[6][7][8] Esto provocaría que su participación en la selección se vuelva más interrumpida, disputando la Copa América 2007 y el Mundial de Sudáfrica 2010 para su posterior retiro del seleccionado.
De regreso en la máxima categoría, y con unos pocos partidos jugados durante el Torneo Apertura 1995 con Estudiantes, fue transferido a Boca Juniors por una cifra cercana a los 3 millones de dólares, club en el cual jugó 17 partidos y convirtió 4 goles, uno de ellos a Estudiantes en La Bombonera, en 1996.
Tras su paso por Boca, lo contrató Sampdoria de Italia, donde permaneció hasta 1998, cuando fue incorporado por Parma F.C., formando uno de los mejores equipos de esos años junto a jugadores como Fabio Cannavaro, Lilian Thuram, Hernán Crespo, Enrico Chiesa, Faustino Asprilla y Gianluigi Buffon.
Lazio, con Sven-Göran Eriksson, lo incorporó para disputar la temporada 1999/00 y formó un grupo con varios futbolistas argentinos destacados como Hernán Crespo, Claudio López, Roberto Sensini y Diego Simeone.
En su segundo año en esta institución, logró ganar la Premier League 2002/03, antes de ser incorporado por Chelsea FC.
Su primer partido oficial fue ante Quilmes Atlético Club, como visitante, en el comienzo del Torneo Apertura 2006, con triunfo por 1-0.
Durante este campeonato, Estudiantes venció a su clásico rival, Gimnasia y Esgrima La Plata, por 7-0, con la particularidad de haber sido el primer clásico platense que jugaba Verón en su carrera, sumó una serie de diez victorias consecutivas y se consagró campeón al derrotar a Boca Juniors en la final de desempate jugada en el Estadio Amalfitani, por 2-1.
Luego, Estudiantes perdería la final del Mundial de Clubes 2009 frente al FC Barcelona, instancia que Verón disputó por primera y única vez en su carrera.
En el mercado de pases previo, había renovado el contrato que lo unía con Estudiantes, prolongando el vínculo por una nueva temporada, pero reduciendo el importe del mismo en un 45%.
No obstante, luego Verón prolongó su etapa futbolística hasta el final del Campeonato de Primera División 2013/14.
Con Diego Armando Maradona como entrenador, Verón participó de las Eliminatorias Sudamericanas para Sudáfrica 2010 y, tras ocho años, volvió a la máxima competencia de fútbol de selecciones, formando parte del equipo titular en los partidos contra Nigeria y Grecia.
[20] Actuando casi siempre en un rol libre por el centro del campo, también podía adelantarse y anotar goles con su potente pegada.
[22][23][24][25] También era un excelente ejecutador de pelota parada, conocido por sus potentes tiros libres con comba.
Verón nombró a Carlos Bilardo, Marcelo Bielsa, y Sven-Göran Eriksson como los principales entrenadores que más lo influyeron en su carrera.