El club aguacatero fue fundado en 1958 por Miguel Ángel Soto Bustamante y Antonio Martínez Barrios de la ciudad Colonial.
Después de obtener el ascenso a la máxima división (Liga Mayor "A") en la temporada 1957/58, Antigua, que terminó tercero en la tabla de la liga 1959/60, pero no pudo mantener su nivel en los años siguientes, sufriendo el descenso después del 1964 temporada.
Alienación para el partido final 33 Víctor Ayala (portero) 3 Osiel Rivera 6 José Carlos Pinto 44 Akeem Priestley (Jamaica) 10 Manfred Russell 32 Alexander Robinson (CR) 24 Roberto Carlo Peña 15 Fredy Thompson (cap) 20 Víctor Alexis Marta 27 Alejandro Díaz (Arg) 9 Oscar Isaula DT Mauricio Tapia Sustituciones Allen Yánez 13’ Edgar Chinchilla 72’ Gerardo Gordilll 85’ Goles Oscar Isaula 19’ Edgar Chinchilla 72’ Antigua GFC se clasificó directamente a la semifinal del Torneo Apertura 2016 de la Liga Nacional de Fútbol de Guatemala, finalizando segundo en la clasificación general con 41 puntos, por delante de Comunicaciones quienes fueron terceros con 39 puntos y detrás de Municipal quienes clasificaron como primeros en la tabla con 44 puntos.
Por Antigua GFC los lanzadores de los primeros 5 penales fueron: Fredy Thompson, Manfred Russell, Alejandro Galindo, Mauro Portillo y Kendel Herrarte; este último no pudo concretar el lanzamiento que le daría el campeonato a Antigua GFC, por lo cual se tuvo que recurrir a la muerte súbita.
Solamente bastó agregar un penal más ya que Víctor Bolívar atajó el primer lanzamiento de Municipal y el colombiano Hugo Acosta sentenció el triunfo para Antigua GFC, mandando el balón al fondo de la red.
En la reanudación, Antigua volvió a hacer la diferencia, esta vez por medio del delantero argentino, Alejandro Díaz, quien marcó el 2-1 al minuto ´52.
La necesidad hizo que los ediles fueran al frente pero en el fondo la defensiva colonial se mantuvo hasta el final para lograr el título.
Luego, tomaron la palabra el mexicano Agustín Herrera, Alejandro "Gambetita" Díaz, el habilidoso José Manuel "Moyo" Contreras y varios jugadores más.
Adrián De Lemos, el portero menos vencido del torneo, también dedicó algunas palabras a la afición panza verde.
La Final se jugó entre Deportivo Malacateco y Antigua GFC, el partido de ida se disputó en el Estadio Santa Lucía y con un único gol de Alejandro Galindo el equipo colonial logró la victoria por 0-1.
Agustín Herrera, Pablo Aguilar y las jugadas a balón parado de José Manuel Contreras, llevaron peligro sobre la portería de Manuel Sosa, pero no se concretó la anotación en la primera mitad.
Tras el pitazo final, los Aguacateros celebraron en el centro del campo con la afición que se quedó presente en los graderíos, a la espera de llegar a la plaza central de Antigua Guatemala para compartir con sus seguidores su nuevo título.
El partido comenzó con un gol de José Ardón, el cual fue igualado en el marcador por René Leslie.
Los coloniales empezaron perdiendo tras un error defensivo del arquero Morán, que fue aprovechado por Martín Ruiz para colocar el 0-1 a favor de la visita.
En el segundo tiempo, Santiago Gómez aprovechó un error del arquero visitante para colocar el empate en el marcador de cabeza.
Sin embargo, solo cinco minutos después, Santiago Gómez marcó el 1-1 tras aprovechar un buen centro de Romario.
En la vuelta, disputada en el Estadio Ricardo Saprissa, Antigua se adelantó rápidamente con un gol de Santiago Gómez tras un error defensivo.