Disputó la final del Torneo Apertura 2015 contra Antigua GFC, quien dejó en el camino al hasta entonces hexacampeón nacional Comunicaciones Fútbol Club.
En la final de ida disputada en el Estadio David Cordón Hichos, obtuvo el triunfo el Deportivo Guastatoya con un 2 - 1 y en la de vuelta, en el Estadio Pensativo se impuso Antigua GFC 2 - 0 resultado con el cual el equipo colonial se coronó campeón nacional por primera vez.
Primer Título (Torneo Clausura 2018) Para el Torneo Clausura 2018, derrota al Xelajú Mario Camposeco 3-1 y con ese resultado se coronó campeón por primera vez en su historia, convirtiendo a Amarini Villatoro en el séptimo técnico guatemalteco en coronarse campeón de liga.
Segundo Título (Torneo Apertura 2018) En el Torneo Apertura 2018 se clasificó a fase semifinal de manera directa al terminar en primer lugar la clasificación, obteniendo así el boleto directo a semifinales.
El tico Aarón Navarro adelantó al conjunto "Pecho Amarillo" a los 72 minutos de juego, así mismo se convirtió en el primer jugador del Deportivo Guastatoya en meter un gol en instancias internacionales.
Gracias al "Bicampeonato" que consiguieron en el 2018 les permitió participar para la 3.ª edición de la Liga Concacaf 2019.
Los octavos de final se jugaron a ida y vuelta en el Doroteo Guamuch Flores.
Wiliam Coito Oscar Corrales Ricardo Bracamonte Leonardo Moscoso Dennis Williams Edgar Forbes