La serie se centra en una guerra interestelar entre la humanidad y una alianza teocrática de alienígenas conocidos como Covenant.
En el pasado distante, una raza de muy avanzada tecnología, conocida como los Forerunner, luchó contra una especie parásita llamada Flood.
Una de las especies afectadas fue la humana, quienes se vieron forzados a aventurarse al espacio y entrar en el conflicto.
Utilizando una instalación conocida como "el Arca", construyeron gigantescas estructuras en forma de anillo, los Halos.
Después de que las Instalaciones hayan sido activadas, los Forerunners sobrevivientes re-esparcieron la vida ya sea con embriones preservados o especímenes vivos por toda la galaxia.
Una vez que completaron esto, los Forerunner decidieron dejar la galaxia, el motivo por el cual hayan hecho esto es desconocido, tal vez haya sido para poblar con otras galaxias o escapar del alcance de los Halos.
Los Profetas utilizaban tecnología antigua para detectar las reliquias Forerunners, el error se dio gracias a que esta tecnología identificó a los humanos como reliquias, y sobre ellos aparecía el símbolo de "reclamador" siendo confundido con el de "reclamación", los Profetas al darse cuenta de que los humanos eran los elegidos [según ellos] para iniciar el Gran Viaje, mintieron al propio Covenant y los hizo creer que los humanos habían destruido sus reliquias sagradas, empezando así una guerra santa para exterminar a toda la raza humana.
El Covenant los persigue, logrando dañar a la nave y dirigiendo la batalla hacia la superficie del anillo.
El Covenant accidentalmente libera al Flood que se encontraba preso; para evitar cualquier riesgo, el guardián del anillo, 343 Guilty Spark (Chispa culpable), recurre al spartan John-117, Master Chief o Jefe Maestro en español (se le conoce así debido a su rango).
[9] Aún sin conocer la verdad acerca de los anillos, el Alto Profeta de la Verdad Covenant y los remanentes leales al Covenant siguen su camino hacia la Tierra, donde creen que está enterrada el Arca.
El grupo se desplaza hacia la sala de control del Halo para activarlo, y Chispa Culpable explica que ya que aún no está completo, su detonación prematura acarrearía la destrucción completa del Arca.
Cortana activa una señal de emergencia y el Jefe Maestro se somete al sueño criogénico.
Cuatro años después de la destrucción del Arca, el Jefe Maestro es despertado por Cortana para encontrarse con un ataque Covenant.
Fue encarcelado por su propia especie junto con los Forerunner y humanos que ya había logrado convertir, los Prometeos, como sus guardianes.
8 meses después, la UNSC crea un nuevo grupo de spartans conocido como Equipo Osiris, conformado por Tanaka, Vale, Buck y Locke.
El equipo Osiris es llevado por las espadas hasta Sanghelios y ayudan al Inquisidor quien se encontraba en medio de un ataque covenant para darle caza, el Inquisidor es rescatado y llevado de vuelta hasta su campamento.
Antes de escapar, el equipo Osiris los rescata, pero los Guardians crean pulsos electromagnéticos que sumen a la Tierra y demás colonias en la oscuridad.
[14][15] Una expansión independiente, titulado Halo 1 Custom Edition, fue lanzada como una exclusiva de Microsoft Windows, y permitía a los jugadores crear contenido personalizado para el juego.
Sin embargo, su verdadera misión (la cual solo conoce realmente la oficial de la ONI Verónica Dare) es recuperar un importante "recurso", un ingeniero Covenant que podría ayudar a ganar la guerra.
El escuadrón queda disperso y debe reencontrarse para poder escapar con vida de la situada ciudad.
El juego gira en torno a una página web creada por 42 Entertainment, encargado por Microsoft y respaldada por Bungie.
Con un entrenamiento especial durante su niñez y un aumento con químicos y partes robóticas se creó una raza de supersoldados o Spartan, cuya finalidad era suprimir levantamientos rebeldes en una futura guerra civil; debido a la guerra contra el Covenant que comenzó en el año 2525 los Spartans fueron enviados a combatir mostrando superioridad a los soldados normales e incluso contra los élites del Covenant (Sangheili).
Pasando las décadas y muchos mundos cristalizados, perdida tras perdida, la UNSC se dio cuenta de que no tardaría la raza humana en extinguirse; la ONI pone en acción un plan utilizando el The Pillar of Autumn o El Pillar of Autumn, (comúnmente conocido como UNSC Pillar of Autumn), (En español Pilar del otoño), Finalmente la guerra es llevada a Reach en el año 2552, durante su caída la mayoría de los Spartans se pierden y en acción el Jefe Maestro escapa del planeta a bordo The Pillar of Autumn dando inicio al videojuego Halo 1 Combat Evolved y a la otra novela Halo The Flood.
Allí conoce a los humanos Chakas y Alzador, que serán sus guías durante el viaje.
Para la banda sonora de Halo 2, producido por Nile Rodgers y O'Donnell, deciden partir en dos volúmenes la música.
En los instantes finales aparece un Tarkov ya maduro, velando con su equipo por la muerte de un compañero, justo cuando se comienzan a escuchar disparos.
En los últimos minutos se puede verle frente a su traje con su nombre grabado en él: "Carter S-259".
Remember Reach (Deliver Hope) combina imagen real y fue creado exclusivamente para el lanzamiento de Halo: Reach muestra a Kat llevando un Dispositivo Destructivo de Fusión Medio (MFDD por sus siglas en inglés) para destruir un supertransporte Covenant.
En principio, era una película en desarrollo de tipo ciencia ficción, escrita por Alex Garland[29] dirigida por Neill Blomkamp,[30] y producida por Peter Jackson.
[cita requerida] Halo Nightfall, o simplemente conocido como Nightfall, Durante el E3 2014, Microsoft y 343 Industries anunciaron el desarrollo de una miniserie de Halo, la cual llevaría por nombre Halo: Nightfall y su historia estaría situada durante parte de la historia del inicio del agente Locke ya perteneciente a la ONI, estaría disponible en Xbox Live y vendría incluida en la edición especial Halo: Master Chief Collection la cual fue lanzada el 11 de noviembre del 2014.