Los nuevos participantes fueron los dos equipos ascendidos de la Primera B Nacional 2007-08: Godoy Cruz de Mendoza, que volvió a Primera División tras un solo año en la segunda categoría; y San Martín de Tucumán, que regresó al campeonato luego de quince temporadas, tras un gran desempeño en las campañas previas que le valieron cuatro ascensos en cuatro años.
Al terminar la primera fase del certamen, se definieron tres equipos clasificados a la Copa Libertadores 2009: el campeón del torneo y los dos mejor ubicados en la tabla de promedios del Apertura 2007, el Clausura 2008 y el Apertura 2008.
Por otra parte, se produjeron dos descensos por el sistema de promedios a la Primera B Nacional, y se determinaron además a los dos equipos que disputaron la promoción.
Cada fase del campeonato fue un torneo independiente, llamados respectivamente Apertura y Clausura.
El cupo restante, que clasificó a la primera fase, fue para el segundo mejor ubicado de esta tabla.