Es el segundo equipo que ha representado al cantón central en el Campeonato Nacional de la Primera División, junto con el Municipal Puntarenas.
Ya para el Torneo de Invierno 2009, asume la Presidencia la señora Alejandra Ordóñez y bajo su mandato vuelven los logros al equipo chuchequero.
En esa final el equipo porteño en los dos juegos fue muy superior en la cancha pero en casa el miércoles 23 de diciembre no pudo anotar y el lunes 28 de diciembre en casa de Brujas FC aunque anotó primero vino en el segundo tiempo el empate y al llegar a los lanzamientos del punto de penal fue más certero el Brujas FC y el equipo chuchequero sumó su segundo subcampeonato en su corta historia en el fútbol nacional en esta ocasión dirigidos por el técnico colombiano Carlos Restrepo.
Para la temporada de verano 2010 y dirigidos por el uruguayo Jorge González, el equipo porteño por segunda temporada consecutiva logra pasar a cuartos de final pero se queda en el camino en su serie ante Liga Deportiva Alajuelense.
El PFC disputó el último partido en Primera División ante Limón FC en el cual igualaron 1 x 1, el equipo caribeño también estaba comprometido con el descenso, pero tenía tres puntos más que Puntarenas.
Con esto se coronó monarca de Ascenso y vuelve a la Primera División tras su descenso en 2014.