En la segunda mitad del 2008 regresó al Perú para jugar algunos meses por Sporting Cristal.
Luego de hacer las divisiones menores en la Academia Tito Drago, Cruzado se integra a Alianza Lima; no obstante, para ganar experiencia y minutos de juego, en 2001 el club blanquiazul decide prestarlo a Bella Esperanza, que militaba en la Segunda División y que funcionaba como filial de los íntimos.
Apenas con 16 años marcó su primer gol como profesional: fue el 26 de agosto en la derrota por 1-4 ante Unión Huaral.
Sin embargo, Alianza fue eliminado en esta fase, ya que sólo logró terminar en 3ª posición.
Cruzado hizo más apariciones en la temporada siguiente de con Alianza en todo su tiempo allí, con 42 partidos jugados y anotó 3 goles.
Cruzado jugó un papel importante en las finales que determinó a los campeones de la temporada 2006.
En enero de 2007, dejó Alianza Lima y trasladado a equipo suizo Grasshopper Club Zürich.
[3] Jugó la Copa intertoto de la UEFA 2008 en el cual fue campeón, aquí fue compañero del paraguayo Raúl Bobadilla.
Tenía una herida muy grave en su primera temporada que el mejor jugador, pocos acta para el club, pero en su segunda temporada estaba disponible para más partidos y se convirtió en uno de los jugadores regulares de partida.
Dejó Irán buscan regresar a un club peruano, posiblemente Alianza Lima, en 2010.
En la fecha 9 se enfrentó Alianza Lima que era uno de sus competidores directos hacia el título, Cruzado ayudó a derrotar a su exequipo 2-0[10] y dos partidos más tarde el ciclón ganó otros tres valiosos puntos con una victoria en casa por 2-1 ante su ex club que Sporting Cristal.
Cruzado marcó su último gol con Juan Aurich en la fecha 12 en la derrota por 2-1 frente a Cienciano.
Juan Aurich eventualmente pasaría a ganar el título de la temporada por primera vez en la historia del club.
Cruzado fue convocado para participar en la Copa América, y durante este tiempo el periodista Daniel Peredo anunció por primera vez la noticia de que Cruzado se uniría el club italiano Chievo Verona después del torneo de verano.
Firmó un contrato de tres años y optó por llevar la camisa número ocho según lo informado por el sitio web oficial del Chievo.
[15] En febrero del 2013 Rinaldo Cruzado firmó por Newell's Old Boys de Rosario hasta el 2014.
[16] Rinaldo Cruzado, ex-Chievo, ya entrenó con el Newell's Old Boys de Argentina.