La historia de Pakistan International Airlines se remonta a la época en la que Pakistán aún no era una nación.
Para ello, buscó el apoyo de un industrial experimentado, llamado Mirza Ahmad Ispahani.
Este fue el primer vuelo de una aerolínea registrada del Asia Meridional en la posguerra.
En 1956 PIA ordenó dos aeronaves Super Lockheed Constellation y cinco Vickers Viscount.
Durante 1962, los servicios a Pakistán Oriental (actual Bangladés) resultaron ser dificultosos, razón por la cual PIA realizó el pedido de los helicópteros Sikorsky S-61 con el objetivo de cubrir esas rutas hasta 1966, cuando las condiciones mejoraron.
En 1964 nuevamente PIA hizo historia al convertirse en la primera aerolínea de un país no comunista en volar a la República Popular China.
Cuando comenzó la Guerra Indo-Pakistaní de 1965, PIA apoyó a las fuerzas pakistaníes con logística y transporte.
Sin embargo, estos fueron posteriormente vendidos a CAAC, la aerolínea de la China comunista.
En 1985 la atracción turística PIA Planetarium fue inaugurada en Karachi y luego en Lahore, esta última con una exposición de un Boeing 707 abierta para el público en general.
En 1989, las primeras pilotos empezaron a comandar vuelos comerciales de pasajeros.
En 1996 la aerolínea alquiló una aeronave Túpolev Tu-154, y reinauguró servicios al Aeropuerto Internacional de Beirut en el Líbano.
Sin embargo, PIA únicamente utilizó el Tupolev Tu-154 por un período corto para afrontar la demanda adicional durante el verano de 1996.En 1999 la aerolínea alquiló cinco aeronaves Boeing 747-300 de Cathay Pacific para reemplazar sus viejos Boeing 747-200.
PIA fue el primer comprador y así revivió el proyecto Boeing 777-200LR, que hasta entonces, sólo tenía pedidos por tres unidades, ordenados por EVA Air.
PIA ha dicho que quizá adquiera tres 777-200LR adicionales para utilizarlos en sus rutas a Norteamérica.
PIA se convirtió en el cliente que lanzó el B777-200LR cuando ordenó la familia de aeronaves Boeing 777.