El PRC (A) ganó las elecciones presidenciales en dos ocasiones: Ramón Grau San Martín (1944-1948) y Carlos Prío Socarrás (1948-1952).
Sus miembros también introdujeron una medida en la Convención Constituyente del 1940 para que el senado fuese constituido por los líderes sindicales y los empresarios.
Inmediatamente después de ser destituido, Ramón Grau San Martín y otros líderes políticos, como Carlos Prío, fundaron el Partido Revolucionario Cubano (Auténtico), inspirándose en el Partido Revolucionario Cubano fundado por José Martí en 1892 para luchar por la independencia de Cuba.
Durante este período, el senador y seguidor de Grau, Eduardo Chibás, se separó del PRC (A) denunciando la corrupción de en sus dirigentes y fundando el Partido Ortodoxo en 1947.
En ambos casos denunció fraude electoral por parte del gobierno de Fulgencio Batista.