Tras su graduación, mantuvo un cargo en el Seminario Teológico Patriarcal de Halki, donde fue ordenado sacerdote.
Sus esfuerzos por promover la libertad de culto y los derechos humanos, sus iniciativas para avanzar la tolerancia religiosa entre las religiones del mundo, así como sus esfuerzo por promover la ecología y la protección del medio ambiente, han sido ampliamente conocidas y tales esfuerzos le han ganado el título de «El Patriarca verde».
[21][22] Entre sus muchas posiciones internacionales, es actualmente parte del Panel de Líderes Religiosos Mundiales para el Elijah Interfaith Institute.
En 1969 fue ordenado sacerdote y poco después el patriarca Atenágoras I lo elevó al rango de archimandrita.
Conoce numerosas lenguas, a saber, griego, turco, latín, italiano, inglés, francés y alemán.
Durante el viaje del papa Francisco a Tierra Santa, el pontífice planificó reunirse en cuatro oportunidades con Bartolomé I, incluyendo en una oración pública y conjunta en el Santo Sepulcro, lugar sagrado para el cristianismo.