La empresa fue fundada en Milán por Ugo Zagato en 1919, con la intención de trasladar al sector automotriz las nociones de tecnología aeronáutica que había conocido durante la Primera Guerra Mundial cuando había trabajado para la Fabbrica Aeroplani Ing. O. Pomilio.

Las carrocerías de Zagato se destacaron inmediatamente por su diseño avanzado, ligereza y excelente aerodinámica.

En realidad, parecía ser una empresa conjunta realizada en previsión del acuerdo FCA-TATA, que no llegó a materializarse.

Un año más tarde comenzó la producción de una serie del Alfa Romeo TZ 3 Stradale.

[5]​ Así mismo, la empresa intervino en otro tipo de proyectos no ligados al mundo del automóvil, como un tren de cercanías eléctrico guiado automatizado para una ciudad en Abu Dabi.

En 2016 Aston Martin lanzó una familia de modelos Zagato (cupé, spider, speedster y shooting brake), ensamblados en Inglaterra y vendidos con éxito en una serie limitada de 99 piezas cada uno.