado (PDF) desde el original el 4 de mayo de 2021 . Consultado el 23 de diciembre de 2020 .
  149. ^ "Nueva combinación de mutaciones en el sitio de unión del receptor de pico" (Presione soltar). GISAID . 21 de diciembre de 2020. Archivado desde el original el 22 de febrero de 2021 . Consultado el 23 de diciembre de 2020 .
  150. ^ "Japón encuentra nueva variante de coronavirus en viajeros procedentes de Brasil". Japón hoy . Japón. 11 de enero de 2021. Archivado desde el original el 11 de enero de 2021 . Consultado el 14 de enero de 2021 .
  151. ^ abcdef Faria NR, Claro IM, Candido D, Moyses Franco LA, Andrade PS, Coletti TM, et al. (12 de enero de 2021). "Caracterización genómica de un linaje emergente de SARS-CoV-2 en Manaos: hallazgos preliminares". Red Genómica CADDE. virológico.org . Archivado desde el original el 20 de mayo de 2021 . Consultado el 23 de enero de 2021 .
  152. ^ ab "P.1". cov-lineages.org . Equipo Pango . 1 de julio de 2021. Archivado desde el original el 9 de junio de 2021 . Consultado el 7 de marzo de 2021 .
  153. ^ "Informe COG-UK sobre mutaciones pico de interés en el Reino Unido del SARS-CoV-2" (PDF) . www.cogconsortium.uk . Consorcio del Reino Unido de Genómica Covid-19. 15 de enero de 2021. Archivado (PDF) desde el original el 16 de abril de 2021 . Consultado el 25 de enero de 2021 .
  154. ^ abc Voloch CM, da Silva Francisco R, de Almeida LG, Cardoso CC, Brustolini OJ, Gerber AL, et al. (Marzo de 2021). "Caracterización genómica de un nuevo linaje de SARS-CoV-2 de Río de Janeiro, Brasil". Revista de Virología . 95 (10). doi : 10.1128/jvi.00119-21 . PMC 8139668 . PMID  33649194. 
  155. ^ Nascimento V, Souza V (25 de febrero de 2021). "La epidemia de COVID-19 en el estado brasileño de Amazonas fue impulsada por la persistencia a largo plazo de linajes endémicos de SARS-CoV-2 y la reciente aparición de la nueva variante de preocupación P.1". Plaza de la Investigación . doi : 10.21203/rs.3.rs-275494/v1 . Archivado desde el original el 1 de marzo de 2021 . Consultado el 2 de marzo de 2021 .
  156. ^ Faria NR, Mellan TA, Whittaker C, Claro IM, Candido DD, Mishra S, et al. (mayo de 2021). "Genómica y epidemiología del linaje P.1 SARS-CoV-2 en Manaos, Brasil". Ciencia . 372 (6544): 815–821. Código Bib : 2021 Ciencia... 372..815F. doi : 10.1126/ciencia.abh2644 . ISSN  0036-8075. PMC 8139423 . PMID  33853970. Dentro de esta región plausible del espacio de parámetros, P.1 puede ser entre 1,7 y 2,4 veces más transmisible (50 % BCI, 2,0 mediana, con una probabilidad posterior del 99 % de ser >1) que los linajes locales no P1 y puede evadir del 21 al 46% (50% BCI, 32% de mediana, con una probabilidad posterior del 95% de poder evadir al menos el 10%) de la inmunidad protectora provocada por una infección previa con linajes distintos de P.1, correspondiente a 54 a 79 % (50 % BCI, 68 % mediana) de inmunidad cruzada... Estimamos que las infecciones tienen entre 1,2 y 1,9 veces más probabilidades (50 % BCI, mediana 1,5, 90 % de probabilidad posterior de ser >1) de provocar mortalidad en el período posterior a la aparición de P.1, en comparación con antes, aunque las estimaciones posteriores de este riesgo relativo también se correlacionan con la inmunidad cruzada inferida. En términos más generales, la reciente epidemia en Manaos ha puesto a prueba el sistema de atención médica de la ciudad, lo que ha provocado un acceso inadecuado a la atención médica. Por lo tanto, no podemos determinar si el aumento estimado en el riesgo relativo de mortalidad se debe a la infección por P.1, al estrés en el sistema de atención de salud de Manaos o a ambos. Se necesitan investigaciones clínicas detalladas de las infecciones por P.1. 
  157. ^ Andreoni M, Londoño E, Casado L (3 de marzo de 2021). "La crisis de Covid en Brasil es una advertencia para todo el mundo, dicen los científicos: Brasil está experimentando un número récord de muertes y la propagación de una variante del coronavirus más contagiosa que puede causar reinfección". Los New York Times . Archivado desde el original el 3 de marzo de 2021 . Consultado el 3 de marzo de 2021 .
  158. ^ Zimmer C (1 de marzo de 2021). "La variante del virus en Brasil infectó a muchos que ya se habían recuperado del Covid-19. Los primeros estudios detallados de la variante llamada P.1 muestran cómo devastó una ciudad brasileña. Ahora los científicos quieren saber qué hará en otros lugares". Los New York Times . Archivado desde el original el 3 de marzo de 2021 . Consultado el 3 de marzo de 2021 .
  159. ^ Sofía Moutinho (4 de mayo de 2021). "La vacuna china COVID-19 mantiene la protección en un Brasil plagado de variantes". Ciencia . doi : 10.1126/ciencia.abi9414. S2CID  234804602. Archivado desde el original el 16 de junio de 2021 . Consultado el 4 de mayo de 2021 .
  160. ^ Gaier R (5 de marzo de 2021). "Exclusivo: un estudio de Oxford indica que AstraZeneca es eficaz contra la variante brasileña, dice la fuente". Reuters . Rio de Janeiro. Archivado desde el original el 9 de marzo de 2021 . Consultado el 9 de marzo de 2021 .
  161. ^ "Exclusivo: un estudio de Oxford indica que AstraZeneca es eficaz contra la variante brasileña, dice la fuente". Reuters . Rio de Janeiro. 8 de marzo de 2021. Archivado desde el original el 9 de marzo de 2021 . Consultado el 9 de marzo de 2021 .
  162. ^ Simões E, Gaier R (8 de marzo de 2021). "CoronaVac e Oxford são eficaces contra variante de Manaus, dizem laboratórios" [CoronaVac y Oxford son eficaces contra la variante de Manaus, dicen los laboratorios]. UOL Notícias (en portugues). Reuters Brasil. Archivado desde el original el 8 de marzo de 2021 . Consultado el 9 de marzo de 2021 .
  163. ^ "La cepa Covid globalmente dominante Delta, ahora extendida a 185 países: OMS". 22 de septiembre de 2021.
  164. ^ "Linajes PANGO". cov-lineages.org . Archivado desde el original el 3 de junio de 2021 . Consultado el 18 de abril de 2021 .
  165. ^ abcd Koshy J (8 de abril de 2021). "Coronavirus | Cepa india 'doble mutante' llamada B.1.617". El hindú . Archivado desde el original el 26 de mayo de 2021 . Consultado el 10 de abril de 2021 .
  166. ^ "La segunda ola de la India impulsada por variantes coincidió con un aumento en el número de vuelos infectados que aterrizaban en Canadá". Sol de Toronto . 10 de abril de 2021. Archivado desde el original el 2 de junio de 2021 . Consultado el 10 de abril de 2021 .
  167. ^ "Actualización epidemiológica semanal sobre COVID-19". Organización Mundial de la Salud . 11 de mayo de 2021. Archivado desde el original el 11 de mayo de 2021 . Consultado el 12 de mayo de 2021 .
  168. ^ "La cepa de COVID detectada por primera vez en la India se encuentra en 53 territorios: OMS". www.aljazeera.com . Archivado desde el original el 19 de junio de 2021 . Consultado el 27 de mayo de 2021 .
  169. ^ Mishra S, Mindermann S, Sharma M, Whittaker C, Mellan TA, Wilton T, et al. (1 de septiembre de 2021). "Composición cambiante de los linajes del SARS-CoV-2 y aumento de la variante Delta en Inglaterra". eMedicina Clínica . 39 : 101064. doi : 10.1016/j.eclinm.2021.101064. ISSN  2589-5370. PMC 8349999 . PMID  34401689. 
  170. ^ "Los científicos británicos advierten sobre la variante india del coronavirus". Reuters . 7 de mayo de 2021. Archivado desde el original el 22 de mayo de 2021 . Consultado el 7 de mayo de 2021 .
  171. ^ "Reacción de los expertos ante la clasificación de VUI-21APR-02/B.1.617.2 por PHE como una variante preocupante". Centro de medios científicos . 7 de mayo de 2021. Archivado desde el original el 13 de julio de 2021 . Consultado el 15 de mayo de 2021 .
  172. ^ Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 y variantes bajo investigación en Inglaterra, informe técnico 14 (PDF) (Reunión informativa). Salud pública de Inglaterra. 3 de junio de 2021. GOV-8530. Archivado (PDF) desde el original el 4 de julio de 2021 . Consultado el 26 de junio de 2021 .
  173. ^ Pearson H, Pullen L, Dao C (11 de junio de 2021). "AHS desglosa los datos de vacunación del brote de la variante Delta de COVID-19 en el hospital de Calgary". Noticias globales . Archivado desde el original el 12 de junio de 2021 . Consultado el 12 de junio de 2021 .
  174. ^ Schraer R (4 de junio de 2021). "'Variante de Nepal: ¿Cuál es la mutación que impide los viajes de la lista verde a Portugal? ". Noticias de la BBC . Archivado desde el original el 19 de junio de 2021 . Consultado el 18 de junio de 2021 .
  175. ^ Acharya B, Jamkhandikar S (23 de junio de 2021). "Explicación: ¿Qué es la variante Delta del coronavirus con mutación K417N?". Reuters . Archivado desde el original el 23 de junio de 2021 . Consultado el 23 de junio de 2021 .
  176. ^ Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 y variantes bajo investigación en Inglaterra, informe técnico 17 (PDF) (Reunión informativa). Salud pública de Inglaterra. 25 de junio de 2021. GOV-8576. Archivado (PDF) desde el original el 25 de junio de 2021 . Consultado el 26 de junio de 2021 .
  177. ^ Sharma M. "Identificada nueva variante 'Delta Plus' del SARS-CoV-2; esto es lo que sabemos hasta ahora". India hoy . Archivado desde el original el 17 de junio de 2021 . Consultado el 16 de junio de 2021 .
  178. ^ Cutler S (18 de junio de 2021). "'Variante de Nepal: lo que hemos aprendido hasta ahora ". La conversación . Archivado desde el original el 18 de junio de 2021 . Consultado el 18 de junio de 2021 .
  179. ^ Tang JW, Oliver T (2021). "Introducción de la variante sudafricana 501Y.V2 del SARS-CoV-2 en el Reino Unido". El diario de la infección . 82 (4): e8–e10. doi :10.1016/j.jinf.2021.01.007. PMC 7813514 . PMID  33472093. 
  180. ^ "India dice que la nueva variante de COVID es motivo de preocupación". Reuters . Bangalore. 22 de junio de 2021. Archivado desde el original el 23 de junio de 2021 . Consultado el 23 de junio de 2021 .
  181. ^ Biswas S (23 de junio de 2021). "Delta plus: los científicos dicen que es demasiado pronto para determinar el riesgo de la variante Covid-19". Noticias de la BBC . Archivado desde el original el 23 de junio de 2021 . Consultado el 23 de junio de 2021 .
  182. ^ Roberts M (19 de octubre de 2021). "Covid-19: nueva mutación de la variante Delta bajo estrecha vigilancia en el Reino Unido". www.bbc.co.uk.​ Consultado el 19 de octubre de 2021 .
  183. ^ "Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2". www.who.int . 7 de junio de 2022. Archivado desde el original el 22 de junio de 2022 . Consultado el 23 de junio de 2022 .
  184. ^ "La cepa COVID-19 del sur de California expande rápidamente su alcance global". Sala de prensa Cedars-Sinai . Los Angeles . 11 de febrero de 2021. Archivado desde el original el 16 de abril de 2021 . Consultado el 17 de marzo de 2021 .
  185. ^ Latif AA, Mullen JL, Alkuzweny M, Tsueng G, Cano M, Haag E, et al. (El Centro de Biología de Sistemas Virales). "Informe de linaje B.1.429". brote.info . Archivado desde el original el 3 de julio de 2021 . Consultado el 28 de mayo de 2021 .
  186. ^ ab "La nueva variante de California puede estar impulsando un aumento de virus allí, sugiere un estudio". Los New York Times . 19 de enero de 2021. Archivado desde el original el 9 de junio de 2021 . Consultado el 20 de enero de 2021 .
  187. ^ Azad A (17 de marzo de 2021). "Las cepas de coronavirus detectadas por primera vez en California son oficialmente 'variantes preocupantes', dicen los CDC". CNN . Archivado desde el original el 6 de junio de 2021 . Consultado el 6 de junio de 2021 .
  188. ^ Shen X, Tang H, Pajon R, Smith G, Glenn GM, Shi W, et al. (junio de 2021). "Neutralización de las variantes B.1.429 y B.1.351 del SARS-CoV-2". El diario Nueva Inglaterra de medicina . 384 (24): 2352–2354. doi : 10.1056/NEJMc2103740 . PMC 8063884 . PMID  33826819. 
  189. ^ "Clasificaciones y definiciones de variantes del SARS-CoV-2: actualizado el 23 de junio de 2021". CDC.gov . Centros de Control y Prevención de Enfermedades. 23 de junio de 2021. Archivado desde el original el 29 de junio de 2021.
  190. ^ abc Zimmer C, Mandavilli A (14 de mayo de 2021). "Cómo Estados Unidos venció a las variantes, por ahora". Los New York Times . Archivado desde el original el 16 de mayo de 2021 . Consultado el 17 de mayo de 2021 .
  191. ^ Wadman M (23 de febrero de 2021). "La cepa de coronavirus de California puede ser más infecciosa y letal". Noticias de ciencia . doi : 10.1126/ciencia.abh2101. Archivado desde el original el 1 de mayo de 2021 . Consultado el 17 de marzo de 2021 .
  192. ^ Ho C (28 de febrero de 2021). "¿Las pruebas de coronavirus funcionan con variantes?". Crónica de San Francisco . Archivado desde el original el 24 de junio de 2021 . Consultado el 24 de junio de 2021 .
  193. ^ "Cepa local de COVID-19 encontrada en más de un tercio de los pacientes de Los Ángeles". En cuanto a noticias (Comunicado de prensa). California: Centro médico Cedars Sinai. 19 de enero de 2021. Archivado desde el original el 13 de junio de 2021 . Consultado el 3 de marzo de 2021 .
  194. ^ ab "B.1.429". Grupo Rambaut, Universidad de Edimburgo . Linajes PANGO. 15 de febrero de 2021. Archivado desde el original el 28 de abril de 2021 . Consultado el 16 de febrero de 2021 .
  195. ^ ab "Informe de linaje B.1.429". Investigación Scripps . brote.info. 15 de febrero de 2021. Archivado desde el original el 9 de junio de 2021 . Consultado el 16 de febrero de 2021 .
  196. ^ "La variante de COVID-19 encontrada por primera vez en otros países y estados ahora se ve con más frecuencia en California". Departamento de Salud Pública de California . Archivado desde el original el 16 de junio de 2021 . Consultado el 30 de enero de 2021 .
  197. ^ Weise E, Weintraub K. "Las nuevas cepas de COVID que se mueven rápidamente por los EE. UU. necesitan una vigilancia cuidadosa, dicen los científicos". EE.UU. Hoy en día . Archivado desde el original el 4 de marzo de 2021 . Consultado el 30 de enero de 2021 .
  198. ^ "Delta-PCR-testen" [La prueba Delta PCR] (en danés). Instituto Statens Serum. 25 de febrero de 2021. Archivado desde el original el 7 de febrero de 2021 . Consultado el 27 de febrero de 2021 .
  199. ^ ab "Variantes GISAID hCOV19 (ver opción de menú 'G/484K.V3 (B.1.525)')". GISAID . Archivado desde el original el 23 de junio de 2021 . Consultado el 4 de marzo de 2021 .
  200. ^ ab "Status for udvikling af SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) i Danmark" [Estado de desarrollo de SARS-CoV-2 Variants of Concern (VOC) en Dinamarca] (en danés). Instituto Statens Serum. 27 de febrero de 2021. Archivado desde el original el 27 de agosto de 2021 . Consultado el 27 de febrero de 2021 .
  201. ^ ab "Informe de linaje internacional B.1.525". cov-lineages.org . Equipo Pango . 19 de mayo de 2021. Archivado desde el original el 9 de junio de 2021 . Consultado el 16 de febrero de 2021 .
  202. ^ Roberts M (16 de febrero de 2021). "Otra nueva variante de coronavirus vista en el Reino Unido". Noticias de la BBC . Archivado desde el original el 20 de junio de 2021 . Consultado el 16 de febrero de 2021 .
  203. ^ "El DOH confirma la detección de 2 mutaciones del SARS-CoV-2 en la Región 7". Noticias ABS-CBN . 18 de febrero de 2021. Archivado desde el original el 3 de mayo de 2021 . Consultado el 13 de marzo de 2021 .
  204. ^ Santos E (13 de marzo de 2021). "El DOH informa que la variante de COVID-19 es 'única' de PH, el primer caso de la variante de Brasil". CNN Filipinas . Archivado desde el original el 16 de marzo de 2021 . Consultado el 17 de marzo de 2021 .
  205. ^ "El DOH confirma la nueva variante de COVID-19 detectada por primera vez en PH, el primer caso de la variante de Brasil". Noticias ABS-CBN . 13 de marzo de 2021. Archivado desde el original el 2 de mayo de 2021 . Consultado el 13 de marzo de 2021 .
  206. ^ "PH descubrió una nueva variante de COVID-19 antes que Japón, aclara experto". CNN Filipinas . 13 de marzo de 2021. Archivado desde el original el 17 de marzo de 2021 . Consultado el 17 de marzo de 2021 .
  207. ^ "Japón detecta nueva variante de coronavirus de viajero procedente de PH". CNN Filipinas . 13 de marzo de 2021. Archivado desde el original el 16 de marzo de 2021 . Consultado el 21 de marzo de 2021 .
  208. ^ "El Reino Unido informa 2 casos de la variante de COVID-19 detectada por primera vez en Filipinas". ABS-CBN . 17 de marzo de 2021. Archivado desde el original el 18 de marzo de 2021 . Consultado el 21 de marzo de 2021 .
  209. ^ "Covid-19: Sarawak detecta variante reportada en Filipinas". 30 de abril de 2021. Archivado desde el original el 1 de mayo de 2021 . Consultado el 30 de abril de 2021 .
  210. ^ Mandavilli A (24 de febrero de 2021). "Una nueva variante del coronavirus se está propagando en Nueva York, informan los investigadores". Los New York Times . Archivado desde el original el 26 de abril de 2021 . Consultado el 22 de abril de 2021 .
  211. ^ Actualización epidemiológica semanal sobre COVID-19 - 27 de abril de 2021 (Informe de situación). Organización Mundial de la Salud. 27 de abril de 2021. Archivado desde el original el 14 de junio de 2021 . Consultado el 14 de junio de 2021 .
  212. ^ Le Page M (4 de junio de 2021). "Variante india de covid-19 (B.1.617)". Científico nuevo . Archivado desde el original el 23 de junio de 2021 . Consultado el 8 de junio de 2021 .
  213. ^ Nuki P, Newey S (16 de abril de 2021). "La llegada de la 'doble mutación' de la India se suma a los problemas de las variantes, pero la amenaza que representa sigue sin estar clara". El Telégrafo . ISSN  0307-1235. Archivado desde el original el 21 de junio de 2021 . Consultado el 17 de abril de 2021 .
  214. ^ "Coronavirus Covid 19: variante Lambda ultracontagiosa detectada en Australia". Heraldo de Nueva Zelanda . Archivado desde el original el 6 de julio de 2021 . Consultado el 6 de julio de 2021 .
  215. ^ "COVID-19: la variante Lambda puede ser más resistente a las vacunas que otras cepas". WION . Archivado desde el original el 6 de julio de 2021 . Consultado el 6 de julio de 2021 .
  216. ^ "Variante Lambda: ¿Cuál es la nueva cepa de Covid detectada en el Reino Unido?". El independiente . 6 de julio de 2021. Archivado desde el original el 6 de julio de 2021 . Consultado el 6 de julio de 2021 .
  217. ^ "¿Qué es la variante Mu de COVID-19?". www.abc.net.au.​ 1 de septiembre de 2021. Archivado desde el original el 1 de septiembre de 2021 . Consultado el 1 de septiembre de 2021 .
  218. ^ O'Neill L (3 de septiembre de 2021). "Mu: todo lo que necesitas saber sobre la nueva variante de interés del coronavirus". La conversación . Archivado desde el original el 3 de septiembre de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .
  219. ^ ab "Detección de la variante de la proteína de pico P681H del SARS-CoV-2 en Nigeria". Virológico . 23 de diciembre de 2020. Archivado desde el original el 13 de junio de 2021 . Consultado el 1 de enero de 2021 .
  220. ^ "Linaje B.1.1.207". cov-lineages.org . Equipo Pango . Archivado desde el original el 27 de enero de 2021 . Consultado el 11 de marzo de 2021 .
  221. ^ "A los viajeros de Queensland se les extiende la cuarentena en el hotel después de que se detecte la variante rusa del coronavirus". www.abc.net.au.​ 3 de marzo de 2021. Archivado desde el original el 3 de marzo de 2021 . Consultado el 3 de marzo de 2021 .
  222. ^ Koshy J (21 de abril de 2021). "Nueva variante de coronavirus encontrada en Bengala Occidental". www.thehindu.com . Archivado desde el original el 26 de mayo de 2021 . Consultado el 23 de abril de 2021 .
  223. ^ "¿Cuál es la nueva 'variante triple mutante' del virus Covid-19 encontrada en Bengala? ¿Qué tan grave es?". www.indiatoday.in . Archivado desde el original el 28 de abril de 2021 . Consultado el 23 de abril de 2021 .
  224. ^ "Linajes PANGO Linaje B.1.618". cov-lineages.org . Archivado desde el original el 14 de mayo de 2021 . Consultado el 23 de abril de 2021 .
  225. ^ "Detección de nuevas variantes del SARS-CoV-2 en las aguas residuales de la ciudad de Nueva York". Universidad de Misuri . Consultado el 10 de marzo de 2022 .
  226. ^ ab Smyth DS, Trujillo M, Gregory DA, Cheung K, Gao A, Graham M, et al. (3 de febrero de 2022). "Seguimiento de linajes crípticos de SARS-CoV-2 detectados en aguas residuales de Nueva York". Comunicaciones de la naturaleza . 13 (1): 635. Código bibliográfico : 2022NatCo..13..635S. doi :10.1038/s41467-022-28246-3. ISSN  2041-1723. PMC 8813986 . PMID  35115523. 
  227. ^ Browne E (4 de enero de 2022). "Lo que sabemos sobre la variante B.1.640.2 de COVID" IHU "con 46 mutaciones". Semana de noticias . Archivado desde el original el 5 de enero de 2022 . Consultado el 5 de enero de 2022 .
  228. ^ Freund A (7 de enero de 2022). "Coronavirus: los expertos en salud no se alarman por la variante identificada en Francia". Deutsche Welle . Archivado desde el original el 7 de enero de 2022 . Consultado el 8 de enero de 2022 .
  229. ^ ab Freund A (4 de enero de 2022). "Nueva variante de coronavirus identificada en Francia". Deutsche Welle . Archivado desde el original el 5 de enero de 2022 . Consultado el 5 de enero de 2022 .
  230. ^ ab Bengali S (5 de enero de 2022). "Una variante encontrada en Francia no es motivo de preocupación, dice la OMS". Los New York Times . ISSN  0362-4331. Archivado desde el original el 6 de enero de 2022 . Consultado el 5 de enero de 2022 .
  231. ^ "Seguimiento de variantes del SARS-CoV-2". Organización Mundial de la Salud . Archivado desde el original el 25 de noviembre de 2021 . Consultado el 5 de enero de 2022 .
  232. ^ Cobbe E (6 de enero de 2022). "'La variante del coronavirus IHU está en nuestro radar, pero no es una amenaza, dice la Organización Mundial de la Salud ". Noticias CBS . Archivado desde el original el 7 de enero de 2022 . Consultado el 8 de enero de 2022 .
  233. ^ Chaturvedi A (4 de enero de 2022). "La nueva variante de Covid-19 'IHU' descubierta en Francia tiene más mutaciones que Omicron". Tiempos del Indostán . Archivado desde el original el 5 de enero de 2022 . Consultado el 5 de enero de 2022 .
  234. ^ "COVID-19: Nueva variante, B.1.640.2, detectada en Francia - estudio". El Correo de Jerusalén . Archivado desde el original el 4 de enero de 2022 . Consultado el 4 de enero de 2022 .
  235. ^ "¿Qué es la variante Deltacron de Covid y dónde se ha encontrado?". El guardián . 11 de marzo de 2022 . Consultado el 18 de abril de 2022 .
  236. ^ Lapid N (9 de marzo de 2022). "Identificada variante que combina Delta y Omicron; los perros detectan virus con gran precisión". Reuters . Consultado el 18 de abril de 2022 .
  237. ^ "Transcripción de la conferencia de prensa virtual COVID-19, Ucrania y otras emergencias sanitarias mundiales - 16 de marzo de 2022". www.who.int . Consultado el 24 de abril de 2022 .
  238. ^ Snider M. "Puede haber una nueva variante de COVID, Deltacron. Esto es lo que sabemos al respecto". EE.UU. HOY EN DÍA . Consultado el 24 de abril de 2022 .
  239. ^ ab Colson P, Fournier P, Delerce J, Million M, Bedotto M, Houhamdi L, et al. (16 de marzo de 2022). "Cultivo e identificación de un" Deltamicron "SARS-CoV-2 en un grupo de tres casos en el sur de Francia". págs. 3739–3749. medRxiv 10.1101/2022.03.03.22271812v2 . 
  240. ^ "Delta (AY.4) y BA.1 recombinantes en Francia/Dinamarca [~ 30 seqs, aislado/aprobado en Vero] · Número 444 · linajes-cov/designación-pango". GitHub . Consultado el 24 de abril de 2022 .
  241. ^ O'Neill L (21 de marzo de 2022). "Deltacron: lo que los científicos saben hasta ahora sobre este nuevo coronavirus híbrido". La conversación . Consultado el 18 de abril de 2022 .
  242. ^ Sundaravelu A (28 de julio de 2023). "Los científicos encuentran la variante de Covid 'más mutada' y 'más extrema' jamás encontrada en un paciente". Noticias Metro . Consultado el 28 de julio de 2023 .
  243. ^ "新型コロナウイルス変異株とは | 日本医学臨床検査研究所" [¿Qué es la nueva mutación del coronavirus? Laboratorio de laboratorio médico de Japón]. Archivado desde el original el 3 de septiembre de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .
  244. ^ "Variante: 21G (Lambda)". Covariantes . Archivado desde el original el 21 de julio de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .
  245. ^ Frank Diamond (7 de agosto de 2021). "Más datos apuntan a la letalidad potencial de la variante Lambda". Control de infecciones hoy . Archivado desde el original el 3 de septiembre de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .
  246. ^ Kimura I, Kosugi Y, Wu J, Yamasoba D, Butlertanaka EP, Tanaka YL, et al. (2021). "La variante Lambda del SARS-CoV-2 muestra una mayor infectividad y resistencia inmune". Informes celulares . 38 (2): 110218. bioRxiv 10.1101/2021.07.28.454085 . doi :10.1016/j.celrep.2021.110218. hdl :2433/267436. PMC 8683271 . PMID  34968415. S2CID  236520241. Archivado desde el original el 16 de septiembre de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .  
  247. ^ abcdefg Greenwood M (15 de enero de 2021). "¿Qué mutaciones del SARS-CoV-2 están causando preocupación?". Noticias Ciencias de la vida médicas . Archivado desde el original el 16 de enero de 2021 . Consultado el 16 de enero de 2021 .
  248. ^ Tandel D, Gupta D, Sah V, Harshan KH (30 de abril de 2021). "La variante N440K del SARS-CoV-2 tiene una mayor aptitud infecciosa". bioRxiv 10.1101/2021.04.30.441434 . 
  249. ^ Bhattacharjee S (3 de mayo de 2021). "COVID-19 | Cepa AP al menos 15 veces más virulenta". El hindú . Archivado desde el original el 10 de mayo de 2021 . Consultado el 4 de mayo de 2021 .
  250. ^ "Variante N440k Covid: mutante N440K 10 veces más infeccioso que la cepa original | Hyderabad News". Los tiempos de la India . 2 de mayo de 2021. Archivado desde el original el 30 de agosto de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .
  251. ^ "感染・伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される 新型コロナウイルス（SARS-CoV-2）の新規変異株について （第13報）" [Nuevas cepas mutantes del nuevo coronavirus (SARS-CoV) -2) Preocupado por el aumento de la infectividad y transmisibilidad y los cambios en la antigenicidad (13º informe)]. Archivado desde el original el 3 de septiembre de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .
  252. ^ "Mutaciones en pico supuestamente relacionadas con un brote en granjas de visones daneses". GISAID . Archivado desde el original el 3 de septiembre de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .
  253. ^ "Universidad de Graz". www.uni-graz.at . Archivado desde el original el 6 de mayo de 2021 . Consultado el 22 de febrero de 2021 .
  254. ^ "Coronavirus SARS-CoV-2 (anteriormente conocido como coronavirus de Wuhan y 2019-nCoV): lo que podemos descubrir a nivel de bioinformática estructural". Inóforo . 23 de enero de 2020 . Consultado el 22 de febrero de 2021 .
  255. ^ Singh A, Steinkellner G, Köchl K, Gruber K, Gruber CC (febrero de 2021). "La serina 477 desempeña un papel crucial en la interacción de la proteína de pico del SARS-CoV-2 con el receptor humano ACE2". Informes científicos . 11 (1): 4320. Código bibliográfico : 2021NatSR..11.4320S. doi : 10.1038/s41598-021-83761-5 . PMC 7900180 . PMID  33619331. 
  256. ^ "BioNTech: Aspiramos a individualizar la medicina contra el cáncer". BioNTech . Archivado desde el original el 18 de junio de 2021 . Consultado el 22 de febrero de 2021 .
  257. ^ Schroers B, Gudimella R, Bukur T, Roesler T, Loewer M, Sahin U (4 de febrero de 2021). "El análisis a gran escala de mutantes de glicoproteína de pico del SARS-CoV-2 demuestra la necesidad de una detección continua de aislados de virus". bioRxiv 10.1101/2021.02.04.429765 . 
  258. ^ "La gente habla de una variante 'doble mutante' en la India. ¿Qué significa eso?". NPR . Archivado desde el original el 27 de abril de 2021 . Consultado el 27 de abril de 2021 . ...científicamente, el término "doble mutante" no tiene sentido, dice Andersen. "El SARS-CoV-2 muta todo el tiempo. Así que hay muchos mutantes dobles por todas partes. La variante en la India realmente no debería llamarse así".
  259. ^ abc Mandavilli A, Mueller B (2 de marzo de 2021). "Por qué las variantes de virus tienen nombres tan extraños". Los New York Times . ISSN  0362-4331. Archivado desde el original el 20 de junio de 2021 . Consultado el 2 de marzo de 2021 .
  260. ^ "escapar de la mutación". VIH i-Base . 11 de octubre de 2012. Archivado desde el original el 9 de mayo de 2021 . Consultado el 19 de febrero de 2021 .
  261. ^ Wise J (febrero de 2021). "Covid-19: La mutación E484K y los riesgos que plantea". BMJ . 372 : n359. doi : 10.1136/bmj.n359 . PMID  33547053. S2CID  231821685.
  262. ^ abc "Breve informe: Nueva variante del SARS-CoV-2 identificada en viajeros procedentes de Brasil" (PDF) (Presione soltar). Japón: NIID (Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas). 12 de enero de 2021. Archivado (PDF) desde el original el 15 de enero de 2021 . Consultado el 14 de enero de 2021 .
  263. ^ Investigación de la nueva variante del SARS-CoV-2 202012/01, informe técnico 5 (PDF) (informe informativo). Salud pública de Inglaterra. 2 de febrero de 2021. GW-1905. Archivado (PDF) desde el original el 29 de junio de 2021 . Consultado el 14 de junio de 2021 .
  264. ^ Greaney AJ, Loes AN, Crawford KH, Starr TN, Malone KD, Chu HY, et al. (Marzo de 2021). "Mapeo completo de mutaciones en el dominio de unión al receptor del SARS-CoV-2 que afectan el reconocimiento por parte de los anticuerpos policlonales del plasma humano". Célula huésped y microbio . 29 (3): 463–476.e6. doi :10.1016/j.chom.2021.02.003. PMC 7869748 . PMID  33592168. 
  265. ^ Kupferschmidt K (enero de 2021). "Nuevas mutaciones plantean el espectro de un 'escape inmunológico'". Ciencia . 371 (6527): 329–330. Código Bib : 2021 Ciencia... 371.. 329K. doi : 10.1126/ciencia.371.6527.329 . PMID  33479129.
  266. ^ Rettner R (2 de febrero de 2021). "La variante del coronavirus del Reino Unido desarrolla una mutación que evade la vacuna. En algunos casos, la variante del coronavirus del Reino Unido ha desarrollado una mutación llamada E484K, que puede afectar la eficacia de la vacuna". Ciencia Viva . Archivado desde el original el 2 de febrero de 2021 . Consultado el 2 de febrero de 2021 .
  267. ^ Achenbach J, stand W (2 de febrero de 2021). "Se observa una mutación preocupante del coronavirus en la variante del Reino Unido y en algunas muestras de EE. UU.". El Washington Post . Archivado desde el original el 2 de febrero de 2021 . Consultado el 2 de febrero de 2021 .
  268. ^ "東京五輪で"最凶"の「ラムダ株」が上陸 ワクチン効果は5分の1？" [¿La "cepa Lambda" aterrizó en los Juegos Olímpicos de Tokio y el efecto de la vacuna es de una quinta parte?]. buenoニュース. Archivado desde el original el 3 de septiembre de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .
  269. ^ "La variante Lambda: ¿es más infecciosa y puede escapar a las vacunas? Explica un virólogo". La conversación . 21 de julio de 2021. Archivado desde el original el 3 de septiembre de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .
  270. ^ ab Actualización de COG-UK sobre mutaciones de pico de interés especial del SARS-CoV-2: Informe 1 (PDF) (Reporte). Consorcio de Genómica del Reino Unido COVID-19 (COG-UK). 20 de diciembre de 2020. p. 7. Archivado desde el original (PDF) el 25 de diciembre de 2020 . Consultado el 31 de diciembre de 2020 .
  271. ^ "Los investigadores descubren una nueva variante del virus COVID-19 en Columbus, Ohio". wexnermedical.osu.edu . 13 de enero de 2021. Archivado desde el original el 15 de enero de 2021 . Consultado el 16 de enero de 2021 .
  272. ^ Tu H, Avenarius MR, Kubatko L, Hunt M, Pan X, Ru P, et al. (26 de enero de 2021). "Patrones distintos de aparición de variantes de picos del SARS-CoV-2, incluido N501Y, en muestras clínicas en Columbus, Ohio". bioRxiv 10.1101/2021.01.12.426407 . 
  273. ^ "新たな変異ある「デルタ株」検出 感染力への影響分からず" [Detección de una nueva "cepa Delta" mutante. Se desconoce el efecto sobre la infectividad]. NHKニュース. 31 de agosto de 2021. Archivado desde el original el 1 de septiembre de 2021 . Consultado el 2 de septiembre de 2021 .
  274. ^ "「N501S 変異を有する新たなデルタ株（B.1.617.2 系統）の市中感染事例(国内第１例目)を確認」 ～医科歯科大 新型コロナウイルス全ゲノム解析プロジェクト 第８報～" ["Confirmado un caso de infección adquirida en la comunidad (primer caso en Japón) de una nueva cepa delta (cepa B.1.617.2) con mutación N501S" -Octavo informe del Proyecto de análisis del genoma completo del nuevo coronavirus de la Universidad de Medicina y Odontología-] (PDF ) ) . Archivado (PDF) desde el original el 30 de agosto de 2021 . Consultado el 2 de septiembre de 2021 .
  275. ^ abcd Maison DP, Ching LL, Shikuma CM, Nerurkar VR (enero de 2021). "Las características genéticas y la filogenia de la secuencia del gen S de 969 pb del SARS-CoV-2 de Hawái revelan la mutación P681H emergente a nivel mundial". bioRxiv 10.1101/2021.01.06.425497 .  Disponible bajo CC BY 4.0 Archivado el 16 de octubre de 2017 en Wayback Machine .
  276. ^ Corum J, Zimmer C (9 de febrero de 2021). "Rastreador de variantes del coronavirus". Los New York Times . Archivado desde el original el 30 de noviembre de 2021 . Consultado el 1 de diciembre de 2021 . Actualizado constantemente
  277. ^ Schraer R (18 de julio de 2020). "Coronavirus: ¿Las mutaciones lo hacen más infeccioso?". Noticias de la BBC . Archivado desde el original el 30 de diciembre de 2020 . Consultado el 3 de enero de 2021 .
  278. ^ "Una nueva cepa de COVID-19, más infecciosa, domina ahora los casos mundiales de virus: estudio". medicalxpress.com . Archivado desde el original el 17 de noviembre de 2020 . Consultado el 16 de agosto de 2020 .
  279. ^ Korber B, Fischer WM, Gnanakaran S, Yoon H, Theiler J, Abfalterer W, et al. (agosto de 2020). "Seguimiento de cambios en el pico de SARS-CoV-2: evidencia de que D614G aumenta la infectividad del virus COVID-19". Celúla . 182 (4): 812–827.e19. doi : 10.1016/j.cell.2020.06.043 . PMC 7332439 . PMID  32697968. 
  280. ^ Hou YJ, Chiba S, Halfmann P, Ehre C, Kuroda M, Dinnon KH y col. (diciembre de 2020). "La variante SARS-CoV-2 D614G muestra una replicación eficiente ex vivo y transmisión in vivo". Ciencia . 370 (6523): 1464-1468. Código Bib : 2020 Ciencia... 370.1464H. doi : 10.1126/science.abe8499. PMC 7775736 . PMID  33184236. una sustitución emergente de Asp614→Gly (D614G) en la glicoproteína de pico de las cepas de SARS-CoV-2 que ahora es la forma más prevalente a nivel mundial 
  281. ^ Volz EM, Hill V, McCrone JT, Price A, Jorgensen D, O'Toole A, et al. (4 de agosto de 2020). "Evaluación de los efectos de la mutación D614G de Spike del SARS-CoV-2 sobre la transmisibilidad y patogenicidad". Celúla . 184 (1): 64–75.e11. doi :10.1016/j.cell.2020.11.020. hdl : 10044/1/84079 . PMC 7674007 . PMID  33275900. 
  282. ^ Butowt R, Bilinska K, Von Bartheld CS (octubre de 2020). "Disfunción quimiosensorial en COVID-19: integración de datos genéticos y epidemiológicos apunta a la variante de proteína de pico D614G como factor contribuyente". ACS Neurociencia Química . 11 (20): 3180–3184. doi : 10.1021/acschemneuro.0c00596 . PMC 7581292 . PMID  32997488. 
  283. ^ ab Hodcroft EB, Domman DB, Snyder DJ, Oguntuyo KY, Van Diest M, Densmore KH, et al. (21 de febrero de 2021). "Aparición a finales de 2020 de múltiples linajes de variantes de la proteína Spike del SARS-CoV-2 que afectan la posición 677 del aminoácido". medRxiv 10.1101/2021.02.12.21251658 . 
  284. ^ "Un estudio encuentra 7 variantes de COVID-19 recientemente identificadas que circulan en los Estados Unidos". ABC11 Raleigh-Durham . 15 de febrero de 2021. Archivado desde el original el 3 de septiembre de 2021 . Consultado el 3 de septiembre de 2021 .
  285. ^ "Un estudio muestra que la mutación P681H se está volviendo prevalente a nivel mundial entre las secuencias del SARS-CoV-2". Noticias-Medical.net . 10 de enero de 2021. Archivado desde el original el 14 de febrero de 2021 . Consultado el 11 de febrero de 2021 .
  286. ^ "Malasia identifica una nueva cepa de Covid-19, similar a una encontrada en otros tres países". Los tiempos del estrecho . 23 de diciembre de 2020. Archivado desde el original el 23 de diciembre de 2020 . Consultado el 10 de enero de 2021 . Tan Sri Dr. Noor Hisham Abdullah, dijo que aún se desconoce si la cepa, denominada mutación "A701B", es más infecciosa de lo habitual.
  287. ^ "Duterte dice que Sulu busca ayuda después de que se detectara una nueva variante de COVID-19 en la cercana Sabah, Malasia". Noticias GMA . 27 de diciembre de 2020. Archivado desde el original el 3 de enero de 2021 . Consultado el 10 de enero de 2021 .
  288. ^ abcd "La situación actual e información sobre la mutación de la proteína Spike de Covid-19 en Malasia". Kementerian Kesihatan Malasia – Covid-19 Malasia . 25 de diciembre de 2020. Archivado desde el original el 2 de julio de 2021 . Consultado el 15 de enero de 2021 .
  289. ^ abc "La mutación COVID-19 A701V se propaga a los grupos de la tercera ola". focusmalaysia.my . 25 de diciembre de 2020. Archivado desde el original el 14 de mayo de 2021 . Consultado el 13 de mayo de 2021 .
  290. ^ "Variantes preocupantes (VOC), B.1.524, B.1.525, B.1.351 sudafricana, CEPA D614G, A701V, B1.1.7". covid-19.moh.gov.my . 14 de abril de 2021. Archivado desde el original el 2 de julio de 2021 . Consultado el 15 de mayo de 2021 .
  291. ^ ab "Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 y variantes bajo investigación en Inglaterra: informe técnico 39" (PDF) . gov.uk.​ Agencia de Seguridad Sanitaria del Reino Unido. 25 de marzo de 2022. Archivado (PDF) desde el original el 4 de abril de 2022 . Consultado el 6 de abril de 2022 .
  292. ^ "Actualización epidemiológica semanal de COVID-19: edición 84, publicada el 22 de marzo de 2022" (PDF) . quién.int . Organización Mundial de la Salud. 2 de marzo de 2022 . Consultado el 6 de abril de 2022 .
  293. ^ "Cov-Linajes". cov-lineages.org . Consultado el 6 de abril de 2022 .
  294. ^ Burioni R, Topol EJ (junio de 2021). "¿Ha alcanzado el SARS-CoV-2 su estado físico máximo?". Medicina de la Naturaleza . 27 (8): 1323–24. doi : 10.1038/s41591-021-01421-7 . PMID  34155413.
  295. ^ ab Oficina del Comisionado (23 de febrero de 2021). "Actualización sobre el coronavirus (COVID-19): la FDA emite políticas para guiar a los desarrolladores de productos médicos a abordar las variantes del virus". Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. (FDA) . Consultado el 7 de marzo de 2021 .
  296. ^ Rella SA, Kulikova YA, Dermitzakis ET, Kondrashov FA (30 de julio de 2021). "Las tasas de transmisión y vacunación del SARS-CoV-2 afectan el destino de las cepas resistentes a las vacunas". Informes científicos . 11 (1): 15729. doi : 10.1038/s41598-021-95025-3. ISSN  2045-2322. PMC 8324827 . PMID  34330988. 
  297. ^ Wang R, Chen J, Wei GW (diciembre de 2021). "Mecanismos de evolución del SARS-CoV-2 que revelan mutaciones resistentes a las vacunas en Europa y América" ​​(PDF) . La Revista de Letras de Química Física . 12 (49): 11850–11857. doi : 10.1021/acs.jpclett.1c03380. PMC 8672435 . PMID  34873910. Archivado (PDF) desde el original el 18 de diciembre de 2021 . Consultado el 27 de enero de 2022 . 
  298. ^ "Los hallazgos del estudio sugieren que la propagación de Omicron puede atribuirse a la evasión inmune más que a un aumento de la transmisibilidad". Noticias-Medical.net . 5 de enero de 2022. Archivado desde el original el 21 de enero de 2022 . Consultado el 17 de enero de 2022 .
  299. ^ Cao Y, Wang J, Jian F, Xiao T, Song W, Yisimayi A, et al. (febrero de 2022). "Omicron escapa a la mayoría de los anticuerpos neutralizantes del SARS-CoV-2 existentes". Naturaleza . 602 (7898): 657–663. doi :10.1038/d41586-021-03796-6. PMC 8866119 . PMID  35016194. S2CID  245455422. 
  300. ^ Liu L, Iketani S, Guo Y, Chan JF, Wang M, Liu L, et al. (febrero de 2022). "Sorprendente evasión de anticuerpos manifestada por la variante Omicron del SARS-CoV-2". Naturaleza . 602 (7898): 676–681. doi : 10.1038/d41586-021-03826-3 . PMID  35016198. S2CID  245462866.
  301. ^ Mohsin M, Mahmud S (mayo de 2022). "Variante preocupante de Omicron SARS-CoV-2: una revisión sobre su transmisibilidad, evasión inmune, reinfección y gravedad". Medicamento . 101 (19): e29165. doi :10.1097/MD.0000000000029165. PMC 9276130 . PMID  35583528. S2CID  248858919. 
  302. ^ "¿Qué tan pronto después de contraer COVID-19 puede volver a contraerlo?". ABC Noticias . 2 de mayo de 2022. Archivado desde el original el 9 de julio de 2022 . Consultado el 24 de junio de 2022 .
  303. ^ "Variante Omicron: lo que necesita saber". Centros de Control y Prevención de Enfermedades . 20 de diciembre de 2021. Archivado desde el original el 27 de enero de 2022 . Consultado el 27 de enero de 2022 .
  304. ^ Shin DH, Smith DM, Choi JY (2022). "Variante preocupante de Omicron del SARS-CoV-2: todo lo que quería saber sobre Omicron pero tenía miedo de preguntar". Revista médica Yonsei . 63 (11): 977–983. doi :10.3349/ymj.2022.0383. PMC 9629902 . PMID  36303305. 
  305. ^ "Refuerzos de la vacuna COVID-19". Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. (FDA). 27 de septiembre de 2022. Archivado desde el original el 8 de octubre de 2022 . Consultado el 8 de octubre de 2022 .
  306. ^ "Vacunas modernas contra el COVID-19". Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU . 7 de octubre de 2022. Archivado desde el original el 7 de octubre de 2022 . Consultado el 8 de octubre de 2022 .
  307. ^ "Vacunas Pfizer-BioNTech COVID-19". Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU . 3 de octubre de 2022. Archivado desde el original el 8 de octubre de 2022 . Consultado el 8 de octubre de 2022 .
  308. ^ "Vacunas COVID-19 actualizadas para su uso en los Estados Unidos a partir del otoño de 2023". Administración de Alimentos y Medicamentos de EE. UU. (FDA) . 15 de junio de 2023 . Consultado el 16 de junio de 2023 . Dominio publicoEste artículo incorpora texto de esta fuente, que se encuentra en el dominio público .
  309. ^ Recomendación para la fórmula 2023-2024 de vacunas COVID-19 en EE. UU. (Reporte). FDA / CBER (VRBPAC). 16 de junio de 2023 . Consultado el 16 de junio de 2023 .
  310. ^ Yurkovetskiy L, Wang X, Pascal KE, Tomkins-Tinch C, Nyalile TP, Wang Y, et al. (octubre de 2020). "Análisis estructural y funcional de la variante de proteína de pico D614G SARS-CoV-2". Celúla . 183 (3): 739–751.e8. doi : 10.1016/j.cell.2020.09.032. PMC 7492024 . PMID  32991842. 
  311. ^ Thomson EC, Rosen LE, Shepherd JG, Spreafico R, da Silva Filipe A, Wojcechowskyj JA, et al. (Marzo de 2021). "Las variantes circulantes del pico N439K del SARS-CoV-2 mantienen la aptitud mientras evaden la inmunidad mediada por anticuerpos". Celúla . 184 (5): 1171–1187.e20. doi :10.1016/j.cell.2021.01.037. PMC 7843029 . PMID  33621484. 
  312. ^ Smout A (26 de enero de 2021). "Gran Bretaña ayudará a otros países a localizar variantes del coronavirus". Reuters . Archivado desde el original el 26 de enero de 2021 . Consultado el 27 de enero de 2021 .
  313. ^ Donnelly L (26 de enero de 2021). "Reino Unido ayudará a secuenciar mutaciones de Covid en todo el mundo para encontrar nuevas variantes peligrosas". El Telégrafo . Archivado desde el original el 27 de enero de 2021 . Consultado el 28 de enero de 2021 .
  314. ^ Galani A, Aalizadeh R, Kostakis M, Markou A, Alygizakis N, Lytras T, et al. (enero de 2022). "Los datos de vigilancia de aguas residuales del SARS-CoV-2 pueden predecir hospitalizaciones e ingresos en UCI". Ciencia del Medio Ambiente Total . 804 : 150151. Código bibliográfico : 2022ScTEn.804o0151G. doi :10.1016/j.scitotenv.2021.150151. PMC 8421077 . PMID  34623953. 
  315. ^ Baaijens JA, Zulli A, Ott IM, Petrone ME, Alpert T, Fauver JR y col. (2 de septiembre de 2021). "Estimación de la abundancia de variantes del SARS-CoV-2 en aguas residuales mediante cuantificación de RNA-Seq". medRxiv 10.1101/2021.08.31.21262938 . 
  316. ^ Heijnen L, Elsinga G, Graaf Md, Molenkamp R, Koopmans MP, Medema G (26 de marzo de 2021). "RT-PCR digital de gotas para detectar variantes preocupantes del SARS-CoV-2 en aguas residuales". medRxiv 10.1101/2021.03.25.21254324v1 . 
  317. ^ Métodos para la detección e identificación de variantes del SARS-CoV-2. Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades, Organización Mundial de la Salud (Informe técnico). Estocolmo: Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades. 3 de marzo de 2021. Ensayos de detección de diagnóstico de COV conocidos.
  318. ^ Variantes preocupantes del SARS-CoV-2 y variantes bajo investigación en Inglaterra, informe técnico 15 (PDF) (Reunión informativa). Salud pública de Inglaterra. 11 de junio de 2021. GOV-8576. Archivado (PDF) desde el original el 4 de julio de 2021 . Consultado el 15 de junio de 2021 .
  319. ^ Evaluación de la futura aparición y el impacto potencial de la variante preocupante Omicron del SARS-CoV-2 en el contexto de la transmisión en curso de la variante preocupante Delta en la UE/EEE, 18.ª actualización (informe técnico). Estocolmo: Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades. 15 de diciembre de 2021. Anexos 1 y 2.
  320. ^ Kupferschmidt K (23 de diciembre de 2020). "La variante del Reino Unido pone de relieve el papel de los pacientes inmunodeprimidos en la pandemia de COVID-19". Ciencia . doi : 10.1126/science.abg2911. S2CID  234378594. Archivado desde el original el 24 de junio de 2021 . Consultado el 25 de febrero de 2021 .
  321. ^ Sutherland S (23 de febrero de 2021). "Pueden surgir variantes de COVID en personas con sistemas inmunológicos comprometidos". Científico americano . Archivado desde el original el 6 de junio de 2021 . Consultado el 25 de febrero de 2021 .
  322. ^ McCarthy KR, Rennick LJ, Nambulli S, Robinson-McCarthy LR, Bain WG, Haidar G, et al. (Marzo de 2021). "Las eliminaciones recurrentes en la glicoproteína de pico del SARS-CoV-2 impulsan el escape de anticuerpos". Ciencia . 371 (6534): 1139-1142. Código Bib : 2021 Ciencia... 371.1139M. doi : 10.1126/ciencia.abf6950 . PMC 7971772 . PMID  33536258. 
  323. ^ Green ST, Cladi L (26 de enero de 2021). "Covid-19 y la presión evolutiva: ¿podemos predecir qué peligros genéticos acechan más allá del horizonte?". BMJ : n230. Archivado desde el original el 8 de junio de 2021 . Consultado el 8 de junio de 2021 .
  324. ^ Jacobs A (2 de noviembre de 2021). "Se encontró una infección generalizada por coronavirus en ciervos de Iowa, según un nuevo estudio". Los New York Times . Archivado desde el original el 28 de diciembre de 2021 . Consultado el 12 de diciembre de 2021 . Investigadores y expertos externos caracterizaron los hallazgos del estudio como un avance preocupante en el curso de la pandemia. La infección generalizada entre las especies de caza más ubicuas de América del Norte podría dificultar aún más la erradicación del patógeno, especialmente si se convierten en un reservorio de mutaciones que eventualmente se propagarán a los humanos. [...] están alertando a los cazadores de venados y a otras personas que manipulan venados a tomar precauciones para evitar la transmisión. [...] Si el virus se volviera endémico en animales salvajes como los ciervos, podría evolucionar con el tiempo para volverse más virulento y luego infectar a las personas con una nueva cepa capaz de evadir la cosecha actual de vacunas.
  325. ^ Lassaunière R, Fonager J, Rasmussen M, Frische A, Strandh C, Rasmussen T, et al. (10 de noviembre de 2020). Mutaciones de picos de SARS-CoV-2 que surgen en visones daneses, su propagación a humanos y datos de neutralización ( preimpresión ). Instituto Statens Serum . Archivado desde el original el 10 de noviembre de 2020 . Consultado el 11 de noviembre de 2020 .
  326. ↑ «Detección de nuevas variantes del SARS-CoV-2 relacionadas con el visón» (PDF) . ECDC.eu.​ Centro Europeo para la Prevención y el Control de Enfermedades. 12 de noviembre de 2020. Archivado (PDF) desde el original el 8 de enero de 2021 . Consultado el 12 de noviembre de 2020 .
  327. ^ "Cepa variante asociada al visón SARS-CoV-2 - Dinamarca". Noticias de la OMS sobre brotes de enfermedades . 6 de noviembre de 2020. Archivado desde el original el 12 de noviembre de 2020 . Consultado el 19 de marzo de 2021 .
  328. ^ Kevany S, Carstensen T (19 de noviembre de 2020). "La variante danesa del visón Covid 'muy probablemente extinta', pero el controvertido sacrificio continúa". El guardián . Archivado desde el original el 24 de abril de 2021 . Consultado el 19 de abril de 2021 .
  329. ^ Larsen HD, Fonager J, Lomholt FK, Dalby T, Benedetti G, Kristensen B, et al. (febrero de 2021). "Informe preliminar de un brote de SARS-CoV-2 en visones y criadores de visones asociado con la propagación comunitaria, Dinamarca, de junio a noviembre de 2020". Vigilancia del euro . 26 (5). doi :10.2807/1560-7917.ES.2021.26.5.210009. PMC 7863232 . PMID  33541485. 

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enlaces externos

Scholia tiene un perfil para la variante del SARS-CoV-2 (Q104450895).
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