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Variación genética humana

Una representación gráfica del cariotipo humano típico.
El ADN mitocondrial humano

La variación genética humana son las diferencias genéticas dentro y entre poblaciones . Puede haber múltiples variantes de cualquier gen determinado en la población humana ( alelos ), situación llamada polimorfismo .

No hay dos humanos genéticamente idénticos. Incluso los gemelos monocigóticos (que se desarrollan a partir de un cigoto) tienen diferencias genéticas poco frecuentes debido a mutaciones que ocurren durante el desarrollo y a la variación del número de copias de genes . [1] Las diferencias entre individuos, incluso entre individuos estrechamente relacionados, son la clave para técnicas como la toma de huellas genéticas .

El genoma humano tiene una longitud total de aproximadamente 3200 millones de pares de bases (pb) en 46 cromosomas de ADN, así como algo menos de 17 000 pb de ADN en las mitocondrias celulares . En 2015, la diferencia típica entre el genoma de un individuo y el genoma de referencia se estimó en 20 millones de pares de bases (o el 0,6% del total). [2] En 2017, había un total de 324 millones de variantes conocidas de genomas humanos secuenciados . [3]

Comparativamente hablando, los humanos somos una especie genéticamente homogénea. Aunque una pequeña cantidad de variantes genéticas se encuentran con mayor frecuencia en ciertas regiones geográficas o en personas con ascendencia de esas regiones, esta variación representa una pequeña porción (~15%) de la variabilidad del genoma humano. La mayor parte de la variación existe dentro de los miembros de cada población humana. A modo de comparación, los macacos rhesus exhiben una diversidad de secuencias de ADN 2,5 veces mayor en comparación con los humanos. [4] Estas tasas difieren según las macromoléculas que se estén analizando. Los chimpancés tienen más variación genética que los humanos cuando examinan el ADN nuclear, pero los humanos tienen más variación genética cuando examinan a nivel de proteínas. [5]

La falta de discontinuidades en las distancias genéticas entre las poblaciones humanas, la ausencia de ramas discretas en la especie humana y la sorprendente homogeneidad de los seres humanos a nivel mundial implican que no existe una base científica para inferir razas o subespecies en los humanos, y para la mayoría de los rasgos , sí la hay. mucha más variación dentro de las poblaciones que entre ellas. [6] [7] [8] [9] [10] [11] [12] [13] A pesar de esto, los estudios genéticos modernos han encontrado diferencias genéticas promedio sustanciales entre las poblaciones humanas en rasgos como el color de la piel, las dimensiones corporales y la lactosa. y digestión del almidón, adaptaciones a la gran altitud, respuesta a los medicamentos, receptores del gusto y predisposición a desarrollar enfermedades particulares. [14] [12] La mayor diversidad se encuentra dentro y entre las poblaciones de África , [15] y disminuye gradualmente a medida que aumenta la distancia del continente africano, en consonancia con la teoría de los orígenes humanos de Fuera de África . [15]

El estudio de la variación genética humana tiene importancia evolutiva y aplicaciones médicas. Puede ayudar a los científicos a reconstruir y comprender patrones de migraciones humanas pasadas. En medicina, el estudio de la variación genética humana puede ser importante porque algunos alelos que causan enfermedades ocurren con mayor frecuencia en ciertos grupos de población. Por ejemplo, la mutación de la anemia falciforme se encuentra con mayor frecuencia en personas con ascendencia de ciertas poblaciones del África subsahariana, del sur de Europa, de Arabia y de la India, debido a la presión evolutiva de los mosquitos portadores de la malaria en estas regiones.

Los nuevos hallazgos muestran que cada ser humano tiene en promedio 60 nuevas mutaciones en comparación con sus padres. [16] [17]

Causas de variación

Las causas de las diferencias entre individuos incluyen el surtido independiente , el intercambio de genes (entrecruzamiento y recombinación) durante la reproducción (a través de la meiosis ) y diversos eventos mutacionales .

Hay al menos tres razones por las que existe variación genética entre poblaciones. La selección natural puede conferir una ventaja adaptativa a los individuos en un entorno específico si un alelo proporciona una ventaja competitiva. Es probable que los alelos seleccionados aparezcan sólo en aquellas regiones geográficas donde confieren una ventaja. Un segundo proceso importante es la deriva genética , que es el efecto de cambios aleatorios en el acervo genético, en condiciones en las que la mayoría de las mutaciones son neutrales (es decir, no parecen tener ningún efecto selectivo positivo o negativo en el organismo). Finalmente, las pequeñas poblaciones de inmigrantes tienen diferencias estadísticas (llamado efecto fundador ) con respecto a las poblaciones generales de donde se originaron; Cuando estos migrantes se asientan en nuevas áreas, su población descendiente generalmente difiere de su población de origen: predominan genes diferentes y es menos diversa genéticamente.

En los humanos, la causa principal es la deriva genética . [18] Los efectos fundadores en serie y el pequeño tamaño de la población en el pasado (aumentando la probabilidad de deriva genética) pueden haber tenido una influencia importante en las diferencias neutrales entre poblaciones. [ cita necesaria ] La segunda causa principal de variación genética se debe al alto grado de neutralidad de la mayoría de las mutaciones . Un número pequeño, pero significativo, de genes parece haber sido objeto de selección natural reciente, y estas presiones selectivas a veces son específicas de una región. [19] [20]

Medidas de variación

La variación genética entre humanos ocurre en muchas escalas, desde grandes alteraciones en el cariotipo humano hasta cambios de un solo nucleótido . [21] Las anomalías cromosómicas se detectan en 1 de cada 160 nacimientos humanos vivos. Aparte de los trastornos de los cromosomas sexuales , la mayoría de los casos de aneuploidía provocan la muerte del feto en desarrollo ( aborto espontáneo ); Los cromosomas extra autosómicos más comunes entre los nacidos vivos son el 21 , el 18 y el 13 . [22]

La diversidad de nucleótidos es la proporción promedio de nucleótidos que difieren entre dos individuos. En 2004, se estimaba que la diversidad de nucleótidos humanos era del 0,1% [23] al 0,4% de los pares de bases . [24] En 2015, el Proyecto 1000 Genomas , que secuenció mil individuos de 26 poblaciones humanas, encontró que "un genoma [individual] típico difiere del genoma humano de referencia en 4,1 millones a 5,0 millones de sitios... afectando 20 millones de bases de secuencia "; esta última cifra corresponde al 0,6% del número total de pares de bases. [2] Casi todos (>99,9%) de estos sitios son pequeñas diferencias, ya sea polimorfismos de un solo nucleótido o breves inserciones o eliminaciones ( indeles ) en la secuencia genética, pero las variaciones estructurales representan un mayor número de pares de bases que los SNP y indeles. [2] [25]

En 2017 , la base de datos de polimorfismo de nucleótido único ( dbSNP ), que enumera SNP y otras variantes, enumeró 324 millones de variantes encontradas en genomas humanos secuenciados. [3]

Polimorfismos de un sólo nucleótido

La molécula de ADN 1 se diferencia de la molécula de ADN 2 en una ubicación de un solo par de bases (un polimorfismo C/T).

Un polimorfismo de un solo nucleótido (SNP) es una diferencia en un solo nucleótido entre miembros de una especie que ocurre en al menos el 1% de la población. Los 2.504 individuos caracterizados por el Proyecto 1000 Genomas tenían 84,7 millones de SNP entre ellos. [2] Los SNP son el tipo más común de variación de secuencia y se estimó en 1998 que representaban el 90% de todas las variantes de secuencia. [26] Otras variaciones de secuencia son los intercambios, eliminaciones e inserciones de una sola base. [27] Los SNP se producen en promedio cada 100 a 300 bases [28] y, por lo tanto, son la principal fuente de heterogeneidad.

Un SNP funcional, o no sinónimo, es aquel que afecta algún factor como el empalme de genes o el ARN mensajero y, por lo tanto, provoca una diferencia fenotípica entre miembros de la especie. Alrededor del 3% al 5% de los SNP humanos son funcionales (ver Proyecto Internacional HapMap ). Los SNP neutros o sinónimos siguen siendo útiles como marcadores genéticos en estudios de asociación de todo el genoma , debido a su gran número y a su herencia estable a lo largo de generaciones. [26]

Un SNP codificante es aquel que se produce dentro de un gen. Hay 105 SNP de referencia humana que dan como resultado codones de parada prematuros en 103 genes. Esto corresponde al 0,5% de los SNP codificantes. Ocurren debido a la duplicación segmentaria en el genoma. Estos SNP dan como resultado la pérdida de proteínas, pero todos estos alelos de SNP son comunes y no se purifican en la selección negativa . [29]

Variación estructural

La variación estructural es la variación en la estructura del cromosoma de un organismo . Las variaciones estructurales, como la variación del número de copias y las eliminaciones , inversiones , inserciones y duplicaciones , representan mucha más variación genética humana que la diversidad de un solo nucleótido. Esto se concluyó en 2007 a partir del análisis de las secuencias diploides completas de los genomas de dos humanos: Craig Venter y James D. Watson . Esto se sumó a las dos secuencias haploides que eran fusiones de secuencias de muchos individuos, publicadas por el Proyecto Genoma Humano y Celera Genomics respectivamente. [30]

Según el Proyecto 1000 Genomas, un ser humano típico tiene entre 2100 y 2500 variaciones estructurales, que incluyen aproximadamente 1000 deleciones grandes, 160 variantes de número de copias, 915 inserciones de Alu , 128 inserciones de L1 , 51 inserciones de SVA, 4 NUMT y 10 inversiones. [2]

Variación del número de copias

Una variación del número de copias (CNV) es una diferencia en el genoma debido a la eliminación o duplicación de grandes regiones de ADN en algún cromosoma. Se estima que el 0,4% de los genomas de humanos no emparentados difieren con respecto al número de copias. Cuando se incluye la variación del número de copias, se estima que la variación genética entre humanos es al menos del 0,5% (99,5% de similitud). [31] [32] [33] [34] Las variaciones en el número de copias se heredan, pero también pueden surgir durante el desarrollo. [35] [36] [37] [38]

Pratas et al. han construido un mapa visual con las regiones con alta variación genómica del conjunto de referencia humano moderno en relación con un neandertal de 50k [39] . [40]

Epigenética

La variación epigenética es una variación en las etiquetas químicas que se adhieren al ADN y afectan la forma en que se leen los genes. Las etiquetas, "llamadas marcas epigenéticas, actúan como interruptores que controlan cómo se pueden leer los genes". [41] En algunos alelos, el estado epigenético del ADN y el fenotipo asociado se pueden heredar a través de generaciones de individuos . [42]

Variabilidad genética

La variabilidad genética es una medida de la tendencia de los genotipos individuales de una población a variar (diferirse) entre sí. La variabilidad es diferente de la diversidad genética , que es la cantidad de variación que se observa en una población en particular. La variabilidad de un rasgo es cuánto tiende a variar ese rasgo en respuesta a influencias ambientales y genéticas .

Clines

En biología , una clina es un continuo de especies , poblaciones, variedades o formas de organismos que exhiben diferencias fenotípicas y/o genéticas graduales en un área geográfica, generalmente como resultado de la heterogeneidad ambiental. [43] [44] [45] En el estudio científico de la variación genética humana, una clina genética puede definirse rigurosamente y someterse a métricas cuantitativas.

Haplogrupos

En el estudio de la evolución molecular , un haplogrupo es un grupo de haplotipos similares que comparten un ancestro común con una mutación de polimorfismo de un solo nucleótido (SNP). El estudio de los haplogrupos proporciona información sobre orígenes ancestrales que se remontan a miles de años. [46]

Los haplogrupos humanos más comúnmente estudiados son los haplogrupos del cromosoma Y (ADN-Y) y los haplogrupos de ADN mitocondrial (ADNmt) , los cuales pueden usarse para definir poblaciones genéticas. El ADN-Y se transmite únicamente a lo largo de la línea patrilineal , de padre a hijo, mientras que el ADNmt se transmite por línea matrilineal , de madre a hija o hijo. El ADN-Y y el ADNmt pueden cambiar por mutación aleatoria en cada generación.

Repeticiones en tándem de número variable

Una repetición en tándem de número variable (VNTR) es la variación de longitud de una repetición en tándem . Una repetición en tándem es la repetición adyacente de una secuencia de nucleótidos corta . Existen repeticiones en tándem en muchos cromosomas y su longitud varía entre individuos. Cada variante actúa como un alelo heredado , por lo que se utilizan para la identificación personal o parental. Su análisis es útil en investigaciones genéticas y biológicas, ciencias forenses y huellas dactilares de ADN .

Las repeticiones en tándem cortas (de unos 5 pares de bases) se denominan microsatélites , mientras que las más largas se denominan minisatélites .

Historia y distribución geográfica.

Mapa de la migración de los humanos modernos fuera de África, basado en el ADN mitocondrial . Los anillos de colores indican mil años antes del presente.
Mapa de distancia genética de Magalhães et al. (2012)

Origen africano reciente de los humanos modernos

El reciente paradigma del origen africano de los humanos modernos supone la dispersión de poblaciones no africanas de humanos anatómicamente modernos hace 70.000 años. La dispersión dentro de África ocurrió mucho antes, hace al menos 130.000 años. La teoría "fuera de África" ​​se origina en el siglo XIX, como una sugerencia tentativa en El origen del hombre de Charles Darwin , [47] pero siguió siendo especulativa hasta la década de 1980, cuando fue respaldada por el estudio del ADN mitocondrial actual, combinado con evidencia desde la antropología física de ejemplares arcaicos .

Según un estudio de 2000 sobre la variación de la secuencia del cromosoma Y, [48] los cromosomas Y humanos tienen ascendencia en África, y los descendientes del linaje derivado abandonaron África y finalmente fueron reemplazados por cromosomas Y humanos arcaicos en Eurasia. El estudio también muestra que una minoría de las poblaciones contemporáneas en África Oriental y los Khoisan son descendientes de los patrilinajes más ancestrales de humanos anatómicamente modernos que abandonaron África hace entre 35.000 y 89.000 años. [48] ​​Otra evidencia que respalda la teoría es que las variaciones en las medidas del cráneo disminuyen con la distancia desde África al mismo ritmo que la disminución de la diversidad genética. La diversidad genética humana disminuye en las poblaciones nativas con la distancia migratoria desde África, y se cree que esto se debe a los cuellos de botella durante la migración humana, que son eventos que reducen temporalmente el tamaño de la población. [49] [50]

Un estudio de agrupamiento genético de 2009, que genotipó 1327 marcadores polimórficos en varias poblaciones africanas, identificó seis grupos ancestrales. La agrupación se correspondía estrechamente con el origen étnico, la cultura y el idioma. [51] Un estudio de secuenciación del genoma completo de 2018 de las poblaciones mundiales observó grupos similares entre las poblaciones de África. En K=9, distintos componentes ancestrales definieron las poblaciones de habla afroasiática que habitaban el norte de África y el noreste de África ; las poblaciones de habla nilo-sahariana en el noreste de África y en el este de África ; las poblaciones Ari en el noreste de África; las poblaciones de habla Níger-Congo en África central occidental, África occidental , África oriental y África meridional ; las poblaciones pigmeas de África Central ; y las poblaciones khoisan en el sur de África. [52]

En mayo de 2023, los científicos informaron, basándose en estudios genéticos, de una vía de evolución humana más complicada de lo que se creía anteriormente. Según los estudios, los humanos evolucionaron en diferentes lugares y épocas de África, en lugar de un único lugar y período de tiempo. [53] [54]

Genética de poblaciones

Debido a la ascendencia común de todos los humanos, sólo un pequeño número de variantes tienen grandes diferencias en frecuencia entre poblaciones. Sin embargo, algunas variantes raras en la población humana mundial son mucho más frecuentes en al menos una población (más del 5%). [55]

Variación genética
Variación genética de las poblaciones euroasiáticas que muestra una frecuencia diferente de componentes de Eurasia occidental y oriental. [56]

Se supone comúnmente que los primeros humanos abandonaron África y, por lo tanto, debieron haber pasado por un cuello de botella poblacional antes de su divergencia entre África y Eurasia hace unos 100.000 años (aproximadamente 3.000 generaciones). La rápida expansión de una población que antes era pequeña tiene dos efectos importantes en la distribución de la variación genética. Primero, el llamado efecto fundador ocurre cuando las poblaciones fundadoras traen sólo un subconjunto de la variación genética de su población ancestral. En segundo lugar, a medida que los fundadores se separan geográficamente, la probabilidad de que dos individuos de diferentes poblaciones de fundadores se apareen se vuelve menor. El efecto de este apareamiento selectivo es reducir el flujo de genes entre grupos geográficos y aumentar la distancia genética entre grupos. [ cita necesaria ]

La expansión de los humanos desde África afectó la distribución de la variación genética de otras dos maneras. En primer lugar, las poblaciones más pequeñas (fundadoras) experimentan una mayor deriva genética debido al aumento de las fluctuaciones en los polimorfismos neutros. En segundo lugar, los nuevos polimorfismos que surgieron en un grupo tenían menos probabilidades de transmitirse a otros grupos ya que el flujo de genes estaba restringido. [ cita necesaria ]

Las poblaciones de África tienden a tener menores desequilibrios de vinculación que las poblaciones fuera de África, en parte debido al mayor tamaño de las poblaciones humanas en África a lo largo de la historia de la humanidad y en parte porque el número de humanos modernos que abandonaron África para colonizar el resto del mundo. el mundo parece haber sido relativamente bajo. [57] Por el contrario, las poblaciones que han experimentado reducciones de tamaño dramáticas o expansiones rápidas en el pasado y las poblaciones formadas por la mezcla de grupos ancestrales previamente separados pueden tener niveles inusualmente altos de desequilibrio de vinculación [57]

Distribución de variación

Variación genética humana calculada a partir de datos genéticos que representan 346 loci de microsatélites tomados de 1484 individuos en 78 poblaciones humanas. El gráfico superior ilustra que a medida que las poblaciones se alejan del este de África, su diversidad genética disminuye, medida en el número promedio de repeticiones de microsatélites en cada uno de los loci. El gráfico inferior ilustra el aislamiento por distancia . Las poblaciones con una mayor distancia entre ellas son más diferentes (medido por el estadístico Fst) que aquellas que están geográficamente cercanas entre sí. El eje horizontal de ambos gráficos es la distancia geográfica medida a lo largo de posibles rutas de migración humana. (Gráfico de Kanitz et al. 2018)

La distribución de variantes genéticas dentro y entre las poblaciones humanas es imposible de describir de manera sucinta debido a la dificultad de definir una "población", la naturaleza clinal de la variación y la heterogeneidad en todo el genoma (Long y Kittles 2003). Sin embargo, en general, existe un promedio del 85% de la variación genética dentro de las poblaciones locales, ~7% entre poblaciones locales dentro del mismo continente y ~8% de la variación ocurre entre grandes grupos que viven en diferentes continentes. [58] [59] La reciente teoría del origen africano de los humanos predeciría que en África existe mucha más diversidad que en otros lugares y que la diversidad debería disminuir cuanto más lejos de África se muestrea una población.

Variación fenotípica

El África subsahariana tiene la mayor diversidad genética humana y se ha demostrado que lo mismo ocurre con la variación fenotípica en la forma del cráneo. [49] [60] El fenotipo está conectado al genotipo a través de la expresión genética . La diversidad genética disminuye suavemente con la distancia migratoria desde esa región, que muchos científicos creen que es el origen de los humanos modernos, y esa disminución se refleja en una disminución en la variación fenotípica. Las medidas del cráneo son un ejemplo de un atributo físico cuya variación dentro de la población disminuye con la distancia desde África.

La distribución de muchos rasgos físicos se asemeja a la distribución de la variación genética dentro y entre poblaciones humanas ( Asociación Estadounidense de Antropólogos Físicos 1996; Keita y Kittles 1997). Por ejemplo, ~90% de la variación en las formas de la cabeza humana ocurre dentro de grupos continentales, y ~10% separa grupos, con una mayor variabilidad en la forma de la cabeza entre individuos con ancestros africanos recientes (Relethford 2002).

Una excepción destacada a la distribución común de características físicas dentro y entre grupos es el color de la piel . Aproximadamente el 10% de la variación en el color de la piel ocurre dentro de los grupos y ~90% ocurre entre grupos (Relethford 2002). Esta distribución del color de la piel y su patrón geográfico (las personas cuyos ancestros vivieron predominantemente cerca del ecuador tenían la piel más oscura que aquellas con ancestros que vivieron predominantemente en latitudes más altas) indican que este atributo ha estado bajo una fuerte presión selectiva . La piel más oscura parece ser una opción muy elegida en las regiones ecuatoriales para prevenir las quemaduras solares, el cáncer de piel, la fotólisis del folato y el daño a las glándulas sudoríparas. [61]

Comprender cómo la diversidad genética en la población humana afecta los distintos niveles de expresión genética es un área activa de investigación. Si bien estudios anteriores se centraron en la relación entre la variación del ADN y la expresión del ARN, esfuerzos más recientes están caracterizando el control genético de diversos aspectos de la expresión génica, incluidos los estados de la cromatina, [ 62] la traducción, [63] y los niveles de proteína. [64] Un estudio publicado en 2007 encontró que el 25% de los genes mostraban diferentes niveles de expresión genética entre poblaciones de ascendencia europea y asiática. [65] [66] [67] [68] [69] Se pensaba que la causa principal de esta diferencia en la expresión genética eran los SNP en las regiones reguladoras de genes del ADN. Otro estudio publicado en 2007 encontró que aproximadamente el 83% de los genes se expresaban en diferentes niveles entre individuos y alrededor del 17% entre poblaciones de ascendencia europea y africana. [70] [71]

Índice de fijación de Wright como medida de variación.

El genetista de poblaciones Sewall Wright desarrolló el índice de fijación (a menudo abreviado como F ST ) como una forma de medir las diferencias genéticas entre poblaciones. Esta estadística se utiliza a menudo en taxonomía para comparar diferencias entre dos poblaciones determinadas midiendo las diferencias genéticas entre poblaciones para genes individuales o para muchos genes simultáneamente. [72] A menudo se afirma que el índice de fijación para los seres humanos es de aproximadamente 0,15. Esto se traduce en que aproximadamente el 85% de la variación medida en la población humana general se encuentra dentro de individuos de la misma población, y alrededor del 15% de la variación ocurre entre poblaciones. Estas estimaciones implican que dos individuos cualesquiera de poblaciones diferentes pueden ser más similares entre sí que cualquiera de ellos con un miembro de su propio grupo. [73] [74] "La historia evolutiva compartida de los humanos vivos ha resultado en una alta relación entre todas las personas vivas, como lo indica, por ejemplo, el índice de fijación muy bajo (F ST ) entre las poblaciones humanas vivas". Richard Lewontin , quien afirmó estas proporciones, concluyó que ni "raza" ni "subespecie" eran formas apropiadas o útiles para describir las poblaciones humanas. [58]

El propio Wright creía que los valores >0,25 representaban una variación genética muy grande y que un F ST de 0,15 a 0,25 representaba una gran variación. Sin embargo, alrededor del 5% de la variación humana se produce entre poblaciones dentro de continentes, por lo que en algunos estudios se han encontrado valores de F ST entre grupos continentales de humanos (o razas) de tan solo 0,1 (o posiblemente inferiores), lo que sugiere niveles más moderados de variación genética. variación. [72] Graves (1996) ha respondido que F ST no debería usarse como marcador del estado de la subespecie, ya que la estadística se usa para medir el grado de diferenciación entre poblaciones, [72] aunque ver también Wright (1978). [75]

Jeffrey Long y Rick Kittles ofrecen una larga crítica de la aplicación de F ST a poblaciones humanas en su artículo de 2003 "Human Genetic Diversity and the Noexistence of Biological Races". Encuentran que la cifra del 85% es engañosa porque implica que todas las poblaciones humanas contienen en promedio el 85% de toda la diversidad genética. Argumentan que el modelo estadístico subyacente supone incorrectamente historias de variación iguales e independientes para cada gran población humana. Un enfoque más realista es comprender que algunos grupos humanos son parentales de otros grupos y que estos grupos representan grupos parafiléticos para sus grupos de descendencia. Por ejemplo, según la reciente teoría del origen africano, la población humana en África es parafilética con respecto a todos los demás grupos humanos porque representa el grupo ancestral del que derivan todas las poblaciones no africanas, pero más que eso, los grupos no africanos sólo derivan de una pequeña Muestra no representativa de esta población africana. Esto significa que todos los grupos no africanos están más estrechamente relacionados entre sí y con algunos grupos africanos (probablemente africanos orientales) que con otros, y además, que la migración fuera de África representó un cuello de botella genético , ya que gran parte de la diversidad que existían en África y no eran sacados de África por los grupos emigrantes. En este escenario, las poblaciones humanas no tienen cantidades iguales de variabilidad local, sino más bien cantidades menores de diversidad cuanto más lejos de África vive una población. Long y Kittles encuentran que en lugar de que el 85% de la diversidad genética humana exista en todas las poblaciones humanas, alrededor del 100% de la diversidad humana existe en una sola población africana, mientras que sólo alrededor del 70% de la diversidad genética humana existe en una población derivada de Nueva Guinea. Long y Kittles argumentaron que esto todavía produce una población humana global que es genéticamente homogénea en comparación con otras poblaciones de mamíferos. [76]

Mezcla arcaica

Los humanos anatómicamente modernos se cruzaron con los neandertales durante el Paleolítico Medio . En mayo de 2010, el Proyecto Genoma Neandertal presentó evidencia genética de que se produjo un mestizaje y de que una porción pequeña pero significativa, alrededor del 2 al 4%, de la mezcla neandertal está presente en el ADN de los euroasiáticos y oceánicos modernos, y casi ausente en los subsaharianos. Poblaciones africanas. [77] [78]

Entre el 4% y el 6% del genoma de los melanesios (representados por los habitantes de Papúa Nueva Guinea y los isleños de Bougainville) parece derivar de los denisovanos , un homínido hasta ahora desconocido que está más estrechamente relacionado con los neandertales que con los sapiens. Posiblemente se introdujo durante la migración temprana de los antepasados ​​de los melanesios al sudeste asiático. Esta historia de interacción sugiere que los denisovanos alguna vez se extendieron ampliamente por el este de Asia. [79]

Por lo tanto, los melanesios emergen como una de las poblaciones mezcladas más arcaicas, con una mezcla relacionada con los denisovanos y los neandertales de aproximadamente el 8%. [79]

En un estudio publicado en 2013, Jeffrey Wall de la Universidad de California estudió datos de secuencia completa del genoma y encontró tasas más altas de introgresión en los asiáticos en comparación con los europeos. [80] Martillo y col. Probó la hipótesis de que los genomas africanos contemporáneos tienen firmas de flujo genético con ancestros humanos arcaicos y encontró evidencia de mezcla arcaica en los genomas de algunos grupos africanos, lo que sugiere que cantidades modestas de flujo genético se extendieron a lo largo del tiempo y el espacio durante la evolución de los humanos anatómicamente modernos. . [81]

Un estudio publicado en 2020 encontró que las poblaciones yoruba y mende de África occidental derivan entre el 2% y el 19% de su genoma de una población de homínidos arcaicos aún no identificada que probablemente divergió antes de la división de los humanos modernos y los antepasados ​​de los neandertales y los denisovanos. , [82] potencialmente convirtiendo a estos grupos en las poblaciones humanas mezcladas más arcaicas identificadas hasta el momento.

Categorización de la población mundial.

Gráfico que muestra la agrupación genética humana [83]
La mayoría de los individuos tienen variantes genéticas que se encuentran en múltiples regiones del mundo. Basado en datos de "Una genealogía unificada de genomas antiguos y modernos". [84]

Nuevos datos sobre la variación genética humana han reavivado el debate sobre una posible base biológica para la categorización de los humanos en razas. La mayor parte de la controversia gira en torno a la cuestión de cómo interpretar los datos genéticos y si las conclusiones basadas en ellos son sólidas. Algunos investigadores sostienen que la raza autoidentificada puede usarse como indicador de ascendencia geográfica para ciertos riesgos de salud y medicamentos .

Aunque las diferencias genéticas entre grupos humanos son relativamente pequeñas, estas diferencias en ciertos genes como duffy , ABCC11 , SLC24A5 , llamados marcadores informativos de ascendencia (AIM), pueden usarse para situar de manera confiable a muchos individuos dentro de grupos amplios y de base geográfica. Por ejemplo, los análisis por computadora de cientos de loci polimórficos muestreados en poblaciones distribuidas globalmente han revelado la existencia de agrupaciones genéticas que se asocian aproximadamente con grupos que históricamente han ocupado grandes regiones continentales y subcontinentales (Rosenberg et al. 2002; Bamshad et al. 2003) . .

Algunos comentaristas han argumentado que estos patrones de variación proporcionan una justificación biológica para el uso de categorías raciales tradicionales. Sostienen que las agrupaciones continentales se corresponden aproximadamente con la división de los seres humanos en africanos subsaharianos ; europeos , asiáticos occidentales , asiáticos centrales , asiáticos del sur y africanos del norte ; asiáticos orientales , asiáticos del sudeste , polinesios y nativos americanos ; y otros habitantes de Oceanía (melanesios, micronesios y aborígenes australianos) (Risch et al. 2002). Otros observadores no están de acuerdo y dicen que los mismos datos socavan las nociones tradicionales de grupos raciales (King y Motulsky 2002; Calafell 2003; Tishkoff y Kidd 2004 [24] ). Señalan, por ejemplo, que las poblaciones principales consideradas razas o subgrupos dentro de las razas no necesariamente forman sus propios grupos.

Las categorías raciales también se ven socavadas por los hallazgos de que las variantes genéticas que se limitan a una región tienden a ser raras dentro de esa región, las variantes que son comunes dentro de una región tienden a ser compartidas en todo el mundo y la mayoría de las diferencias entre individuos, ya sea que provengan del mismo misma región o diferentes regiones, se deben a variantes globales. [85] No se han encontrado variantes genéticas que estén fijadas dentro de un continente o región importante y no se encuentren en ningún otro lugar. [86]

Además, debido a que la variación genética humana es clinal, muchos individuos se afilian a dos o más grupos continentales. Por lo tanto, la "ascendencia biogeográfica" de base genética asignada a cualquier persona determinada generalmente estará ampliamente distribuida y estará acompañada de incertidumbres considerables (Pfaff et al. 2004).

En muchas partes del mundo, los grupos se han mezclado de tal manera que muchos individuos tienen ancestros relativamente recientes de regiones muy separadas. Aunque los análisis genéticos de un gran número de loci pueden producir estimaciones del porcentaje de ancestros de una persona provenientes de diversas poblaciones continentales (Shriver et al. 2003; Bamshad et al. 2004), estas estimaciones pueden suponer una distintividad falsa de las poblaciones parentales, ya que Los grupos humanos han intercambiado parejas desde escalas locales hasta continentales a lo largo de la historia (Cavalli-Sforza et al. 1994; Hoerder 2002). Incluso con una gran cantidad de marcadores, la información para estimar las proporciones de mezcla de individuos o grupos es limitada, y las estimaciones normalmente tendrán intervalos de confianza amplios (Pfaff et al. 2004).

Agrupación genética

Los datos genéticos se pueden utilizar para inferir la estructura de la población y asignar individuos a grupos que a menudo se corresponden con su ascendencia geográfica autoidentificada. Jorde y Wooding (2004) argumentaron que "el análisis de muchos loci ahora produce estimaciones razonablemente precisas de similitud genética entre individuos, en lugar de poblaciones. La agrupación de individuos se correlaciona con el origen geográfico o la ascendencia". [23] Sin embargo, la identificación por origen geográfico puede fallar rápidamente al considerar la ascendencia histórica compartida entre individuos en el tiempo. [87]

En 2009 se publicó un análisis de datos de SNP autosómicos del Proyecto Internacional HapMap (Fase II) y muestras del Panel de Diversidad del Genoma Humano del CEPH . El estudio de 53 poblaciones tomadas de los datos de HapMap y CEPH (1138 individuos no relacionados) sugirió que la selección natural puede dar forma El genoma humano es mucho más lento de lo que se pensaba anteriormente, y factores como la migración dentro y entre continentes influyen más fuertemente en la distribución de las variaciones genéticas. [88] Un estudio similar publicado en 2010 encontró pruebas sólidas de selección en todo el genoma debido a cambios en la ecorregión, la dieta y la subsistencia, particularmente en conexión con las ecorregiones polares, con la búsqueda de alimento y con una dieta rica en raíces y tubérculos. [89] En un estudio de 2016, el análisis de componentes principales de los datos de todo el genoma fue capaz de recuperar objetivos previamente conocidos para la selección positiva (sin una definición previa de poblaciones), así como una serie de nuevos genes candidatos. [90]

Antropología Forense

Los antropólogos forenses pueden evaluar la ascendencia de los restos esqueléticos analizando la morfología esquelética y utilizando marcadores genéticos y químicos, cuando sea posible. [91] Si bien estas evaluaciones nunca son seguras, la precisión de los análisis de morfología esquelética para determinar la verdadera ascendencia se ha estimado en un 90%. [92]

Gráfico ternario que muestra la mezcla promedio de cinco grupos étnicos norteamericanos. Los individuos que se identifican con cada grupo se pueden encontrar en muchos lugares del mapa, pero en promedio los grupos tienden a agruparse de manera diferente.

Flujo de genes y mezcla.

El flujo de genes entre dos poblaciones reduce la distancia genética promedio entre las poblaciones, solo las poblaciones humanas totalmente aisladas no experimentan flujo de genes y la mayoría de las poblaciones tienen un flujo de genes continuo con otras poblaciones vecinas que crean la distribución clinal observada para la mayoría de las variaciones genéticas. Cuando el flujo de genes tiene lugar entre poblaciones genéticas bien diferenciadas, el resultado se denomina "mezcla genética".

El mapeo de mezclas es una técnica utilizada para estudiar cómo las variantes genéticas causan diferencias en las tasas de enfermedad entre la población. [93] Las poblaciones mezcladas recientes que rastrean su ascendencia en múltiples continentes son muy adecuadas para identificar genes de rasgos y enfermedades que difieren en prevalencia entre las poblaciones parentales. Las poblaciones afroamericanas han sido el foco de numerosos estudios de mapeo genético y de mezclas de poblaciones, incluidos estudios de rasgos genéticos complejos como el recuento de glóbulos blancos, el índice de masa corporal, el cáncer de próstata y la enfermedad renal. [94]

Se llevó a cabo un análisis de la variación fenotípica y genética, incluido el color de la piel y el estatus socioeconómico, en la población de Cabo Verde, que tiene una historia bien documentada de contacto entre europeos y africanos. Los estudios mostraron que el patrón de mezcla en esta población ha estado sesgado por el sexo (que involucra principalmente apareamientos entre hombres europeos y mujeres africanas) y existe una interacción significativa entre el estatus socioeconómico y el color de la piel, independientemente de la ascendencia. [95] Otro estudio muestra un mayor riesgo de complicaciones de la enfermedad de injerto contra huésped después del trasplante debido a variantes genéticas en el antígeno leucocitario humano (HLA) y las proteínas no HLA. [96]

Salud

Las diferencias en las frecuencias alélicas contribuyen a las diferencias grupales en la incidencia de algunas enfermedades monogénicas y pueden contribuir a las diferencias en la incidencia de algunas enfermedades comunes. [97] Para las enfermedades monogénicas, la frecuencia de los alelos causantes generalmente se correlaciona mejor con la ascendencia, ya sea familiar (por ejemplo, síndrome de Ellis-Van Creveld entre los amish de Pensilvania ), étnica ( enfermedad de Tay-Sachs entre las poblaciones judías asquenazíes ) o geográfica. (hemoglobinopatías entre personas con antepasados ​​​​que vivían en regiones palúdicas). En la medida en que la ascendencia se corresponde con grupos o subgrupos raciales o étnicos, la incidencia de enfermedades monogénicas puede diferir entre grupos categorizados por raza o etnia, y los profesionales de la salud suelen tener en cuenta estos patrones al hacer diagnósticos. [98]

Incluso en el caso de enfermedades comunes que implican numerosas variantes genéticas y factores ambientales, los investigadores señalan evidencia que sugiere la participación de alelos distribuidos diferencialmente con efectos pequeños a moderados. Los ejemplos citados con frecuencia incluyen hipertensión (Douglas et al. 1996), diabetes (Gower et al. 2003), obesidad (Fernández et al. 2003) y cáncer de próstata (Platz et al. 2000). Sin embargo, en ninguno de estos casos se ha demostrado que la variación alélica en un gen de susceptibilidad represente una fracción significativa de la diferencia en la prevalencia de la enfermedad entre grupos, y el papel de los factores genéticos en la generación de estas diferencias sigue siendo incierto (Mountain y Risch 2004).

Por otro lado, algunas otras variaciones son beneficiosas para los humanos, ya que previenen ciertas enfermedades y aumentan las posibilidades de adaptarse al medio ambiente. Por ejemplo, mutación en el gen CCR5 que protege contra el SIDA . El gen CCR5 está ausente en la superficie de la célula debido a una mutación. Sin el gen CCR5 en la superficie, no hay nada a lo que los virus del VIH puedan agarrarse y unirse. Por lo tanto, la mutación en el gen CCR5 disminuye la posibilidad de que un individuo tenga riesgo de contraer SIDA. La mutación en CCR5 también es bastante común en ciertas áreas, con más del 14% de la población portadora de la mutación en Europa y alrededor del 6% al 10% en Asia y el norte de África . [99]

Apego al VIH

Aparte de las mutaciones, muchos genes que pueden haber ayudado a los humanos en la antigüedad plagan a los humanos hoy en día. Por ejemplo, se sospecha que los genes que permiten a los humanos procesar los alimentos de manera más eficiente son los que hacen que las personas sean susceptibles a la obesidad y la diabetes en la actualidad. [100]

Neil Risch, de la Universidad de Stanford, ha propuesto que la raza/grupo étnico autoidentificado podría ser un medio válido de categorización en los EE. UU. por consideraciones de política y salud pública. [101] [97] Un artículo de 2002 del grupo de Noah Rosenberg hace una afirmación similar: "La estructura de las poblaciones humanas es relevante en diversos contextos epidemiológicos. Como resultado de la variación en las frecuencias de los factores de riesgo genéticos y no genéticos, las tasas de "La enfermedad y los fenotipos como la respuesta adversa a los medicamentos varían entre las poblaciones. Además, la información sobre la población de origen de un paciente podría proporcionar a los profesionales de la salud información sobre el riesgo cuando se desconocen las causas directas de la enfermedad". [102] Sin embargo, en 2018, Noah Rosenberg publicó un estudio que argumenta en contra de las ideas genéticamente esencialistas sobre las disparidades de salud entre poblaciones y afirma que las variantes ambientales son una causa más probable [103]

Proyectos del genoma

Los proyectos del genoma humano son esfuerzos científicos que determinan o estudian la estructura del genoma humano . El Proyecto Genoma Humano fue un proyecto histórico sobre el genoma.

Ver también

Regional

Proyectos

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Otras lecturas

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